52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1908 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1908  sporulation related  100 
 
 		 467 aa  926    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.278011  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3063  tetratricopeptide TPR_4  34.27 
 
 		 440 aa  209  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0604  sporulation domain-containing protein  42.79 
 
 		 397 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0239  TPR repeat-containing protein  29.19 
 
 		 326 aa  62.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3581  tetratricopeptide TPR_4  34.73 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211804  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0729  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 		 268 aa  57  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2766  sporulation domain-containing protein  36.84 
 
 		 458 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.170586 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7038  hypothetical protein  32.67 
 
 		 309 aa  52.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.573891 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1913  sporulation domain-containing protein  28.36 
 
 		 277 aa  52.4  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4483  Tetratricopeptide TPR_4  36 
 
 		 278 aa  51.2  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1869  sporulation domain-containing protein  36.99 
 
 		 389 aa  51.2  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.646599  normal  0.945616 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4195  Tetratricopeptide TPR_4  36 
 
 		 278 aa  50.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1778  TPR repeat-containing protein  35.76 
 
 		 269 aa  50.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.822909  normal  0.123613 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2350  sporulation domain-containing protein  32.05 
 
 		 993 aa  50.4  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.17698  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1139  sporulation related  38.36 
 
 		 242 aa  50.1  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0290  hypothetical protein  35.29 
 
 		 262 aa  49.7  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.422068  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3588  Sporulation domain protein  34.21 
 
 		 474 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.903239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1587  sporulation domain-containing protein  36.36 
 
 		 328 aa  50.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.241062 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2942  hypothetical protein  36.36 
 
 		 328 aa  50.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3397  sporulation domain-containing protein  34.21 
 
 		 472 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0891472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4206  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.77 
 
 		 264 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.356132  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0496  Sporulation domain protein  40.26 
 
 		 458 aa  48.5  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727905 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0903  sporulation domain-containing protein  35.62 
 
 		 318 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.278567  normal  0.0611372 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0950  sporulation domain-containing protein  39.19 
 
 		 292 aa  49.3  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3954  tetratricopeptide TPR_2  35.71 
 
 		 260 aa  48.9  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3706  Sporulation domain protein  34.21 
 
 		 472 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0876978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.92 
 
 		 632 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3123  sporulation domain-containing protein  33.72 
 
 		 273 aa  47.8  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293314  normal  0.174152 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0869  hypothetical protein  29.49 
 
 		 990 aa  46.2  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3203  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.53 
 
 		 282 aa  46.6  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0442  Sporulation domain protein  36.36 
 
 		 308 aa  46.2  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2977  TPR repeat-containing protein  29.53 
 
 		 282 aa  46.6  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.481516 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3526  tetratricopeptide TPR_2  33.77 
 
 		 281 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.476305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1330  Sporulation domain protein  32.93 
 
 		 194 aa  46.2  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.673362  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 		 699 aa  46.2  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3934  sporulation domain-containing protein  35.62 
 
 		 264 aa  45.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1778  hypothetical protein  34.62 
 
 		 356 aa  45.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0878  hypothetical protein  30.38 
 
 		 978 aa  44.7  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3023  sporulation domain-containing protein  33.33 
 
 		 276 aa  45.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0031  sporulation domain-containing protein  29.11 
 
 		 334 aa  45.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0817681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1812  sporulation related  32.47 
 
 		 727 aa  45.1  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.771345  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3719  tetratricopeptide TPR_2  34.19 
 
 		 267 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1226  hypothetical protein  31.2 
 
 		 243 aa  44.3  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3159  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.87 
 
 		 282 aa  44.3  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.646295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1483  Sporulation domain protein  33.33 
 
 		 1108 aa  44.3  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.336559  normal  0.483391 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1106  TPR repeat-containing protein  27.11 
 
 		 371 aa  44.3  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.178209 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1681  Sporulation domain protein  33.33 
 
 		 1079 aa  44.3  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.393299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1467  sporulation domain-containing protein  26.51 
 
 		 237 aa  43.9  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1159  sporulation domain-containing protein  28.57 
 
 		 966 aa  43.9  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1956  transcriptional regulator domain protein  36.11 
 
 		 502 aa  43.5  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00706169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0385  tetratricopeptide TPR_2  30.12 
 
 		 269 aa  43.5  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  28.57 
 
 		 340 aa  43.1  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>