More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2389 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2389  ABC transporter component  100 
 
 		 243 aa  475  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3928  ABC transporter-like  61.9 
 
 		 247 aa  291  6e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1967  ABC transporter related  62.18 
 
 		 248 aa  291  6e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842507  normal  0.0685395 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2114  ABC transporter related  62.18 
 
 		 248 aa  290  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.745156  normal  0.0880231 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3802  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  61.34 
 
 		 248 aa  286  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.299186  normal  0.406504 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2089  ABC transporter related  62.45 
 
 		 248 aa  286  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.182064  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2140  cation ABC transporter, ATP-binding protein  61.04 
 
 		 250 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33550  putative ATP-binding component of ABC transporter  61.02 
 
 		 251 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0525932  normal  0.0956695 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2851  ABC transporter ATP-binding protein  60.59 
 
 		 251 aa  281  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.79214  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1950  ABC transporter  61.04 
 
 		 254 aa  281  6.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.373165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3594  ABC transporter related  54.47 
 
 		 250 aa  234  8e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.232406 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0124  ABC transporter, ATP binding protein  45.11 
 
 		 254 aa  201  9e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0306  ABC transporter related protein  40.43 
 
 		 230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06744  ABC transporter component  44.54 
 
 		 244 aa  189  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000835  manganese transport system ATP-binding protein mntA  39.06 
 
 		 242 aa  172  5.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.15273  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3414  ABC transporter related  38.36 
 
 		 269 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1654  ABC transporter-like protein  32.78 
 
 		 240 aa  150  2e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1112  ABC transporter related  35.62 
 
 		 259 aa  145  6e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0371  ABC transporter-like protein  40.08 
 
 		 256 aa  143  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  32.74 
 
 		 260 aa  142  6e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3314  ABC transporter related  37.13 
 
 		 262 aa  141  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3490  ABC transporter related  32.76 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0299606  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4952  ABC transporter related  33.74 
 
 		 266 aa  139  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2475  ABC transporter related  34.92 
 
 		 254 aa  138  7e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.322042  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0859  ABC transporter related  34.67 
 
 		 251 aa  136  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0141336  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0533  ABC transporter related  39.83 
 
 		 255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.622469  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3153  hypothetical protein  40.6 
 
 		 244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.641023 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4031  cation ABC transporter, ATP-binding protein  35.43 
 
 		 256 aa  136  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00593261  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4415  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  35.43 
 
 		 256 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4134  ABC transporter related  36.7 
 
 		 256 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3568  ABC zinc transporter, ATPase subunit ZnuC  40.17 
 
 		 243 aa  135  8e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3251  ABC transporter related  40.17 
 
 		 243 aa  135  8e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0932587 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0837  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  34.98 
 
 		 256 aa  134  9e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00154907  hitchhiker  0.00000902148 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4361  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.43 
 
 		 256 aa  135  9e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129987  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4399  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  34.98 
 
 		 256 aa  134  9e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0939704  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4183  cation ABC transporter ATP-binding protein  35.43 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.420645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4021  cation ABC transporter, ATP-binding protein  35.43 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100127  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4505  cation ABC transporter ATP-binding protein  35.43 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.345764  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4303  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  35.43 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9910000000000006e-20 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0189  ABC transporter related  39.91 
 
 		 256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.626652  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1009  ABC transporter related  38.63 
 
 		 308 aa  133  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0140  ATPase  41.04 
 
 		 252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0265592  normal  0.609622 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0196  ABC transporter-related protein  37.13 
 
 		 243 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.440327  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4770  ABC transporter related  37.97 
 
 		 250 aa  132  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0058  ABC-type Mn/Zn transport systems, ATPase component  34.91 
 
 		 261 aa  132  6e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4138  ABC transporter related  41.77 
 
 		 254 aa  131  6.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.19179 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0929  ABC transporter related  39.56 
 
 		 244 aa  131  9e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.281501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0492  ABC transporter-related protein  36.89 
 
 		 256 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  32.23 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  37.83 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1596  ABC transporter-like protein  38.93 
 
 		 256 aa  130  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.309069  normal  0.368038 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2316  ABC transporter related  36.18 
 
 		 251 aa  129  3e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2803  ABC transporter related  32.07 
 
 		 266 aa  129  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4569  ABC transporter-like protein protein  34.96 
 
 		 267 aa  129  4.0000000000000003e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.198016  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0623  ABC transporter related  37.1 
 
 		 294 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.512401  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2894  ABC transporter component  39.57 
 
 		 300 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.630242  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1440  manganese ABC transporter ATP-binding protein  32.14 
 
 		 237 aa  129  5.0000000000000004e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1317  ATPase  35.19 
 
 		 245 aa  128  7.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0801  ABC transporter related  33.62 
 
 		 252 aa  128  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0712793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1014  ABC transporter related protein  36.32 
 
 		 287 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3599  ABC transporter related  34.15 
 
 		 250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2044  ABC transporter related  37.13 
 
 		 278 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000667877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1142  ABC transporter related  37.71 
 
 		 260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1589  ABC transporter related protein  36.03 
 
 		 250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.741401  normal  0.0385936 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3614  ABC transporter related  37.05 
 
 		 249 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0131312 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2569  ABC transporter related  34.07 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.630319  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  37.5 
 
 		 263 aa  126  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3009  ABC transporter-related protein  33.33 
 
 		 257 aa  126  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.12216  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0774  ABC transporter related  33.19 
 
 		 252 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0702  ABC transporter related  30.38 
 
 		 236 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000834751  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0401  ABC transporter-related protein  33.79 
 
 		 257 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2028  high-affinity zinc transporter ATPase  36.28 
 
 		 253 aa  125  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000463637  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2418  high-affinity zinc transporter ATPase  36.28 
 
 		 253 aa  125  4.0000000000000003e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000136386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2141  high-affinity zinc transporter ATPase  36.28 
 
 		 253 aa  125  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000000523948  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3533  ABC transporter related protein  34.15 
 
 		 250 aa  125  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0223  ABC transporter related protein  30.87 
 
 		 236 aa  125  5e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3167  ABC transporter related  36.44 
 
 		 249 aa  125  6e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.473142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1682  ABC transporter related  29.31 
 
 		 247 aa  125  7e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2774  high-affinity zinc transporter ATPase  36.89 
 
 		 252 aa  125  7e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000747902  hitchhiker  0.00672934 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  38.01 
 
 		 271 aa  125  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1103  ABC transporter related  37.34 
 
 		 250 aa  125  7e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3261  ABC transporter related  34.47 
 
 		 257 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000189494  normal  0.195184 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0222  ABC transporter related  35.98 
 
 		 249 aa  124  9e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.654049  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2985  ABC transporter, ATP-binding protein  36.89 
 
 		 250 aa  124  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0031  ABC transporter related  35.22 
 
 		 251 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  32.64 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4438  ABC transporter-like  32.11 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.657591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1389  ABC transporter related  37.4 
 
 		 251 aa  124  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0369589  normal  0.478115 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2574  ATPase  35.44 
 
 		 251 aa  124  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.523052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1016  ABC transporter, ATPase subunit  33.78 
 
 		 249 aa  124  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  35.9 
 
 		 258 aa  124  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3172  chelated iron transport system membrane protein YfeB  34.71 
 
 		 273 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.513641  normal  0.970851 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2966  ABC transporter ATP-binding protein  33.78 
 
 		 249 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00148861  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0186  ABC transporter related  33.19 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3191  ABC transporter ATP-binding protein  33.78 
 
 		 249 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.540176  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3979  ABC transporter related  35.5 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.97942 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0327  iron ABC transporter, ATP-binding protein  35.59 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000461185  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1042  ABC transporter related  38.91 
 
 		 274 aa  123  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.198308 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1258  ABC transporter related  36.02 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.822153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2552  ABC transporter related  34.62 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>