45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1029 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1029  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 		 176 aa  339  1e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0407  TPR repeat-containing protein  50 
 
 		 177 aa  137  8.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644736  normal  0.04042 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1754  TPR repeat-containing protein  39.16 
 
 		 184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.107491  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  39.53 
 
 		 733 aa  52.4  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0360  tetratricopeptide TPR_2  28.89 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3235  tetratricopeptide TPR_2  34.65 
 
 		 734 aa  48.1  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.26 
 
 		 1056 aa  47.8  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  32.23 
 
 		 754 aa  47.8  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3719  tetratricopeptide TPR_2  32.1 
 
 		 267 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3469  TPR repeat-containing protein  35.56 
 
 		 1161 aa  47.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 		 1022 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.76 
 
 		 784 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.67 
 
 		 818 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  29.55 
 
 		 3301 aa  45.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 3172 aa  45.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 374 aa  45.4  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  28.35 
 
 		 340 aa  45.1  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  33.66 
 
 		 754 aa  45.1  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  31.75 
 
 		 1154 aa  44.7  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.77 
 
 		 988 aa  43.9  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.31 
 
 		 839 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  37.04 
 
 		 620 aa  43.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0419  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 		 224 aa  43.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.338331  normal  0.0276215 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  38.27 
 
 		 620 aa  43.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  39.19 
 
 		 643 aa  43.5  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  32.89 
 
 		 968 aa  43.5  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0088  TPR repeat-containing protein  24.51 
 
 		 275 aa  42.7  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.124171 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0899  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.71 
 
 		 245 aa  42.4  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.394622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  31.58 
 
 		 622 aa  42.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66638  glucose repression mediator protein  37.7 
 
 		 815 aa  42.7  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  32 
 
 		 265 aa  42.4  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  31 
 
 		 739 aa  42.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  27.18 
 
 		 448 aa  42  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  37.08 
 
 		 1049 aa  42  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  34.07 
 
 		 878 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0077  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 390 aa  42  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0580  TPR repeat-containing protein  36.71 
 
 		 319 aa  41.6  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.274085 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 1121 aa  41.6  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  27.62 
 
 		 1252 aa  41.6  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  34.21 
 
 		 3145 aa  41.6  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1344  hypothetical protein  32.67 
 
 		 641 aa  41.6  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.527129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.68 
 
 		 1056 aa  41.2  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  30.17 
 
 		 405 aa  40.8  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.63 
 
 		 249 aa  40.8  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2393  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 		 944 aa  40.8  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>