More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4108 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4108  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 270 aa  548  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.24138 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4220  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 270 aa  548  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3299  alpha/beta hydrolase fold  65.22 
 
 		 259 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5458  alpha/beta hydrolase fold  57.88 
 
 		 285 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3602  alpha/beta hydrolase fold  57.84 
 
 		 280 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.949623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3803  alpha/beta hydrolase fold  58.5 
 
 		 265 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.695303 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4645  alpha/beta hydrolase fold  59.45 
 
 		 265 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.917363  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3718  alpha/beta hydrolase fold  59.45 
 
 		 265 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0380543 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2393  Alpha/beta hydrolase  55.84 
 
 		 286 aa  294  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.590588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0322  lactonase  57.81 
 
 		 277 aa  288  6e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4964  alpha/beta hydrolase fold  55.38 
 
 		 275 aa  286  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5009  alpha/beta hydrolase fold  52.9 
 
 		 288 aa  280  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.97318  normal  0.569979 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0554  lactonase  54.23 
 
 		 390 aa  262  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0377  alpha/beta fold family hydrolase  54.23 
 
 		 277 aa  260  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0364  alpha/beta fold family hydrolase  53.85 
 
 		 277 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1771  alpha/beta hydrolase fold protein  53.73 
 
 		 279 aa  257  1e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26310  Alpha/beta hydrolase fold protein  52.55 
 
 		 275 aa  257  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.201822  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4621  alpha/beta hydrolase fold  48.15 
 
 		 285 aa  230  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3398  Alpha/beta hydrolase fold  38.79 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2830  Alpha/beta hydrolase fold  35.83 
 
 		 257 aa  163  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3406  putative hydrolase-related protein  37.86 
 
 		 266 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2862  Alpha/beta hydrolase fold  37.01 
 
 		 271 aa  151  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3026  hypothetical protein  39.18 
 
 		 277 aa  150  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0897  putative lactonase (box pathway)  36.4 
 
 		 287 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0425746  normal  0.277892 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2949  alpha/beta hydrolase fold  36.93 
 
 		 271 aa  149  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.545682  normal  0.28971 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4372  alpha/beta family hydrolase  36.86 
 
 		 270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.686172 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1623  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 		 280 aa  145  9e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0882  hypothetical protein  35.71 
 
 		 276 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1328  Alpha/beta hydrolase fold  35.39 
 
 		 271 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1544  alpha/beta hydrolase fold protein  35.71 
 
 		 284 aa  139  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0088  alpha/beta hydrolase fold protein  33.87 
 
 		 267 aa  138  8.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3654  alpha/beta hydrolase fold  34.68 
 
 		 272 aa  136  4e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2701  alpha/beta hydrolase fold  32.79 
 
 		 284 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.832615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0215  alpha/beta hydrolase  34.68 
 
 		 271 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.296554  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4655  Alpha/beta hydrolase  34.87 
 
 		 273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.875827 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1418  putative lactonase (box pathway)  33.74 
 
 		 282 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.104299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0748  alpha/beta family hydrolase  35.77 
 
 		 267 aa  129  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1225  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 		 271 aa  125  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16662  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0879  alpha/beta hydrolase fold  33.73 
 
 		 273 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.46004  normal  0.445527 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0742  alpha/beta hydrolase fold  34.17 
 
 		 273 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0670  alpha/beta hydrolase  35.27 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4734  alpha/beta hydrolase fold  32.53 
 
 		 264 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.590817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  26.49 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1010  alpha/beta family hydrolase  33.12 
 
 		 176 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.47639 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  25.68 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4719  alpha/beta hydrolase fold protein  27.04 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1120  alpha/beta fold family hydrolase  24.57 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00823936  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0931  alpha/beta hydrolase fold family lipase  24.57 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000302651  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4241  hydrolase, alpha/beta fold family  23.63 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0213697  hitchhiker  0.0000000245564 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1186  hydrolase, alpha/beta fold family  24.57 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000004858  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0939  alpha/beta hydrolase fold family lipase  24.14 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150383  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1100  hydrolase, alpha/beta fold family  24.14 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59036e-57 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1057  hydrolase, alpha/beta fold family  24.24 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000161202  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0953  alpha/beta fold family hydrolase  24.14 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1019  alpha/beta fold family hydrolase  24.14 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00544898  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7077  3-oxoadipate enol-lactonase  25.98 
 
 		 269 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  25.89 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0940  alpha/beta hydrolase fold  23.28 
 
 		 290 aa  62  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178351  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  36.11 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  24.05 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0312  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  30.73 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  26.9 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3194  alpha/beta hydrolase fold  30.64 
 
 		 309 aa  58.9  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0270844 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  36.22 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3071  alpha/beta hydrolase fold  21.03 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.357729  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3841  alpha/beta hydrolase fold  30.89 
 
 		 267 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.819174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  27.13 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4707  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 		 293 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00298325  normal  0.911417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1031  alpha/beta hydrolase fold protein  32.54 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  0.157173 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.85 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3768  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 		 267 aa  57  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2532  hypothetical protein  25.1 
 
 		 292 aa  57  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1136  alpha/beta hydrolase fold  25.82 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2882  alpha/beta hydrolase fold  25.88 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.035123 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  24.32 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4197  alpha/beta hydrolase fold protein  31.13 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1877  alpha/beta hydrolase fold protein  23.47 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.175585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  24.81 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2132  hypothetical protein  27.62 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  23.79 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3174  alpha/beta hydrolase fold protein  23.79 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  28.3 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  29.54 
 
 		 312 aa  55.8  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3966  alpha/beta hydrolase fold  30.89 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  25.94 
 
 		 381 aa  55.5  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2389  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 298 aa  55.5  0.0000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.186959 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  40.38 
 
 		 350 aa  55.5  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4468  hydrolase, alpha/beta fold family  22.64 
 
 		 294 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  29.6 
 
 		 274 aa  55.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  24 
 
 		 279 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6061  alpha/beta hydrolase fold  37.98 
 
 		 301 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507305  normal  0.301702 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  31.01 
 
 		 285 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  31.01 
 
 		 285 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4501  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 		 285 aa  55.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.569639  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  26.51 
 
 		 263 aa  54.3  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11967  epoxide hydrolase ephB  33.33 
 
 		 356 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.36863  normal  0.493708 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0521  alpha/beta hydrolase fold  30.7 
 
 		 288 aa  54.3  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  23.61 
 
 		 297 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>