108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4342 on replicon NC_009431
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009431  Rsph17025_4342  hypothetical protein  100 
 
 		 821 aa  1632    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.161782  normal  0.0681295 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1960  tail sheath protein  39.73 
 
 		 1117 aa  408  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221062  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0975  phage tail sheath protein, putative  49.82 
 
 		 660 aa  278  3e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0762  tail sheath protein  50.54 
 
 		 585 aa  277  6e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00265038  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3036  tail sheath protein  50 
 
 		 596 aa  258  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00018204 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1882  tail sheath protein  46.92 
 
 		 724 aa  256  2.0000000000000002e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.138498  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5391  tail sheath protein  39.45 
 
 		 514 aa  253  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4383  tail sheath protein  43.19 
 
 		 544 aa  248  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.35186 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2938  tail sheath protein  45.33 
 
 		 509 aa  246  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316264  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3656  tail sheath protein  45.79 
 
 		 401 aa  246  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.175288  normal  0.0120421 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26520  phage tail sheath protein FI  44.33 
 
 		 522 aa  243  1e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.849261  normal  0.473283 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1899  tail sheath protein  43.58 
 
 		 518 aa  243  1e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0131499  normal  0.0166431 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2260  tail sheath protein  44.26 
 
 		 521 aa  242  2e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0965214  hitchhiker  0.000887123 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3660  tail sheath protein  33.33 
 
 		 585 aa  241  4e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0242469  hitchhiker  0.00259723 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1059  tail sheath protein  41.22 
 
 		 521 aa  239  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1874  Phage tail sheath protein  33.16 
 
 		 599 aa  238  2e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1424  tail sheath protein  45.28 
 
 		 522 aa  234  5e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2823  tail sheath protein  42.43 
 
 		 521 aa  232  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1657  phage tail sheath protein  42.11 
 
 		 521 aa  231  5e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.713042  normal  0.0422731 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3816  tail sheath protein  42.37 
 
 		 522 aa  230  9e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414451  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0932  phage tail sheath protein  36.99 
 
 		 512 aa  229  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1501  tail sheath protein  37.3 
 
 		 514 aa  211  3e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2896  phage tail sheath protein FI  40.8 
 
 		 405 aa  207  5e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.929294  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1128  Phage tail sheath protein  39.72 
 
 		 638 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0804  tail sheath protein  44.58 
 
 		 551 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.518886 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1731  tail sheath protein  41.35 
 
 		 569 aa  196  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000563063 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1560  tail sheath protein  40.14 
 
 		 405 aa  190  9e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0705385 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2564  hypothetical protein  37.14 
 
 		 781 aa  184  6e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00387686  hitchhiker  0.000000000127886 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1758  phage tail sheath protein  33.5 
 
 		 524 aa  183  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53821 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1958  tail sheath protein  42.41 
 
 		 686 aa  174  6.999999999999999e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1505  tail sheath protein  33.17 
 
 		 522 aa  170  9e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5257  tail sheath protein  34.8 
 
 		 465 aa  160  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1038  hypothetical protein  32.07 
 
 		 470 aa  157  7e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1687  hypothetical protein  44.5 
 
 		 478 aa  154  5e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3614  putative phage tail sheath protein FI  43.23 
 
 		 649 aa  153  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000782439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4249  phage tail sheath protein FI  35.77 
 
 		 402 aa  153  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.408866  normal  0.264788 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1824  tail sheath protein  35.02 
 
 		 690 aa  153  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.414219  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0674  putative phage tail sheath protein FI  42.13 
 
 		 697 aa  150  7e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1827  phage tail sheath protein  36.19 
 
 		 802 aa  150  9e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0832  phage tail sheath protein  34.71 
 
 		 644 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0863  phage tail sheath protein  33.45 
 
 		 542 aa  149  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00698739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3150  Phage tail sheath protein FI-like protein  42.41 
 
 		 700 aa  145  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.81782  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0845  Phage tail sheath protein FI-like protein  32.32 
 
 		 740 aa  146  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3512  hypothetical protein  39.58 
 
 		 394 aa  144  8e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.222517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0655  Phage tail sheath protein FI-like protein  32.49 
 
 		 740 aa  144  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2545  hypothetical protein  43.02 
 
 		 479 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4344  hypothetical protein  35.04 
 
 		 734 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.500109  normal  0.105188 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3922  hypothetical protein  38.22 
 
 		 500 aa  134  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000725372  hitchhiker  0.00401697 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1074  hypothetical protein  39.18 
 
 		 498 aa  133  2.0000000000000002e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2466  hypothetical protein  38.95 
 
 		 497 aa  132  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.424352 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0931  hypothetical protein  28.02 
 
 		 509 aa  124  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.229261  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1889  hypothetical protein  28.02 
 
 		 509 aa  124  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0540146  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3815  phage tail sheath protein  27.91 
 
 		 509 aa  123  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3007  hypothetical protein  34.01 
 
 		 517 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0897  hypothetical protein  33.51 
 
 		 499 aa  115  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.776782 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1041  hypothetical protein  33.51 
 
 		 499 aa  115  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0681  hypothetical protein  32.82 
 
 		 517 aa  115  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0373  hypothetical protein  34.02 
 
 		 522 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3482  phage tail sheath protein  22.39 
 
 		 395 aa  66.6  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.345078  normal  0.101066 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1284  phage tail sheath protein  26.4 
 
 		 405 aa  65.9  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.326393 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3192  tail sheath protein  21.97 
 
 		 389 aa  64.3  0.000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2187  tail sheath protein  22.73 
 
 		 389 aa  63.9  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2300  tail sheath protein  22.73 
 
 		 389 aa  63.5  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2347  tail sheath protein  22.73 
 
 		 391 aa  63.9  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0397  contractile tail sheath protein  25.79 
 
 		 392 aa  63.9  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.503837  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1136  contractile tail sheath protein  25.79 
 
 		 392 aa  63.9  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1158  tail sheath protein  26.19 
 
 		 392 aa  64.3  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0863  tail sheath protein  21.74 
 
 		 389 aa  62  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.360153  hitchhiker  0.00380861 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2493  major tail sheath protein  22.73 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2919  prophage MuMc02, tail sheath protein, putative  25.79 
 
 		 485 aa  60.8  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0942  major tail sheath protein  22.73 
 
 		 390 aa  60.8  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2895  tail sheath protein  22.81 
 
 		 389 aa  60.1  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.736844 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2756  tail sheath protein  22.73 
 
 		 390 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512477 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4345  phage tail sheath protein  22.61 
 
 		 396 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2099  tail sheath protein  22.48 
 
 		 389 aa  60.1  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1815  tail sheath protein  21.97 
 
 		 389 aa  59.7  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0447536  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0747  hypothetical protein  26.51 
 
 		 474 aa  58.9  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346029  normal  0.109528 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2592  tail sheath protein  24.22 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.290828  hitchhiker  0.0000000176032 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2626  tail sheath protein  24.22 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129054  hitchhiker  0.000000715616 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3030  phage tail sheath protein  21.46 
 
 		 396 aa  58.9  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296103 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1630  phage tail sheath protein  25 
 
 		 398 aa  58.9  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0887  tail sheath protein  26.09 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1918  phage tail sheath-like protein  25.49 
 
 		 391 aa  58.2  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.947366 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0695  Phage tail sheath protein  27.23 
 
 		 391 aa  57  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4383  phage tail sheath protein  22.22 
 
 		 395 aa  57.4  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.301789  hitchhiker  0.000355682 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3031  major tail sheath protein  23.11 
 
 		 390 aa  57  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023583 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0765  phage tail sheath protein  26.56 
 
 		 386 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2848  major tail sheath protein  23.11 
 
 		 390 aa  56.6  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3059  pyocin R2_PP, tail sheath protein  27.07 
 
 		 388 aa  55.5  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08070  putative phage tail sheath protein  24.71 
 
 		 386 aa  55.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000271691  hitchhiker  0.000268611 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3308  phage tail sheath protein  22.81 
 
 		 391 aa  55.1  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0738809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1860  phage tail sheath protein  24.14 
 
 		 389 aa  53.9  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4040  tail sheath protein  24.9 
 
 		 388 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000103463 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1565  tail sheath protein  27.27 
 
 		 475 aa  52.4  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3396  major tail sheath protein  25.35 
 
 		 387 aa  52  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2378  phage tail sheath protein  24.89 
 
 		 478 aa  51.6  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2897  tail sheath protein  26.82 
 
 		 475 aa  51.2  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1379  phage tail sheath protein  24.44 
 
 		 394 aa  50.4  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.569041  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01344  phage tail sheath protein  21.19 
 
 		 388 aa  48.9  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.473608  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4554  phage tail sheath protein  27.84 
 
 		 475 aa  48.5  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00163736  normal  0.433622 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>