82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4969 on replicon NC_010683
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010683  Rpic_4969  ParB-like nuclease  100 
 
 		 295 aa  588  1e-167  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.522723 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5399  ParB domain protein nuclease  94.95 
 
 		 623 aa  500  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.883883  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2219  ParB-like nuclease  39.34 
 
 		 667 aa  157  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.488609  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2943  nuclease  35.38 
 
 		 683 aa  137  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24471  normal  0.819404 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2465  ParB-like nuclease  33.33 
 
 		 658 aa  132  9e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31190  hypothetical protein  34.52 
 
 		 684 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126349  unclonable  1.05034e-21 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2612  ParB domain protein nuclease  34.2 
 
 		 679 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1870  ParB domain protein nuclease  34.16 
 
 		 684 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3033  ParB family protein  35.61 
 
 		 688 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2733  nuclease  35.61 
 
 		 688 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2322  nuclease  34.64 
 
 		 682 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2078  ParB domain protein nuclease  34.94 
 
 		 677 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0680  nuclease  34.43 
 
 		 681 aa  122  9e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3672  nuclease  33.93 
 
 		 715 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3808  nuclease  31.83 
 
 		 694 aa  118  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1245  ParB family protein  33.69 
 
 		 683 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.034848 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3534  ParB domain protein nuclease  34.26 
 
 		 687 aa  117  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2640  ParB family protein  34.04 
 
 		 690 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.587748  normal  0.035821 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0467  nuclease  37.74 
 
 		 687 aa  116  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1478  ParB family protein  35.14 
 
 		 680 aa  113  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1277  ParB domain protein nuclease  33.45 
 
 		 689 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4159  nuclease  31.84 
 
 		 679 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.841229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6194  nuclease  27.78 
 
 		 751 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0926146  normal  0.731953 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2859  ParB-like nuclease  30.56 
 
 		 726 aa  107  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0315  nuclease  31.29 
 
 		 636 aa  105  7e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3740  nuclease  33.92 
 
 		 692 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5564  ParB domain protein nuclease  30.25 
 
 		 759 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0978774 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7310  putative ParB-like nuclease  29.69 
 
 		 528 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2572  ParB family protein  32.48 
 
 		 765 aa  102  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1781  putative plasmid stabilization protein  32.95 
 
 		 727 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.901173 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6053  nuclease  29.91 
 
 		 694 aa  100  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2781  ParB domain protein nuclease  30.72 
 
 		 714 aa  98.6  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1059  ParB domain protein nuclease  29.8 
 
 		 685 aa  97.4  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0068  plasmid partition protein B  26.64 
 
 		 652 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.878087 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0054  ParB-like partition protein  28.19 
 
 		 654 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.737762 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3513  nuclease  29.85 
 
 		 706 aa  95.9  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557046 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1222  nuclease  29.85 
 
 		 706 aa  95.9  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0380  ParB family protein  34.2 
 
 		 713 aa  94.7  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0053  ParB-like partition protein  27.13 
 
 		 652 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172926  hitchhiker  0.000557548 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9896  transcriptional regulator  31.6 
 
 		 645 aa  93.2  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3031  nuclease  29.79 
 
 		 712 aa  93.6  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.578661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4025  parB-like partition protein  28.72 
 
 		 687 aa  92.4  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.934499  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0538  ParB family protein  32.16 
 
 		 714 aa  92  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0024  plasmid partition protein B  27.38 
 
 		 654 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0011  hypothetical protein  24.81 
 
 		 422 aa  92  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6935  nuclease  30.35 
 
 		 709 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146149  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8287  ParB domain protein nuclease  29.05 
 
 		 709 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.246382  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0192  ParB family protein  29.49 
 
 		 703 aa  91.3  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3060  ParB domain protein nuclease  28.61 
 
 		 714 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0550  parB-like partition protein  35.08 
 
 		 615 aa  90.5  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0477  putative ParB-like nuclease  34.1 
 
 		 754 aa  90.5  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.487335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4579  parB-like partition protein  28.76 
 
 		 687 aa  90.1  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914169  normal  0.147919 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0571  parB-like partition protein  29.32 
 
 		 687 aa  89.7  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.462321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6483  ParB domain protein nuclease  34.56 
 
 		 740 aa  89.7  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.656524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3920  ParB-like nuclease  28.12 
 
 		 703 aa  89.7  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3567  ParB-like nuclease  29.28 
 
 		 703 aa  89  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1474  ParB family protein  30.22 
 
 		 577 aa  89  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2123  hypothetical protein  28.95 
 
 		 717 aa  87.8  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0771  nuclease  33.18 
 
 		 708 aa  87  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0139  ParB domain-containing protein  25.19 
 
 		 669 aa  87  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000818484 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2858  nuclease  30.07 
 
 		 709 aa  87  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0970138 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2346  putative DNA-binding protein  31.46 
 
 		 536 aa  86.7  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.598568  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7409  hypothetical protein  27.9 
 
 		 546 aa  86.7  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3151  hypothetical protein  29.18 
 
 		 716 aa  86.7  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.258373  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6187  ParB domain protein nuclease  31.8 
 
 		 711 aa  85.9  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00276297 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2520  ParB-like nuclease  28.52 
 
 		 694 aa  85.5  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.216239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4594  putative plasmid stabilization protein  28.52 
 
 		 696 aa  85.1  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473967  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7711  hypothetical protein  28.36 
 
 		 582 aa  85.1  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320471 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4602  parB-like partition protein  34.88 
 
 		 654 aa  84  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.469215  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2617  hypothetical protein  35.24 
 
 		 597 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4923  parB-like partition protein  27.78 
 
 		 706 aa  79.3  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.953106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4146  ParB-like nuclease  28.5 
 
 		 717 aa  77.8  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0488845  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3819  hypothetical protein  29.46 
 
 		 723 aa  77  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4273  nuclease  26.42 
 
 		 670 aa  75.1  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1541  parB-like partition proteins  31.25 
 
 		 708 aa  75.5  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79146  normal  0.0178306 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3333  putative plasmid stabilization protein  26.07 
 
 		 577 aa  73.6  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2659  hypothetical protein  27.73 
 
 		 713 aa  70.1  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.603455  normal  0.436395 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0730  nuclease  30.63 
 
 		 734 aa  66.2  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.232794  normal  0.968585 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2198  ParB family protein  28.08 
 
 		 662 aa  54.7  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776578  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0428  parB-like partition proteins  24.32 
 
 		 662 aa  48.5  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.62662  normal  0.628869 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3089  hypothetical protein  36.36 
 
 		 369 aa  46.2  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.762612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3925  parB-like partition protein  25.86 
 
 		 690 aa  43.1  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>