268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0369 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_0359  filamentation induced by cAMP protein Fic  97.07 
 
 		 375 aa  740    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0369  filamentation induced by cAMP protein Fic  100 
 
 		 371 aa  761    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000333205 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0367  hypothetical protein  93.53 
 
 		 371 aa  716    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0336  filamentation induced by cAMP protein Fic  94.07 
 
 		 371 aa  719    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134655  normal  0.368234 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0366  filamentation induced by cAMP protein Fic  94.93 
 
 		 375 aa  711    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3804  filamentation induced by cAMP protein Fic  93.26 
 
 		 371 aa  717    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.539894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3625  filamentation induced by cAMP protein Fic  95.15 
 
 		 371 aa  729    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0361  filamentation induced by cAMP protein Fic  98.92 
 
 		 371 aa  753    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4506  filamentation induced by cAMP protein Fic  73.44 
 
 		 365 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000280664 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4924  filamentation induced by cAMP protein Fic  72.65 
 
 		 369 aa  558  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000928256 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3843  filamentation induced by cAMP protein Fic  69.81 
 
 		 368 aa  522  1e-147  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3619  filamentation induced by cAMP protein Fic  57.07 
 
 		 376 aa  411  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0823  Fic family protein  57.07 
 
 		 389 aa  410  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3490  Fic family protein  56.79 
 
 		 376 aa  409  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5004  filamentation induced by cAMP protein Fic  55.01 
 
 		 381 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0677  hypothetical protein  54.2 
 
 		 373 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00227082  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07450  hypothetical protein  53.93 
 
 		 373 aa  391  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000039973  normal  0.18978 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42040  hypothetical protein  52.85 
 
 		 386 aa  389  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4817  filamentation induced by cAMP protein Fic  53.1 
 
 		 379 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4664  filamentation induced by cAMP protein Fic  50.68 
 
 		 376 aa  381  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.433809  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0523  Fic family protein  51.49 
 
 		 376 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3792  hypothetical protein  44.99 
 
 		 365 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3312  hypothetical protein  44.77 
 
 		 376 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00970462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2357  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.85 
 
 		 371 aa  302  5.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4648  hypothetical protein  44.29 
 
 		 384 aa  300  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00489554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0368  filamentation induced by cAMP protein Fic  96.03 
 
 		 151 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.25447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0980  hypothetical protein  41.62 
 
 		 367 aa  298  2e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0812833  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5763  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.55 
 
 		 374 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6128  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.55 
 
 		 374 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6610  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.66 
 
 		 374 aa  295  7e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.578306 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1441  hypothetical protein  43.43 
 
 		 367 aa  295  8e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4758  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.01 
 
 		 373 aa  293  3e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.179333 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1366  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.59 
 
 		 371 aa  293  4e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3413  hypothetical protein  41.73 
 
 		 371 aa  290  3e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1182  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.3 
 
 		 374 aa  290  3e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2616  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.19 
 
 		 368 aa  289  5.0000000000000004e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3067  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.13 
 
 		 374 aa  288  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1770  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.19 
 
 		 370 aa  286  2.9999999999999996e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.385293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4935  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.66 
 
 		 373 aa  286  5e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.684685  normal  0.113714 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7631  filamentation induced by cAMP protein, Fic  42.54 
 
 		 386 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.223579 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0887  Fic family protein  40.91 
 
 		 378 aa  282  8.000000000000001e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1095  filamentation induced by cAMP protein (Fic) family protein  42.03 
 
 		 374 aa  281  2e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.298399  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1129  Fic family protein  40.91 
 
 		 378 aa  281  2e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0823  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.87 
 
 		 374 aa  279  5e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4586  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.6 
 
 		 372 aa  276  5e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2002  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.1 
 
 		 375 aa  263  3e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.733317  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0723  filamentation induced by cAMP protein Fic  41.85 
 
 		 373 aa  261  2e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.43274  hitchhiker  0.00000454462 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0227  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.8 
 
 		 376 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424748  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3069  filamentation induced by cAMP protein Fic  40.52 
 
 		 309 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5385  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.8 
 
 		 370 aa  225  7e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3980  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.25 
 
 		 408 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.231273 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1773  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.75 
 
 		 318 aa  214  2.9999999999999995e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0104845 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5477  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.58 
 
 		 367 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7373  hypothetical protein  34.95 
 
 		 368 aa  201  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.269183  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2315  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.51 
 
 		 376 aa  201  9.999999999999999e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.655269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4031  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.38 
 
 		 372 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3755  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.38 
 
 		 372 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0523363  normal  0.297865 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3922  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.41 
 
 		 379 aa  200  3.9999999999999996e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.393872  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3797  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.37 
 
 		 371 aa  198  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117208 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2127  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.8 
 
 		 367 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.296141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0591  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.44 
 
 		 373 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4231  hypothetical protein  34.14 
 
 		 364 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.758484 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1091  hypothetical protein  30.56 
 
 		 369 aa  163  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6016  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.26 
 
 		 343 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4776  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.6 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199218  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4024  hypothetical protein  34.87 
 
 		 156 aa  83.6  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2152  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.3 
 
 		 374 aa  78.2  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164511  normal  0.297035 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4190  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.74 
 
 		 367 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1635  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.21 
 
 		 326 aa  73.9  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1972  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.63 
 
 		 349 aa  72.4  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.335925  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2299  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.42 
 
 		 361 aa  72.8  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2174  Fic family protein  25 
 
 		 348 aa  70.9  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2207  hypothetical protein  25 
 
 		 348 aa  70.9  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000284697  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0294  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.31 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24620  hypothetical protein  27.36 
 
 		 346 aa  65.9  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.996918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0190  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.8 
 
 		 384 aa  65.1  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2308  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.84 
 
 		 349 aa  65.1  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4167  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.03 
 
 		 351 aa  65.5  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.120401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0565  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.02 
 
 		 358 aa  65.1  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0018431  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0233  fic family protein  26.02 
 
 		 377 aa  64.7  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.638848  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0365  Fic family protein  24.4 
 
 		 348 aa  64.3  0.000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1889  filamentation induced by cAMP protein Fic  23.39 
 
 		 454 aa  63.9  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0817  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.62 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0673  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.6 
 
 		 398 aa  62.8  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.974543  normal  0.0892383 
 
 
-
 
NC_002978  WD0346  Fic family protein  33.02 
 
 		 360 aa  62.4  0.00000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.361104  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0937  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.91 
 
 		 368 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1551  hypothetical protein  26.46 
 
 		 314 aa  62.4  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0909  hypothetical protein  24.14 
 
 		 328 aa  62  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1314  Fic family protein  26.89 
 
 		 359 aa  61.6  0.00000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.148349  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0831  AsnC family regulatory protein  29.23 
 
 		 349 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000889639  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5696  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.89 
 
 		 358 aa  60.5  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00196433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2358  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.82 
 
 		 371 aa  60.1  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0095  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.09 
 
 		 429 aa  59.7  0.00000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0995  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.71 
 
 		 386 aa  59.3  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0390266  hitchhiker  0.00286673 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6451  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.16 
 
 		 378 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0184045 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2057  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.19 
 
 		 377 aa  58.9  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4148  filamentation induced by cAMP protein Fic  24.64 
 
 		 359 aa  58.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0216  hypothetical protein  24.02 
 
 		 373 aa  58.5  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0903  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.06 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000226959 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0970  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.73 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.952557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>