54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2288 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2288  hypothetical protein  100 
 
 
349 aa  716    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0959277  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1792  hypothetical protein  34.53 
 
 
310 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3373  hypothetical protein  35.74 
 
 
318 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1038  hypothetical protein  32.43 
 
 
321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0392627 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3908  hypothetical protein  35.46 
 
 
383 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409846  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1962  hypothetical protein  34.75 
 
 
341 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358047  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1790  hypothetical protein  33.45 
 
 
321 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0281  hypothetical protein  35.42 
 
 
319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0375  hypothetical protein  40.55 
 
 
220 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0620  hypothetical protein  32.74 
 
 
307 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8291  hypothetical protein  30.28 
 
 
371 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.928519  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0105  hypothetical protein  30.79 
 
 
327 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28020  hypothetical protein  34.03 
 
 
290 aa  115  8.999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.664539  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3627  hypothetical protein  30.79 
 
 
351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1963  hypothetical protein  31.29 
 
 
343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0834594  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8294  hypothetical protein  28.19 
 
 
392 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2011  hypothetical protein  31.43 
 
 
293 aa  114  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1145  hypothetical protein  36.32 
 
 
341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0243464  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4491  hypothetical protein  35.92 
 
 
359 aa  106  8e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1426  hypothetical protein  30.29 
 
 
349 aa  105  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.422406 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0745  hypothetical protein  30.33 
 
 
361 aa  102  7e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.112095  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2175  hypothetical protein  36.56 
 
 
362 aa  101  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8295  hypothetical protein  30.03 
 
 
354 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1091  hypothetical protein  29.93 
 
 
328 aa  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000000677339  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1169  hypothetical protein  32.61 
 
 
321 aa  100  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000105913 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0821  signal peptide  31.77 
 
 
372 aa  99.8  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.582134 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1142  hypothetical protein  28.89 
 
 
365 aa  96.3  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3153  hypothetical protein  31.22 
 
 
364 aa  94.7  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0905278  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4913  hypothetical protein  26.06 
 
 
390 aa  92.8  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2400  hypothetical protein  28.47 
 
 
318 aa  92  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000291714  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3154  hypothetical protein  31.05 
 
 
363 aa  89  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.146517  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3160  hypothetical protein  29.19 
 
 
365 aa  87  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.990636 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2895  hypothetical protein  31.15 
 
 
368 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2612  hypothetical protein  26.92 
 
 
352 aa  83.6  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00274782  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35990  hypothetical protein  28.83 
 
 
352 aa  81.3  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2897  hypothetical protein  32.02 
 
 
361 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.487441  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2898  hypothetical protein  25.73 
 
 
407 aa  77  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.213841  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7465  hypothetical protein  25.81 
 
 
369 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1350  hypothetical protein  29.57 
 
 
393 aa  74.3  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.172226 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4847  hypothetical protein  28.14 
 
 
411 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000422341  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8296  hypothetical protein  34.15 
 
 
506 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365652  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8293  hypothetical protein  28.57 
 
 
518 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7802  hypothetical protein  29.73 
 
 
365 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.807142 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2411  hypothetical protein  31.64 
 
 
408 aa  67  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5585  hypothetical protein  29.38 
 
 
299 aa  63.9  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.482525  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3164  hypothetical protein  29.12 
 
 
520 aa  62  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1691  hypothetical protein  44.59 
 
 
316 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.697338  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2290  hypothetical protein  26.17 
 
 
356 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0268  hypothetical protein  25.5 
 
 
297 aa  56.2  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1847  hypothetical protein  25.37 
 
 
402 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0778  hypothetical protein  25.27 
 
 
338 aa  47  0.0006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0691  putative extracellular serine protease  26.01 
 
 
311 aa  45.8  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.153044  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1010  putative extracellular serine protease  26.67 
 
 
301 aa  43.5  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4522  extracellular metalloprotease  25.24 
 
 
306 aa  42.7  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0902848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>