More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3634 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
278 aa  541  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.189736  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3335  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  94.6 
 
 
278 aa  495  1e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4061  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  93.53 
 
 
278 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.137832  normal  0.901224 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2917  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.66 
 
 
273 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2656  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.03 
 
 
273 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.193296  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6275  ABC transporter membrane spanning protein (spermidine/putrescine)  68.03 
 
 
272 aa  347  1e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2891  ABC transporter permease  57.91 
 
 
300 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.183278  normal  0.0672791 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3945  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.23 
 
 
295 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0206  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.74 
 
 
294 aa  305  8.000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0399533 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2470  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.34 
 
 
298 aa  304  1.0000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.34 
 
 
301 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1359  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  59.66 
 
 
301 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.818924  normal  0.0399312 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3372  ABC transporter permease protein  58.96 
 
 
295 aa  298  8e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.315041 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.29 
 
 
298 aa  296  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.226499  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1008  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.29 
 
 
294 aa  295  5e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547475  hitchhiker  0.001025 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3536  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.29 
 
 
296 aa  294  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.279671  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0103  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.19 
 
 
297 aa  291  5e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.111803  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5900  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.15 
 
 
298 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1907  ABC transporter permease  55.3 
 
 
296 aa  278  8e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3271  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.68 
 
 
294 aa  265  8e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.869934  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7131  ABC transporter membrane spanning protein (spermidine/putrescine)  49.07 
 
 
281 aa  260  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5876  ABC transporter membrane spanning protein (spermidine/putrescine)  45.17 
 
 
281 aa  212  4.9999999999999996e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.413281  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0995  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.74 
 
 
283 aa  193  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1009  ornithine carbamoyltransferase  34.72 
 
 
266 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1203  ornithine carbamoyltransferase  34.34 
 
 
266 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4005  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  33.58 
 
 
266 aa  125  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000178374 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1339  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  33.58 
 
 
266 aa  125  7e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1400  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  33.21 
 
 
266 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1201  spermidine/putrescine ABC transporter permease  33.21 
 
 
266 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440242  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1179  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  33.21 
 
 
266 aa  124  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1181  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  33.21 
 
 
266 aa  124  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0752832  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1299  spermidine/putrescine ABC transporter permease  33.21 
 
 
266 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1377  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  33.21 
 
 
266 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000768374 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1441  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  33.58 
 
 
266 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0782345  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3393  ABC opine/polyamine transporter, inner membrane subunit  34.27 
 
 
264 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.381224  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3039  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.27 
 
 
264 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.645477  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1644  ornithine carbamoyltransferase  33.46 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.05 
 
 
260 aa  110  3e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
597 aa  109  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3639  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.96 
 
 
268 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.344703 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8149  ABC transporter  31.38 
 
 
266 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.828592  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.54 
 
 
282 aa  106  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.75 
 
 
267 aa  106  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0237  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  33.73 
 
 
276 aa  105  9e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3949  ornithine carbamoyltransferase  31.05 
 
 
287 aa  104  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.551991  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3606  Ornithine carbamoyltransferase  33.33 
 
 
288 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.129461 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1119  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.3 
 
 
261 aa  103  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00123252  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2838  ornithine carbamoyltransferase  32.26 
 
 
286 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000365648  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1543  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  34.24 
 
 
275 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.414706 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3012  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.4 
 
 
267 aa  103  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.343858  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2045  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.18 
 
 
275 aa  102  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.586316  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1549  ornithine carbamoyltransferase  31.66 
 
 
284 aa  102  8e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6717  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  34.15 
 
 
280 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00799546  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0016  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  32.45 
 
 
268 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.45 
 
 
268 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.858414  normal  0.553019 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.91 
 
 
261 aa  100  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.260601  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3073  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.25 
 
 
284 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.446798  normal  0.0908777 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1221  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  31.88 
 
 
282 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2817  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.72 
 
 
287 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1338  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.88 
 
 
282 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3109  spermidine/putrescine ABC transporter permease  31.88 
 
 
282 aa  100  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.6 
 
 
268 aa  97.8  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4689  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.89 
 
 
276 aa  97.8  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4417  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.66 
 
 
268 aa  97.1  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.303148  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3799  ornithine carbamoyltransferase  29.66 
 
 
260 aa  95.9  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3854  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.34 
 
 
273 aa  96.3  6e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.181021  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1532  polyamine transport protein PotC  33.47 
 
 
256 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17620  polyamine transport protein PotC  33.47 
 
 
256 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0343  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  32.89 
 
 
256 aa  95.1  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2171  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.94 
 
 
268 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.0038105  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1379  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.48 
 
 
266 aa  95.1  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.361864  normal  0.102972 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0103  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.05 
 
 
275 aa  95.1  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0287  ABC transporter permease  29.8 
 
 
269 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8156  ABC transporter  32.71 
 
 
264 aa  94.7  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.15 
 
 
587 aa  95.1  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.432532 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2228  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.7 
 
 
272 aa  94.4  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5840  ABC transporter membrane spanning protein (putrescine)  27.82 
 
 
265 aa  94.7  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1766  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.21 
 
 
286 aa  94  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5122  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.33 
 
 
274 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.026759  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.92 
 
 
264 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381273  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4294  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.07 
 
 
279 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.144254  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.7 
 
 
272 aa  94.4  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0313  ornithine carbamoyltransferase  31.1 
 
 
273 aa  93.6  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.516071  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3672  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  29.88 
 
 
256 aa  92.8  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1061  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.72 
 
 
266 aa  92.8  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115095  normal  0.340586 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2398  ABC putrescine transporter, inner membrane subunit  26.72 
 
 
266 aa  92.4  8e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane protein  28.8 
 
 
260 aa  92  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.279187 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.57 
 
 
281 aa  92  8e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.360283  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.51 
 
 
263 aa  92.4  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.829399  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1598  inner membrane ABC-transporter permease protein  31.88 
 
 
268 aa  92  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.131611  normal  0.983656 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1871  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.63 
 
 
278 aa  92  9e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2380  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.71 
 
 
279 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576146  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3539  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.15 
 
 
264 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.447694  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0372  ornithine carbamoyltransferase  29.26 
 
 
261 aa  92  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.49 
 
 
264 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.676109 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5374  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.15 
 
 
264 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.16 
 
 
275 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.360042  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.72 
 
 
265 aa  91.3  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0165031  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.52 
 
 
277 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0748  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter inner membrane protein  29.49 
 
 
264 aa  90.5  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.467059  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>