More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0300 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0300  aminotransferase  100 
 
 		 284 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3773  aminotransferase  73.85 
 
 		 284 aa  440  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.783601  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0626  aminotransferase  74.2 
 
 		 284 aa  439  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1102  aminotransferase  57.91 
 
 		 290 aa  348  8e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3729  aminotransferase  56.54 
 
 		 287 aa  344  1e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5073  aminotransferase  56.12 
 
 		 307 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.068349  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0999  aminotransferase  56.12 
 
 		 290 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.471878 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5485  aminotransferase  57.4 
 
 		 288 aa  325  7e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.787347  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1805  aminotransferase  57.4 
 
 		 285 aa  324  1e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5063  aminotransferase  57.39 
 
 		 288 aa  322  4e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.239905  normal  0.18977 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4602  aminotransferase  57.39 
 
 		 288 aa  321  9.000000000000001e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.042075 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0585  aminotransferase  55.28 
 
 		 293 aa  319  3.9999999999999996e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1251  aminotransferase  55.12 
 
 		 293 aa  307  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2216  aminotransferase  55.63 
 
 		 287 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2837  aminotransferase  56.34 
 
 		 286 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0197533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2277  aminotransferase  54.77 
 
 		 287 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.312513 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0891  aminotransferase  56.88 
 
 		 287 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.413724  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0951  aminotransferase  54.77 
 
 		 295 aa  297  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0832  aminotransferase  54.58 
 
 		 295 aa  294  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0868  aminotransferase  48.41 
 
 		 287 aa  280  2e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896873 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0508  aminotransferase  46.1 
 
 		 294 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6433  aminotransferase  43.64 
 
 		 281 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.434397 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4079  branched-chain amino acid aminotransferase  32.84 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.445103 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2602  branched-chain amino acid aminotransferase  32.22 
 
 		 289 aa  116  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1756  branched-chain amino acid aminotransferase  30.29 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000715407 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1721  branched-chain amino acid aminotransferase  28.41 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0205647 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0353  branched-chain amino acid aminotransferase  30.77 
 
 		 304 aa  113  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.733524  normal  0.170926 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3301  branched-chain amino acid aminotransferase  30.8 
 
 		 289 aa  112  7.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0094  branched-chain amino acid aminotransferase  29.28 
 
 		 288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2140  branched-chain amino acid aminotransferase  31.06 
 
 		 322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0846884  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2686  branched-chain amino acid aminotransferase  29.47 
 
 		 309 aa  109  7.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2926  branched-chain amino acid aminotransferase  30.74 
 
 		 288 aa  108  8.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.458427  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6151  branched-chain amino acid aminotransferase  31.09 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.285448 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2786  branched-chain amino acid aminotransferase  28.79 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0947  branched-chain amino acid aminotransferase  29.02 
 
 		 309 aa  107  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.506532  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1039  branched-chain amino acid aminotransferase  31.71 
 
 		 320 aa  106  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  27.7 
 
 		 286 aa  105  8e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2551  branched-chain amino acid aminotransferase  29.79 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317698  normal  0.771861 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1140  branched-chain amino acid aminotransferase  28.62 
 
 		 288 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.817897  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2801  branched-chain amino acid aminotransferase  28.62 
 
 		 288 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.581296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2678  branched-chain amino acid aminotransferase  29.79 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0293  branched-chain amino acid aminotransferase  28.87 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0992  branched-chain amino acid aminotransferase  28.87 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.631035  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2223  branched-chain amino acid aminotransferase  29.32 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0034  branched-chain amino acid aminotransferase  28.87 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0660  branched-chain amino acid aminotransferase  28.87 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256122  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0830  branched-chain amino acid aminotransferase  28.87 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0834  branched-chain amino acid aminotransferase  28.87 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245498  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0588  branched-chain amino acid aminotransferase  28.87 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2421  branched-chain amino acid aminotransferase  28.87 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6017  branched-chain amino acid aminotransferase  32.81 
 
 		 295 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0299425 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2556  branched-chain amino acid aminotransferase  31.11 
 
 		 297 aa  103  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0667  branched-chain amino acid aminotransferase  29.08 
 
 		 307 aa  102  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.541959 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2020  branched-chain amino acid aminotransferase  28.87 
 
 		 307 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2631  branched-chain amino acid aminotransferase  28.87 
 
 		 307 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.66412  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5962  branched-chain amino acid aminotransferase  28.01 
 
 		 307 aa  102  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3280  branched-chain amino acid aminotransferase  28.52 
 
 		 307 aa  102  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4163  branched-chain amino acid aminotransferase  28 
 
 		 307 aa  101  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0456  branched-chain amino acid aminotransferase  27.46 
 
 		 307 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.940058  normal  0.29974 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1060  branched-chain amino acid aminotransferase  29.43 
 
 		 305 aa  102  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0686  branched-chain amino acid aminotransferase  28.52 
 
 		 307 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2660  branched-chain amino acid aminotransferase  28.52 
 
 		 307 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3545  branched-chain amino acid aminotransferase  29.1 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40526  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7270  branched-chain amino acid aminotransferase  31.62 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1646  branched-chain amino acid aminotransferase  30.12 
 
 		 296 aa  99.8  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0291  branched-chain amino acid aminotransferase  29.02 
 
 		 307 aa  100  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0444  branched-chain amino acid aminotransferase  28 
 
 		 307 aa  99.8  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.976398 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4219  branched-chain amino acid aminotransferase  26.99 
 
 		 308 aa  99.8  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0850  branched-chain amino acid aminotransferase  28.36 
 
 		 299 aa  99.8  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169673  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4909  aminotransferase class IV  33.59 
 
 		 296 aa  99.4  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  29.45 
 
 		 287 aa  99.4  6e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2587  branched-chain amino acid aminotransferase  31.45 
 
 		 295 aa  99  7e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2810  branched-chain amino acid aminotransferase  31.45 
 
 		 295 aa  99  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4030  branched-chain amino acid aminotransferase  26.99 
 
 		 308 aa  99  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.597878  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1099  branched-chain amino acid aminotransferase  27.97 
 
 		 307 aa  99  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0264  branched-chain amino acid aminotransferase  27.02 
 
 		 312 aa  99  9e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  29.21 
 
 		 287 aa  98.2  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03648  branched-chain amino acid aminotransferase  25.34 
 
 		 309 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00137757  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4206  branched-chain amino acid aminotransferase  25.34 
 
 		 309 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.884547  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0567  branched-chain amino acid aminotransferase  27.56 
 
 		 309 aa  97.8  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.83417 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4281  branched-chain amino acid aminotransferase  25.34 
 
 		 309 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3987  branched-chain amino acid aminotransferase  25.34 
 
 		 309 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03597  hypothetical protein  25.34 
 
 		 309 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4150  branched-chain amino acid aminotransferase  25.34 
 
 		 309 aa  97.4  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2934  branched-chain amino acid aminotransferase  31.95 
 
 		 339 aa  97.4  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0922  branched-chain amino acid aminotransferase  26.86 
 
 		 304 aa  97.8  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4136  branched-chain amino acid aminotransferase  25.34 
 
 		 309 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.405484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2615  branched-chain amino acid aminotransferase  31.45 
 
 		 295 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.663717  normal  0.748854 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5204  branched-chain amino acid aminotransferase  25.34 
 
 		 309 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4232  branched-chain amino acid aminotransferase  25.34 
 
 		 309 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583001  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09831  branched-chain amino acid aminotransferase  26.86 
 
 		 304 aa  97.8  2e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09811  branched-chain amino acid aminotransferase  26.86 
 
 		 304 aa  97.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1216  branched-chain amino acid aminotransferase  29.3 
 
 		 309 aa  97.1  3e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00270183 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0203  branched-chain amino acid aminotransferase  26.15 
 
 		 312 aa  97.1  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0360  branched-chain amino acid aminotransferase  28.57 
 
 		 310 aa  97.1  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.270933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1176  branched-chain amino acid aminotransferase  29.3 
 
 		 309 aa  97.1  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000401768 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3774  branched-chain amino acid aminotransferase  25.85 
 
 		 308 aa  96.7  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.694412  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  27.88 
 
 		 287 aa  96.7  4e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0493  branched-chain amino acid aminotransferase  28.36 
 
 		 306 aa  96.7  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0506  branched-chain amino acid aminotransferase  25.26 
 
 		 316 aa  96.3  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>