More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0223 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0223  polyphosphate:AMP phosphotransferase  100 
 
 		 534 aa  1080    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3059  protein of unknown function DUF344  51.62 
 
 		 495 aa  536  1e-151  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000557156  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0728  hypothetical protein  50.96 
 
 		 492 aa  511  1e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.156252  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3585  polyphosphate:AMP phosphotransferase  49.91 
 
 		 501 aa  508  1e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.699024  normal  0.181512 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3229  hypothetical protein  49.24 
 
 		 496 aa  497  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1672  hypothetical protein  48.58 
 
 		 544 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122846  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3178  hypothetical protein  48.66 
 
 		 493 aa  494  9.999999999999999e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1752  hypothetical protein  48.01 
 
 		 497 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0807275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3962  hypothetical protein  48.01 
 
 		 497 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.701093  normal  0.023635 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4097  polyphosphate:AMP phosphotransferase  48.12 
 
 		 504 aa  490  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1344  hypothetical protein  48.2 
 
 		 497 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.38694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1360  hypothetical protein  48.39 
 
 		 497 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227982  normal  0.362611 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19410  hypothetical protein  48.01 
 
 		 496 aa  486  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1113  polyphosphate:AMP phosphotransferase  46.68 
 
 		 497 aa  483  1e-135  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1873  hypothetical protein  47.52 
 
 		 497 aa  476  1e-133  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.771606  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1544  hypothetical protein  49.62 
 
 		 521 aa  476  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34920  hypothetical protein  47.8 
 
 		 494 aa  472  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.195205  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1640  hypothetical protein  47.74 
 
 		 498 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.616022  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3741  hypothetical protein  47.45 
 
 		 498 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.733185  decreased coverage  0.00529979 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2533  protein of unknown function DUF344  47.13 
 
 		 491 aa  466  9.999999999999999e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3113  hypothetical protein  44.55 
 
 		 490 aa  463  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.895216  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0486  protein of unknown function DUF344  47.51 
 
 		 495 aa  443  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0834  protein of unknown function DUF344  42.44 
 
 		 549 aa  403  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0493  hypothetical protein  41.89 
 
 		 494 aa  402  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.429622 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2786  hypothetical protein  41.77 
 
 		 535 aa  400  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1024  polyphosphate:AMP phosphotransferase  41.45 
 
 		 499 aa  398  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0970051  normal  0.793106 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1080  hypothetical protein  41.07 
 
 		 532 aa  390  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0333  protein of unknown function DUF344  41.98 
 
 		 486 aa  389  1e-107  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0250  protein of unknown function DUF344  41.03 
 
 		 497 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.328476 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2483  hypothetical protein  43.64 
 
 		 496 aa  379  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0802177  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4140  protein of unknown function DUF344  39.5 
 
 		 496 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4180  protein of unknown function DUF344  39.5 
 
 		 496 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1989  protein of unknown function DUF344  38.51 
 
 		 490 aa  372  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.210937 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1052  hypothetical protein  37.64 
 
 		 496 aa  358  9.999999999999999e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0280365  normal  0.329166 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2856  polyphosphate:AMP phosphotransferase  37.12 
 
 		 502 aa  352  8.999999999999999e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10057  hitchhiker  0.00199594 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1051  hypothetical protein  39.53 
 
 		 494 aa  347  4e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0734812 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1612  hypothetical protein  34.85 
 
 		 498 aa  322  9.999999999999999e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01720  hypothetical protein  35.32 
 
 		 549 aa  319  9e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04180  hypothetical protein  33.67 
 
 		 609 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.648389  normal  0.925232 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0721  protein of unknown function DUF344  33.57 
 
 		 578 aa  291  2e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000055361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1576  protein of unknown function DUF344  32.16 
 
 		 492 aa  291  2e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000036062  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2140  hypothetical protein  31.68 
 
 		 474 aa  267  5e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0690  hypothetical protein  32.73 
 
 		 556 aa  260  6e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1100  hypothetical protein  55.84 
 
 		 288 aa  254  2.0000000000000002e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00431541  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0715  polyphosphate:AMP phosphotransferase  31.88 
 
 		 551 aa  249  6e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0787  hypothetical protein  32.66 
 
 		 556 aa  241  2e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3513  UDP-galactose-lipid carrier transferase  51.52 
 
 		 267 aa  237  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1829  UDP-galactose-lipid carrier transferase  51.52 
 
 		 267 aa  237  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1668  UDP-galactose-lipid carrier transferase  49.58 
 
 		 270 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1644  UDP-galactose-lipid carrier transferase  49.58 
 
 		 270 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1868  hypothetical protein  49.58 
 
 		 270 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.00208e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1945  hypothetical protein  49.17 
 
 		 270 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.180393  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1688  hypothetical protein  49.15 
 
 		 254 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1823  hypothetical protein  49.15 
 
 		 254 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.180216  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1909  hypothetical protein  49.36 
 
 		 270 aa  233  9e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1685  hypothetical protein  48.72 
 
 		 270 aa  231  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4840  protein of unknown function DUF344  50.62 
 
 		 259 aa  231  4e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1433  hypothetical protein  52.88 
 
 		 270 aa  227  3e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3985  protein of unknown function DUF344  49.79 
 
 		 258 aa  227  5.0000000000000005e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0309  hypothetical protein  42.95 
 
 		 308 aa  216  9e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0044  hypothetical protein  48.62 
 
 		 261 aa  210  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000123179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3210  hypothetical protein  51.78 
 
 		 264 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1749  hypothetical protein  52.36 
 
 		 263 aa  204  3e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.462127  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01607  UDP-galactose-lipid carrier transferase MED92  43.97 
 
 		 279 aa  197  4.0000000000000005e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1841  hypothetical protein  38.43 
 
 		 318 aa  167  6.9999999999999995e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0091091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0814  hypothetical protein  39.27 
 
 		 292 aa  166  9e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0703207  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14061  hypothetical protein  38.32 
 
 		 309 aa  162  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.230834 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4669  protein of unknown function DUF344  37.56 
 
 		 320 aa  161  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.320669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16850  hypothetical protein  38.57 
 
 		 329 aa  160  4e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.502638  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2784  protein of unknown function DUF344  38.01 
 
 		 276 aa  160  5e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.669041  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4075  hypothetical protein  37.38 
 
 		 271 aa  160  6e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4701  hypothetical protein  39.9 
 
 		 285 aa  160  7e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.44507  decreased coverage  0.00228171 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1900  protein of unknown function DUF344  39.27 
 
 		 328 aa  159  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.276444  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1138  hypothetical protein  38.5 
 
 		 280 aa  158  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2353  hypothetical protein  37.72 
 
 		 294 aa  158  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146636  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1162  hypothetical protein  35.09 
 
 		 365 aa  158  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1297  protein of unknown function DUF344  38.5 
 
 		 280 aa  158  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1858  hypothetical protein  38.18 
 
 		 375 aa  159  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1595  putative polyphosphate kinase 2  35.04 
 
 		 289 aa  158  3e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0560788  normal  0.483146 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4762  hypothetical protein  32.84 
 
 		 383 aa  158  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1067  hypothetical protein  37.27 
 
 		 337 aa  157  4e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37617  normal  0.971255 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4120  protein of unknown function DUF344  36.15 
 
 		 277 aa  157  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.794478  hitchhiker  0.00182923 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1311  hypothetical protein  32.45 
 
 		 359 aa  157  6e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.833916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3855  hypothetical protein  36.48 
 
 		 308 aa  157  7e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0324  hypothetical protein  38.18 
 
 		 369 aa  156  8e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000113156 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4422  hypothetical protein  36.78 
 
 		 338 aa  156  8e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0730  protein of unknown function DUF344  36.2 
 
 		 316 aa  156  9e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1381  hypothetical protein  36.49 
 
 		 289 aa  155  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4684  hypothetical protein  32.79 
 
 		 367 aa  155  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1377  hypothetical protein  35.75 
 
 		 274 aa  155  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13261  transcriptional regulatory protein pvdS  36.2 
 
 		 295 aa  155  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.422206 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2647  hypothetical protein  36.62 
 
 		 274 aa  155  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1142  hypothetical protein  39.15 
 
 		 310 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.780408  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1170  protein of unknown function DUF344  37.5 
 
 		 278 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0866985 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4078  hypothetical protein  36.55 
 
 		 310 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2513  protein of unknown function DUF344  37.73 
 
 		 405 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197532  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24090  hypothetical protein  38.22 
 
 		 301 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.160014  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4287  hypothetical protein  37.56 
 
 		 324 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.322073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4178  hypothetical protein  36.36 
 
 		 324 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.622827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0187  protein of unknown function DUF344  37.33 
 
 		 296 aa  154  4e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.520088  normal  0.078005 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>