More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1937 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1937  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
412 aa  801    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4499  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 
408 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 
418 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  34.47 
 
 
441 aa  138  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
412 aa  136  5e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  32.46 
 
 
517 aa  136  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  28.18 
 
 
416 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3305  glycosyl transferase, group 1  30.29 
 
 
411 aa  130  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  29.57 
 
 
412 aa  127  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  28.47 
 
 
420 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1697  glycosyl transferase, group 1  28.46 
 
 
408 aa  123  8e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  28.95 
 
 
402 aa  116  6e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  26.49 
 
 
415 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2528  glycosyl transferase group 1  26.73 
 
 
414 aa  110  6e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000156841 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5127  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.63 
 
 
413 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.773253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5519  group 1 family glycosyl transferase  24.63 
 
 
413 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5368  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.63 
 
 
413 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4973  glycosyl transferase, group 1; capsular polysaccharide biosynthesis protein  23.89 
 
 
413 aa  104  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1125  glycosyl transferase group 1  30.09 
 
 
405 aa  101  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.243965  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0810  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 
391 aa  100  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.346593  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1230  glycosyl transferase group 1  31.81 
 
 
409 aa  100  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.1784 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0461  glycosyl transferase group 1  25.19 
 
 
407 aa  100  6e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0573  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 
404 aa  98.6  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.80532  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2375  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 
415 aa  97.1  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5559  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.6 
 
 
409 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.51032  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4953  glycosyl transferase  21.8 
 
 
421 aa  95.9  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000263351  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02343  glycosyltransferase  30.51 
 
 
417 aa  95.5  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.138691 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3033  glycosyl transferase, group 1  28.46 
 
 
410 aa  95.5  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.80507  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1186  glycosyl transferase, group 1  25.96 
 
 
427 aa  93.6  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1384  putative group 1 glycosyl transferase  27.98 
 
 
408 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00304619 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3119  glycosyl transferase, group 1  31.71 
 
 
412 aa  90.1  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  25.98 
 
 
403 aa  89.7  9e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5856  putative glycosyl transferase  30.7 
 
 
420 aa  89  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4035  glycosyl transferase group 1  24.34 
 
 
421 aa  89.4  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00411563 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0736  glycosyl transferase, group 1  24.63 
 
 
423 aa  87.8  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1534  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 
407 aa  87.8  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.994246 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5252  glycosyl transferase group 1  30.95 
 
 
436 aa  86.7  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1522  glycosyl transferase, group 1  24.62 
 
 
421 aa  85.9  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266558  normal  0.0714001 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  29.29 
 
 
386 aa  85.5  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1417  glycosyl transferase, group 1  21.58 
 
 
408 aa  85.1  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 
390 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2263  glycosyl transferase group 1  30.71 
 
 
406 aa  84.7  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0495388  normal  0.0132313 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2726  glycosyl transferase group 1  23.84 
 
 
424 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280523 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3387  glycosyl transferase group 1  23.84 
 
 
424 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  27.9 
 
 
416 aa  84  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02965  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative glycosyltransferase  21.48 
 
 
388 aa  83.6  0.000000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.147492  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0520  phosphoserine aminotransferase, (psat)  23.2 
 
 
401 aa  83.2  0.000000000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  28.12 
 
 
404 aa  83.2  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1168  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  27.64 
 
 
404 aa  82.8  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0854852  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 
390 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3178  putative glycosyl transferase  28.1 
 
 
415 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.35117  hitchhiker  0.00519526 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1805  glycosyl transferase, group 1  34.85 
 
 
372 aa  81.3  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  28.89 
 
 
406 aa  80.9  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4434  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 
422 aa  80.5  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1992  hypothetical protein  31.33 
 
 
382 aa  79  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  0.53449 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1624  glycosyl transferase group 1  25.42 
 
 
414 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2277  glycosyl transferase group 1  25.77 
 
 
412 aa  79  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00701  glycosyl transferase  25.27 
 
 
407 aa  79.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1524  putative glycosyl transferase  28.33 
 
 
410 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0094  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 
431 aa  78.2  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.514117 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0961  glycosyl transferase, group 1  29.27 
 
 
425 aa  77  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.928195 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1076  putative glycosyl transferase  28.23 
 
 
433 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0746  glycosyl transferase, group 1  26.48 
 
 
422 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0297  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 
416 aa  75.5  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 
362 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  24.06 
 
 
369 aa  75.5  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0943  glycosyl transferase, group 1  28.92 
 
 
418 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.132587  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23440  putative group 1 glycosyl transferase  26.77 
 
 
370 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000675067  hitchhiker  0.00579083 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2119  glycosyl transferase, group 1  27.91 
 
 
405 aa  74.7  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111121  normal  0.0181031 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0446  glycosyl transferase, group 1  29.45 
 
 
409 aa  74.7  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.779144 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28280  glycosyltransferase  29.48 
 
 
428 aa  73.9  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4282  glycosyl transferase, group 1  28.49 
 
 
396 aa  73.6  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1964  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 
385 aa  73.2  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014923 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4068  glycosyl transferase group 1  27.61 
 
 
400 aa  72.8  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2517  group 1 glycosyl transferase  24.37 
 
 
429 aa  72.4  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18600  glycosyltransferase  27.16 
 
 
413 aa  72.4  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.166735  normal  0.87942 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4217  glycosyl transferase, group 1  29.62 
 
 
418 aa  72.8  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1262  glycosyl transferase, group 1  26.49 
 
 
405 aa  72  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4577  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 
419 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324449  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3860  putative glycosyl transferase  28.26 
 
 
450 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 
810 aa  70.9  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1038  glycosyl transferase, group 1  23.33 
 
 
395 aa  70.9  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1869  glycosyl transferase, group 1  25.24 
 
 
411 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0230357  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0666  glycosyl transferase, group 1  27.68 
 
 
381 aa  70.5  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000035657 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  32.42 
 
 
409 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0324  glycosyl transferase, group 1  28.93 
 
 
400 aa  69.3  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.546563  normal  0.700296 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  24.9 
 
 
385 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0762  glycosyl transferase group 1  29.51 
 
 
418 aa  67.8  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  31.08 
 
 
388 aa  68.2  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  26.97 
 
 
367 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2748  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 
402 aa  67.4  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.670911  normal  0.0559427 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4448  glycosyl transferase, group 1  27.25 
 
 
428 aa  67.4  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  22.17 
 
 
372 aa  67.4  0.0000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0171  glycosyl transferase, group 1  32.56 
 
 
389 aa  67  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  30.22 
 
 
393 aa  67  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1510  glycosyl transferase, group 1  29.49 
 
 
415 aa  66.6  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0185  glycosyl transferase, group 1  24.92 
 
 
406 aa  66.6  0.0000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0720154  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0183  glycosyl transferase group 1  24.92 
 
 
406 aa  66.6  0.0000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4964  glycosyl transferase group 1  28.18 
 
 
442 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.278981  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  22.22 
 
 
394 aa  65.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>