More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2448 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2448  major facilitator transporter  100 
 
 		 409 aa  802    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.581947  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1666  major facilitator transporter  74.26 
 
 		 411 aa  613  9.999999999999999e-175  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.493096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03865  hexuranate transporter  42.54 
 
 		 433 aa  313  2.9999999999999996e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3510  major facilitator transporter  39.75 
 
 		 427 aa  293  4e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.935373  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2718  major facilitator transporter  40.49 
 
 		 430 aa  291  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4070  major facilitator transporter  40.49 
 
 		 430 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3451  major facilitator transporter  40.49 
 
 		 430 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1244  major facilitator superfamily MFS_1  38.31 
 
 		 439 aa  288  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477377  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5234  major facilitator transporter  40.74 
 
 		 430 aa  282  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3400  major facilitator transporter  40.74 
 
 		 430 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5749  major facilitator superfamily MFS_1  38.2 
 
 		 436 aa  278  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1766  major facilitator transporter  38.15 
 
 		 424 aa  277  3e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601014  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2843  major facilitator superfamily MFS_1  36.98 
 
 		 426 aa  276  6e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.088157  normal  0.111913 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5166  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 429 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.733081 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5675  major facilitator transporter  39.18 
 
 		 429 aa  272  9e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3116  major facilitator superfamily MFS_1  35.61 
 
 		 430 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000115925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4307  major facilitator transporter  36.91 
 
 		 430 aa  263  4e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0404  major facilitator superfamily MFS_1  34.71 
 
 		 432 aa  262  6.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.90763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6829  major facilitator superfamily MFS_1  35.32 
 
 		 454 aa  262  8.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1023  major facilitator superfamily MFS_1  35.11 
 
 		 431 aa  258  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0652623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2219  major facilitator superfamily MFS_1  37.19 
 
 		 441 aa  256  5e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.200056 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3045  major facilitator transporter  35.63 
 
 		 435 aa  239  8e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1017  major facilitator superfamily MFS_1  34.38 
 
 		 431 aa  238  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.451459  normal  0.743333 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3956  major facilitator superfamily MFS_1  34.06 
 
 		 449 aa  237  4e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621866  normal  0.612872 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4271  major facilitator transporter  34.68 
 
 		 468 aa  233  7.000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0659968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5030  major facilitator transporter  33.83 
 
 		 441 aa  232  8.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.580497  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6282  major facilitator superfamily MFS_1  34.9 
 
 		 429 aa  231  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4907  major facilitator transporter  31.74 
 
 		 445 aa  229  7e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6194  major facilitator superfamily MFS_1  33.57 
 
 		 453 aa  228  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3239  major facilitator transporter  32.17 
 
 		 441 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.935103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02990  putative MFS transporter  32.07 
 
 		 441 aa  223  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105539 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0325  MFS family transporter  32.84 
 
 		 442 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.334434  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51130  MFS (major facilitator superfamily) transporter  32.34 
 
 		 439 aa  223  4e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.845287  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3121  major facilitator transporter  31.93 
 
 		 441 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2604  major facilitator family transporter  31.93 
 
 		 480 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0399959 
 
 
-
 
NC_003296  RS02062  putative transporter transmembrane protein  34 
 
 		 441 aa  222  9e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000104941  normal  0.781434 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2129  major facilitator transporter  32.09 
 
 		 442 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.526702  normal  0.377982 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4288  major facilitator transporter  35.05 
 
 		 457 aa  217  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2345  transporter, putative  31.59 
 
 		 439 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1058  major facilitator superfamily MFS_1  34.15 
 
 		 449 aa  214  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.494018  normal  0.557281 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3179  major facilitator transporter  31.19 
 
 		 432 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4873  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 501 aa  202  7e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103797  normal  0.996153 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2920  major facilitator superfamily MFS_1  35.98 
 
 		 448 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.43898  normal  0.655639 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3106  major facilitator transporter  32.27 
 
 		 428 aa  188  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2272  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 		 479 aa  187  4e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.972023  decreased coverage  0.00181869 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4265  major facilitator transporter  27.9 
 
 		 489 aa  182  7e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.762522  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0947  major facilitator superfamily MFS_1  28.96 
 
 		 430 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.35328  normal  0.0858315 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1012  major facilitator superfamily MFS_1  28.71 
 
 		 430 aa  167  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2910  major facilitator transporter  32.14 
 
 		 441 aa  167  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04071  Hexuronate transporter  27.68 
 
 		 425 aa  164  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04033  hypothetical protein  27.68 
 
 		 425 aa  164  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2068  major facilitator superfamily MFS_1  30.58 
 
 		 434 aa  160  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3282  putative hexuronate transporter  28.1 
 
 		 424 aa  160  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0854544  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3128  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 435 aa  160  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 428 aa  158  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1871  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 423 aa  157  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00153919  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4383  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 		 420 aa  156  8e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00326845  normal  0.997814 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 436 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4207  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 423 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0961062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4159  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 423 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.718979  decreased coverage  0.00263409 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4048  major facilitator transporter  28.76 
 
 		 423 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0187179  normal  0.633628 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 436 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 436 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3566  major facilitator transporter  28.76 
 
 		 443 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000684429  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 436 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 436 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1170  major facilitator superfamily MFS_1  32.13 
 
 		 425 aa  151  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0610  major facilitator transporter  28.31 
 
 		 430 aa  149  9e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400877  normal  0.0253848 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11473  putative hexuronate transport protein (MFS family)  26.86 
 
 		 424 aa  149  9e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.485615  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1080  putative hexuronate transporter transmembrane protein  27.61 
 
 		 432 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.503694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0258  major facilitator transporter  29.03 
 
 		 440 aa  148  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0935  major facilitator transporter  28.43 
 
 		 427 aa  146  7.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.881993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0456  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 		 415 aa  145  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3357  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 423 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0473601  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2651  major facilitator family transporter  28 
 
 		 447 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3386  hexuronate transporter  27.51 
 
 		 434 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.333246  normal  0.392835 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3380  hexuronate transporter  27.51 
 
 		 434 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.586322  normal  0.6284 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3670  major facilitator transporter  27.94 
 
 		 411 aa  140  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3316  hexuronate transporter  27.51 
 
 		 434 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.433687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3306  hexuronate transporter  27.51 
 
 		 434 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123622  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3479  hexuronate transporter  27.51 
 
 		 434 aa  140  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3529  hexuronate transporter  26.29 
 
 		 432 aa  139  7.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02962  hexuronate transporter  26.29 
 
 		 472 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3154  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 447 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3561  putative hexuronate transporter  26.29 
 
 		 432 aa  139  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02913  hypothetical protein  26.29 
 
 		 472 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2158  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 447 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3658  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 432 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4247  major facilitator transporter  26.01 
 
 		 429 aa  137  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  30.1 
 
 		 443 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0745  d-galactonate transporter  24.55 
 
 		 433 aa  134  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0608  d-galactonate transporter  26.29 
 
 		 432 aa  133  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4408  hexuronate transporter  26.29 
 
 		 432 aa  133  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.591703 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3276  putative hexuronate transporter  26.29 
 
 		 432 aa  133  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0607  d-galactonate transporter  26.29 
 
 		 432 aa  133  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3385  hexuronate transporter  26.29 
 
 		 432 aa  133  6e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0528  d-galactonate transporter  24.55 
 
 		 433 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.888492  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  27.22 
 
 		 432 aa  129  7.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0834  hexuronate transporter transmembrane protein  26.17 
 
 		 435 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00560856 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3547  d-galactonate transporter  25.71 
 
 		 474 aa  129  7.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.48586 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>