More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0149 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  100 
 
 		 407 aa  825    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  56.75 
 
 		 337 aa  365  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  57.36 
 
 		 333 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  57.23 
 
 		 328 aa  358  7e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  57.14 
 
 		 335 aa  354  2e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07411  carbohydrate kinase  53.57 
 
 		 342 aa  353  2.9999999999999997e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  56.74 
 
 		 333 aa  349  5e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  53.21 
 
 		 330 aa  347  3e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  53.21 
 
 		 330 aa  347  3e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  56.36 
 
 		 333 aa  345  7e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  56.36 
 
 		 333 aa  345  7e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  54.27 
 
 		 333 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  56.06 
 
 		 333 aa  344  1e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  56.19 
 
 		 331 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  56.06 
 
 		 333 aa  341  1e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  57.78 
 
 		 331 aa  341  1e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1668  carbohydrate kinase PfkB family  53.43 
 
 		 337 aa  340  2e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0690  carbohydrate kinase PfkB family  53.54 
 
 		 338 aa  341  2e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05061  carbohydrate kinase  49.85 
 
 		 348 aa  338  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0313242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2989  ribokinase-like domain-containing protein  56.35 
 
 		 338 aa  337  1.9999999999999998e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0581  PfkB  55.62 
 
 		 333 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  52.38 
 
 		 331 aa  335  1e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  54.08 
 
 		 337 aa  334  2e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  50.15 
 
 		 335 aa  332  9e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  55.8 
 
 		 333 aa  330  2e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  49.54 
 
 		 335 aa  329  6e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  53.54 
 
 		 337 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5046  ribokinase-like domain-containing protein  53.99 
 
 		 329 aa  327  2.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4021  PfkB  51.52 
 
 		 330 aa  327  3e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737193  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  52.41 
 
 		 337 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  52.41 
 
 		 337 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3378  ribokinase-like domain-containing protein  52.23 
 
 		 330 aa  322  5e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  49.39 
 
 		 330 aa  317  2e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  48.78 
 
 		 330 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  47.87 
 
 		 330 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  51.83 
 
 		 332 aa  305  7e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  51.26 
 
 		 338 aa  304  2.0000000000000002e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  41.32 
 
 		 338 aa  301  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  52.41 
 
 		 331 aa  301  2e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  45.51 
 
 		 334 aa  300  4e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  43.41 
 
 		 333 aa  291  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1030  pfkB family carbohydrate kinase  49.84 
 
 		 330 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.577037  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  42.81 
 
 		 333 aa  285  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2022  ribokinase-like domain-containing protein  53.92 
 
 		 330 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2691  ribokinase-like domain-containing protein  49.53 
 
 		 330 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.272607  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  46.01 
 
 		 330 aa  281  1e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3022  PfkB domain protein  47.08 
 
 		 333 aa  278  2e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523599  normal  0.417909 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1671  PfkB  44.76 
 
 		 331 aa  273  3e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0198  ribokinase-like domain-containing protein  48.73 
 
 		 330 aa  270  5e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2568  ribokinase-like domain-containing protein  44.58 
 
 		 333 aa  240  4e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2872  ribokinase-like domain-containing protein  42.32 
 
 		 335 aa  227  4e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  37.43 
 
 		 336 aa  210  4e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  36.96 
 
 		 328 aa  189  5.999999999999999e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  37.9 
 
 		 328 aa  188  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  35.87 
 
 		 330 aa  186  6e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1910  carbohydrate kinase  34.23 
 
 		 339 aa  184  3e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000704659  hitchhiker  0.00127543 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  35.78 
 
 		 331 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  31.9 
 
 		 327 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  31.9 
 
 		 327 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  38.59 
 
 		 328 aa  178  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  38.41 
 
 		 360 aa  177  2e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2200  PfkB  33.85 
 
 		 339 aa  177  3e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000468276  decreased coverage  0.00888496 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1845  ribokinase-like domain-containing protein  33.23 
 
 		 341 aa  169  9e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273033  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2764  PfkB  35.99 
 
 		 370 aa  169  9e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.040802  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0055  ribokinase-like domain-containing protein  35.46 
 
 		 334 aa  155  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.747338  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  31.37 
 
 		 304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  33.33 
 
 		 297 aa  106  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  30.86 
 
 		 302 aa  103  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  34.23 
 
 		 300 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  33.08 
 
 		 288 aa  99.4  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  33.95 
 
 		 303 aa  97.1  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  30.11 
 
 		 308 aa  95.9  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  34.15 
 
 		 304 aa  93.2  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1530  inosine kinase  30.71 
 
 		 442 aa  92.4  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00064994  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  31.99 
 
 		 309 aa  92.4  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18364  predicted protein  33.77 
 
 		 273 aa  91.7  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.132458 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2129  putative sugar kinase  30.15 
 
 		 298 aa  90.1  6e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  29.66 
 
 		 317 aa  90.1  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04860  argininosuccinate lyase  30.31 
 
 		 823 aa  88.2  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1431  inosine kinase  28.63 
 
 		 434 aa  87.8  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000183569  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2845  inosine kinase  28 
 
 		 434 aa  87.4  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000469104  decreased coverage  0.00000000256797 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  28.78 
 
 		 309 aa  87.4  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1799  inosine kinase  29.6 
 
 		 434 aa  86.7  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00398478  hitchhiker  0.000000265344 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  29.68 
 
 		 312 aa  86.3  9e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0967  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  26.2 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0230959  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2385  PfkB domain-containing protein  30.92 
 
 		 297 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.790997  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  26.56 
 
 		 322 aa  82.8  0.000000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3227  inosine kinase  28.42 
 
 		 432 aa  82.4  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00215137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05942  inosine-guanosine kinase  25.43 
 
 		 434 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2903  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  24.82 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.859362  hitchhiker  0.00094244 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2228  inosine kinase  27.2 
 
 		 434 aa  82  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0216466  hitchhiker  0.00128428 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1541  inosine kinase  27.45 
 
 		 434 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.209586  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1135  PfkB domain protein  25.71 
 
 		 644 aa  80.5  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.488845 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2659  inosine kinase  27.21 
 
 		 434 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0486522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2582  inosine kinase  27.21 
 
 		 434 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00525217  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1802  Inosine kinase  27.21 
 
 		 434 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0521986  hitchhiker  0.0000108014 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2544  inosine kinase  27.21 
 
 		 434 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.247957  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4660  ribokinase-like domain-containing protein  27.15 
 
 		 642 aa  80.5  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  31.17 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5895  sugar kinase, putative  30.24 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  0.0122717 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>