More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0748 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0748  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 415 aa  826    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1013  histidyl-tRNA synthetase  58.72 
 
 		 411 aa  484  1e-136  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.422572  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0136  histidyl-tRNA synthetase  57.77 
 
 		 415 aa  469  1.0000000000000001e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.179291 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2531  histidyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 		 415 aa  401  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1076  histidyl-tRNA synthetase  48.62 
 
 		 408 aa  392  1e-108  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  51.72 
 
 		 435 aa  384  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 		 400 aa  381  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0712  histidyl-tRNA synthetase  46.77 
 
 		 413 aa  372  1e-102  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.666191  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0291  histidyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 		 413 aa  372  1e-102  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0735  histidyl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 427 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0220  histidyl-tRNA synthetase  49.77 
 
 		 430 aa  371  1e-101  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  49.76 
 
 		 424 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  49.14 
 
 		 429 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 		 424 aa  368  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 		 424 aa  368  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 		 424 aa  368  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  48.03 
 
 		 424 aa  368  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3311  histidyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 		 425 aa  366  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 424 aa  366  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  46.19 
 
 		 424 aa  365  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 		 424 aa  368  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0188  histidyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 		 445 aa  366  1e-100  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.207705  decreased coverage  0.00812888 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  46.19 
 
 		 425 aa  365  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 		 424 aa  368  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 		 424 aa  368  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 		 424 aa  366  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 		 424 aa  368  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2715  histidyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 431 aa  366  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0979277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3004  histidyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 		 426 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0149184  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3125  histidyl-tRNA synthetase  46.79 
 
 		 426 aa  366  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0624144  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1374  histidyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 		 426 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0595731  normal  0.400844 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2989  histidyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 		 426 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.212301  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3013  histidyl-tRNA synthetase  46.19 
 
 		 424 aa  365  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  48.16 
 
 		 424 aa  368  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  48.04 
 
 		 424 aa  367  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2760  histidyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 		 424 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 		 424 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3147  histidyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 		 426 aa  365  1e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00958807 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 		 424 aa  364  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 		 422 aa  363  2e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1291  histidyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 		 423 aa  364  2e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0897904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0730  histidyl-tRNA synthetase  47.32 
 
 		 424 aa  363  2e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004348  histidyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 		 422 aa  363  2e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2716  histidyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 		 424 aa  364  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3008  histidyl-tRNA synthetase  47.91 
 
 		 424 aa  364  2e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 		 424 aa  364  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0289  histidyl-tRNA synthetase  50.26 
 
 		 419 aa  363  3e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01068  histidyl-tRNA synthetase  45.35 
 
 		 422 aa  363  4e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  46.56 
 
 		 429 aa  361  1e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1306  histidyl-tRNA synthetase  45 
 
 		 424 aa  360  2e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000890962  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  45.15 
 
 		 423 aa  360  2e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 		 423 aa  360  3e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 		 424 aa  359  4e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1230  histidyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 		 425 aa  359  6e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1117  histidyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 		 424 aa  358  8e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.727727  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14890  histidyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 		 429 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02980  histidyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 		 427 aa  358  9.999999999999999e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.651371  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0854  histidyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 		 429 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0884  histidyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 		 429 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265271  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1229  histidyl-tRNA synthetase  46.19 
 
 		 425 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.322745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0897  histidyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 		 429 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475429  hitchhiker  0.000000578873 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1300  histidyl-tRNA synthetase  45.82 
 
 		 425 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  47.17 
 
 		 429 aa  356  5e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1433  histidyl-tRNA synthetase  44.05 
 
 		 424 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00243432  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1501  histidyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 		 426 aa  353  2e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1482  histidyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 		 426 aa  354  2e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4324  histidyl-tRNA synthetase  46.9 
 
 		 429 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.439284  hitchhiker  0.0000000761597 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 		 429 aa  354  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1357  histidyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 		 424 aa  352  8e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000835199 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2364  histidyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 		 424 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00827358  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1187  histidyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 		 424 aa  352  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.557803  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0405  histidyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 		 425 aa  351  1e-95  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1128  histidyl-tRNA synthetase  45.99 
 
 		 424 aa  351  1e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1435  histidyl-tRNA synthetase  45.92 
 
 		 429 aa  351  2e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5012  histidyl-tRNA synthetase  47.28 
 
 		 430 aa  350  3e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0417  histidyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 		 424 aa  350  3e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143012 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1294  histidyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 		 424 aa  350  3e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2889  histidyl-tRNA synthetase  47.68 
 
 		 422 aa  349  5e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2855  histidyl-tRNA synthetase  47.56 
 
 		 428 aa  349  6e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.983012  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1545  histidyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 		 424 aa  348  8e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000365747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  46.43 
 
 		 426 aa  348  1e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1249  histidyl-tRNA synthetase  45.92 
 
 		 429 aa  348  1e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0462121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 419 aa  348  1e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0622  histidyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 		 426 aa  348  1e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3499  histidyl-tRNA synthetase  47.74 
 
 		 428 aa  347  2e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1312  histidyl-tRNA synthetase  48.11 
 
 		 429 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.187766  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1788  histidyl-tRNA synthetase  47.41 
 
 		 423 aa  347  3e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25401  histidyl-tRNA synthetase  47.67 
 
 		 436 aa  346  5e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1068  histidyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 		 414 aa  344  2e-93  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0027  histidyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 		 417 aa  343  2e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 		 419 aa  344  2e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40280  histidyl-tRNA synthetase  45.24 
 
 		 428 aa  343  2.9999999999999997e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0368177  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 		 414 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1169  histidyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 		 448 aa  343  4e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0566185  normal  0.367142 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 		 416 aa  342  9e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 		 430 aa  342  9e-93  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1136  histidyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 414 aa  341  1e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.850642  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0781  histidyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 413 aa  340  2e-92  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1619  histidyl-tRNA synthetase  48.23 
 
 		 436 aa  340  4e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0623  histidyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 		 426 aa  339  5e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>