More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1349 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1349  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like protein  100 
 
 
439 aa  824    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.157144  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3582  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  35.83 
 
 
492 aa  164  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1064  tricarballylate dehydrogenase  28.69 
 
 
505 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0232  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.57 
 
 
523 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0397857  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  27.75 
 
 
493 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000784469 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0355  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like protein  35.63 
 
 
471 aa  113  8.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3133  tricarballylate dehydrogenase  32.63 
 
 
524 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262589  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0283  tricarballylate dehydrogenase  28.53 
 
 
493 aa  111  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0224  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.94 
 
 
539 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0465  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.02 
 
 
524 aa  109  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6400  tricarballylate dehydrogenase  32.34 
 
 
502 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479436  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1003  putative succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  29.17 
 
 
485 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.415422  normal  0.433093 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  25.9 
 
 
511 aa  108  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  27.9 
 
 
596 aa  108  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0462  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.82 
 
 
536 aa  107  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2834  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  30.41 
 
 
488 aa  107  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  29.84 
 
 
599 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  27.7 
 
 
596 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0049  fumarate reductase flavoprotein subunit  29.46 
 
 
616 aa  105  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00375543  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  27.46 
 
 
596 aa  104  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  26.95 
 
 
597 aa  104  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  27.46 
 
 
596 aa  103  6e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1095  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.45 
 
 
482 aa  103  8e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3056  tricarballylate dehydrogenase  30 
 
 
482 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0363  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.91 
 
 
567 aa  100  5e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.629419 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2808  tricarballylate dehydrogenase  32.52 
 
 
503 aa  100  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  25.57 
 
 
597 aa  100  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  28.18 
 
 
596 aa  99.4  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12690  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  26.53 
 
 
580 aa  99  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  28.18 
 
 
596 aa  99.4  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  28.18 
 
 
596 aa  99.4  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  28.18 
 
 
596 aa  99.4  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  32.36 
 
 
470 aa  97.4  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2698  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.58 
 
 
591 aa  97.1  6e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  26.27 
 
 
591 aa  96.7  8e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0682  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.34 
 
 
640 aa  96.7  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000305666  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02608  conserved hypothetical protein  31.58 
 
 
508 aa  96.3  9e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.262389 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  25.93 
 
 
464 aa  95.5  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2731  putative flavoprotein subunit of a reductase  24.5 
 
 
507 aa  94.4  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.620849  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2930  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.2 
 
 
512 aa  93.2  7e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4075  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  29.25 
 
 
484 aa  93.2  8e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4077  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  29.91 
 
 
491 aa  92.4  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  24.07 
 
 
502 aa  92  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  27.25 
 
 
631 aa  92  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  25.68 
 
 
588 aa  91.3  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  27.14 
 
 
593 aa  91.3  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06133  conserved hypothetical protein  29.92 
 
 
530 aa  89.4  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  25 
 
 
589 aa  89  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26410  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  26.86 
 
 
546 aa  89.4  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.991458  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0405  FMN-binding domain protein  27.7 
 
 
626 aa  89.4  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.07228 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2893  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.76 
 
 
576 aa  89  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0629  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.74 
 
 
599 aa  89  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.56075 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  26.57 
 
 
589 aa  89  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  23.35 
 
 
511 aa  89  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0895  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.6 
 
 
578 aa  88.6  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  25.82 
 
 
1004 aa  89  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  28.57 
 
 
598 aa  88.2  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  27.62 
 
 
1005 aa  88.2  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0626  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.56 
 
 
562 aa  87.4  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.770057 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  26.52 
 
 
596 aa  87.4  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08640  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  27.87 
 
 
588 aa  87.4  4e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.390467 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0486  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.54 
 
 
572 aa  87  6e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.221964 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3768  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  27.95 
 
 
460 aa  86.3  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  26.37 
 
 
957 aa  85.9  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2292  putative succinate dehydrogenase  31.41 
 
 
558 aa  86.3  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0437  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.18 
 
 
566 aa  85.9  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1779  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.02 
 
 
586 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24770  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  28.12 
 
 
658 aa  85.9  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0977  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.67 
 
 
561 aa  85.5  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5986  putative fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  30.09 
 
 
459 aa  85.5  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.253677 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  24.41 
 
 
457 aa  85.1  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  25.88 
 
 
589 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6301  tricarballylate dehydrogenase  29.11 
 
 
468 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0086  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.29 
 
 
515 aa  85.5  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2533  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.75 
 
 
555 aa  85.1  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  28.62 
 
 
582 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04200  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  25.26 
 
 
481 aa  84.7  0.000000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.906237  normal  0.517886 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  26.35 
 
 
517 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0200  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  30.5 
 
 
488 aa  84.3  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1003  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.91 
 
 
522 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2146  putative FAD-binding dehydrogenase  31.16 
 
 
570 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.18708 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0986  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.24 
 
 
567 aa  84  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3732  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  29.51 
 
 
568 aa  84  0.000000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  25.05 
 
 
637 aa  83.6  0.000000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  27.33 
 
 
596 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4061  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  29.82 
 
 
476 aa  84  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  24.11 
 
 
609 aa  84  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  28.37 
 
 
582 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0519  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.96 
 
 
607 aa  83.2  0.000000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.220754 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3488  tricarballylate dehydrogenase  26.84 
 
 
486 aa  83.2  0.000000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  25.33 
 
 
608 aa  83.2  0.000000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0124  Succinate dehydrogenase  26.32 
 
 
497 aa  83.2  0.000000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0795  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.52 
 
 
509 aa  82.8  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.820864  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  25.28 
 
 
584 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1029  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.31 
 
 
509 aa  82.8  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0298  putative flavoprotein subunit of a reductase  25.43 
 
 
508 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000145919 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5148  tricarballylate dehydrogenase  27.54 
 
 
469 aa  82.4  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.226548  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12470  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  25.4 
 
 
566 aa  82  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.967758  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02520  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  25.85 
 
 
527 aa  81.3  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.152988  normal  0.211132 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26990  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  26.89 
 
 
551 aa  81.6  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>