52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3975 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3975  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 583 aa  1151    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.734666  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3594  von Willebrand factor, type A  83.88 
 
 		 576 aa  916    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1261  von Willebrand factor type A  33.44 
 
 		 814 aa  270  4e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.361472  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2672  extracellular solute-binding protein family 1  32.31 
 
 		 599 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.456876  normal  0.172094 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4679  von Willebrand factor type A  32.3 
 
 		 515 aa  233  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2266  von Willebrand factor, type A  32.79 
 
 		 596 aa  228  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0567  von Willebrand factor type A  32.71 
 
 		 587 aa  228  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1270  von Willebrand factor type A  33.39 
 
 		 593 aa  227  5.0000000000000005e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.432707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4775  von Willebrand factor type A  32.39 
 
 		 615 aa  220  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7651  hypothetical protein  32.32 
 
 		 560 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0568  von Willebrand factor type A  31.63 
 
 		 588 aa  211  4e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  30.68 
 
 		 607 aa  210  5e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2023  von Willebrand factor type A  32.57 
 
 		 586 aa  210  7e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000927527  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5348  von Willebrand factor type A  32.69 
 
 		 583 aa  207  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.698925 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7319  von Willebrand factor type A  31.64 
 
 		 608 aa  198  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.505027 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0312  von Willebrand factor type A  29.06 
 
 		 564 aa  197  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0747  hypothetical protein  27.17 
 
 		 587 aa  186  8e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222622  normal  0.398394 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2441  von Willebrand factor, type A  28.4 
 
 		 609 aa  183  7e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1863  von Willebrand factor type A  28.45 
 
 		 583 aa  177  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00271948  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1377  hypothetical protein  27.11 
 
 		 584 aa  176  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1513  hypothetical protein  28.36 
 
 		 605 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00594342 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0463  von Willebrand factor type A  29.32 
 
 		 547 aa  162  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3957  von Willebrand factor type A  27.11 
 
 		 618 aa  156  9e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.136708 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1514  hypothetical protein  28.06 
 
 		 594 aa  153  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283414  hitchhiker  0.00571716 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1527  von Willebrand factor type A  26.81 
 
 		 601 aa  150  5e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0818776  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0327  von Willebrand factor, type A  28.41 
 
 		 655 aa  137  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3738  von Willebrand factor type A  26.61 
 
 		 609 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.105397 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1289  von Willebrand factor type A  35.41 
 
 		 594 aa  119  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0945  von Willebrand factor type A  24.14 
 
 		 647 aa  97.1  9e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.651273 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3360  von Willebrand factor type A  32.67 
 
 		 527 aa  96.3  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.354576  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  26.87 
 
 		 562 aa  95.5  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  24.36 
 
 		 543 aa  96.3  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5347  von Willebrand factor type A  28.29 
 
 		 596 aa  95.1  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.23692  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  24.41 
 
 		 547 aa  94  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  26.29 
 
 		 561 aa  87.8  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1116  von Willebrand factor type A  24.69 
 
 		 562 aa  85.1  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4074  hypothetical protein  26.42 
 
 		 355 aa  82.4  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3163  von Willebrand factor type A  22.22 
 
 		 550 aa  82.8  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.181499  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  22.95 
 
 		 546 aa  80.1  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2484  von Willebrand factor type A  25.17 
 
 		 559 aa  67.8  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000228446  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2918  von Willebrand factor, type A  26.56 
 
 		 534 aa  67  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.306616 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6417  hypothetical protein  37.23 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3098  von Willebrand factor, type A  27.6 
 
 		 640 aa  63.5  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298521  normal  0.039864 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3644  von Willebrand factor type A  26.41 
 
 		 589 aa  60.5  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0759  von Willebrand factor type A  26.15 
 
 		 547 aa  58.2  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.09187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0766  von Willebrand factor type A  24.89 
 
 		 536 aa  57.8  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3225  von Willebrand factor, type A  27.01 
 
 		 477 aa  54.7  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3212  von Willebrand factor type A  25.81 
 
 		 514 aa  53.9  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0502803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11865  hypothetical protein  27.08 
 
 		 677 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.428067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3368  von Willebrand factor, type A  27.5 
 
 		 636 aa  50.8  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.893791 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  28.28 
 
 		 412 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  27.41 
 
 		 412 aa  46.2  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>