53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0559 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0559  O-antigen polymerase  100 
 
 		 647 aa  1227    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.024189  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1952  O-antigen polymerase  57.45 
 
 		 653 aa  460  9.999999999999999e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.953343  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2694  O-antigen polymerase  36.62 
 
 		 535 aa  70.5  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.247958  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1468  secreted polysaccharide polymerase  32.95 
 
 		 404 aa  57  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00102355  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1496  hypothetical protein  32.95 
 
 		 404 aa  56.6  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1682  hypothetical protein  32.95 
 
 		 404 aa  57  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1650  hypothetical protein  32.58 
 
 		 404 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1614  hypothetical protein  32.95 
 
 		 404 aa  56.6  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363158  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3695  hypothetical protein  32.58 
 
 		 404 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  32 
 
 		 878 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32 
 
 		 810 aa  52  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2697  TPR repeat-containing protein  38.82 
 
 		 268 aa  50.8  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000108911  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0051  O-antigen polymerase  23.87 
 
 		 735 aa  50.4  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000539528  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5297  O-antigen polymerase  40.31 
 
 		 670 aa  49.7  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.205567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0357  TPR repeat-containing protein  34.07 
 
 		 273 aa  49.7  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  33.98 
 
 		 465 aa  49.7  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  30.11 
 
 		 1737 aa  48.9  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4615  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.4 
 
 		 1402 aa  48.9  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0699  TPR repeat-containing protein  34.94 
 
 		 563 aa  48.5  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000888687 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1285  O-antigen polymerase  34.21 
 
 		 418 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0586  O-antigen polymerase  32.93 
 
 		 459 aa  47  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000335873  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 		 3172 aa  47  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0962  TPR repeat-containing protein  33.85 
 
 		 279 aa  47  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1314  O-antigen polymerase  34.21 
 
 		 418 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 739 aa  46.6  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.7 
 
 		 632 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  34.12 
 
 		 340 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2327  O-antigen polymerase  29.2 
 
 		 475 aa  46.2  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  26.42 
 
 		 1979 aa  46.2  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 		 1486 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  25.89 
 
 		 3301 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0116  TPR repeat-containing protein  34.25 
 
 		 289 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.75872 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  29.27 
 
 		 561 aa  45.4  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  30.1 
 
 		 827 aa  45.8  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2167  tetratricopeptide TPR_2  30 
 
 		 1014 aa  45.4  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.796808 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0115  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 		 579 aa  45.4  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.165397  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1051  TPR repeat-containing protein  31.76 
 
 		 215 aa  45.8  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  26.73 
 
 		 605 aa  45.1  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.53 
 
 		 565 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0678  extracellular ligand-binding receptor  31.11 
 
 		 1073 aa  45.1  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2550  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 		 670 aa  45.4  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.507483  normal  0.0818134 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2482  sulfotransferase TPR domain-containing protein  34.34 
 
 		 530 aa  44.7  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0063  O-antigen polymerase  28.28 
 
 		 531 aa  44.7  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0639643 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  32.84 
 
 		 686 aa  44.7  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3288  O-antigen polymerase  27.09 
 
 		 594 aa  44.3  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.709506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0678  hypothetical protein  27.09 
 
 		 594 aa  44.3  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.206131 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  31.48 
 
 		 706 aa  44.3  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1087  O-antigen polymerase  22.32 
 
 		 612 aa  43.9  0.008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4145  O-antigen polymerase  20.43 
 
 		 799 aa  44.3  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.373234  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2787  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  48 
 
 		 333 aa  44.3  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0979  O-antigen polymerase  40.91 
 
 		 523 aa  44.3  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  39.34 
 
 		 1094 aa  43.9  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1757  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 530 aa  43.9  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>