More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2413 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3842  pyruvate carboxylase., propionyl-CoA carboxylase  61.14 
 
 		 1090 aa  1274    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.735507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4792  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  59.42 
 
 		 1098 aa  1201    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1636  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  59.8 
 
 		 1103 aa  1254    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2997  pyruvate carboxylase., propionyl-CoA carboxylase  72.18 
 
 		 1112 aa  1474    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.717985  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3892  pyruvate carboxylase., propionyl-CoA carboxylase  55.85 
 
 		 1105 aa  1117    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.222877  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0228  pyruvate carboxylase  59.95 
 
 		 1102 aa  1281    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3899  propionyl-CoA carboxylase  60.36 
 
 		 610 aa  711    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2692  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  59.89 
 
 		 1091 aa  1305    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.246578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0325  putative carbamoyl-phosphate synthase/carboxyltransferase  48.82 
 
 		 1033 aa  964    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00413632  normal  0.277217 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0602  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  59.98 
 
 		 1102 aa  1257    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4069  acetyl-CoA carboxylase (biotin carboxylase and carboxyl transferase domains) / biotin carboxyl carrier protein  57.32 
 
 		 1126 aa  1150    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0299228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4971  putative carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  55.95 
 
 		 1152 aa  1098    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.266349  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1889  propionyl-CoA carboxylase  62.72 
 
 		 519 aa  692    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4464  pyruvate carboxylase., methylmalonyl-CoA carboxytransferase  55.96 
 
 		 1067 aa  1061    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0495259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1073  carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  57.36 
 
 		 1097 aa  1144    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.398596 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2867  pyruvate carboxylase, propionyl-CoA carboxylase  53.22 
 
 		 1094 aa  1175    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46320  putative pyruvate carboxylase  60.67 
 
 		 1095 aa  1243    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.948302  normal  0.0234216 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2019  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  93.74 
 
 		 1103 aa  2027    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1682  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  56.94 
 
 		 1097 aa  1104    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2413  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  100 
 
 		 1103 aa  2224    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.370889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3940  biotin carboxylase  60.89 
 
 		 1095 aa  1264    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1862  carboxyl transferase  62.76 
 
 		 602 aa  690    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00333639  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1872  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding protein  52.4 
 
 		 1054 aa  953    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2712  carboxyl transferase  54.88 
 
 		 524 aa  552  1e-155  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0757047  normal  0.0196449 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2710  propionyl-CoA carboxylase  54.47 
 
 		 503 aa  537  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.595961  normal  0.61988 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2679  propionyl-CoA carboxylase  54.28 
 
 		 503 aa  536  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2724  propionyl-CoA carboxylase  54.28 
 
 		 503 aa  536  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.173098 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0066  propionyl-CoA carboxylase  53.41 
 
 		 519 aa  530  1e-149  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0781  propionyl-CoA carboxylase  54.75 
 
 		 518 aa  525  1e-147  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.576525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1271  propionyl-CoA carboxylase  45.5 
 
 		 600 aa  516  1e-144  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0704  pyruvate carboxylase  45.06 
 
 		 1147 aa  390  1e-107  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2649  pyruvate carboxylase  46.74 
 
 		 1148 aa  392  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00733169  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5381  biotin carboxylase/biotin carboxyl carrier protein  43.03 
 
 		 579 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00681  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46.96 
 
 		 448 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4207  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  40.8 
 
 		 588 aa  387  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1196  pyruvate carboxylase  45.41 
 
 		 1150 aa  385  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3859  pyruvate carboxylase  45.43 
 
 		 1148 aa  383  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3690  pyruvate carboxylase  45.43 
 
 		 1148 aa  384  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3707  pyruvate carboxylase  45.22 
 
 		 1148 aa  384  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.863258  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0500  carbamoyl-phosphate synthase subunit L  43.7 
 
 		 577 aa  386  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.193791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4157  pyruvate carboxylase  45.43 
 
 		 1148 aa  383  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.820084  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3962  pyruvate carboxylase  45.43 
 
 		 1148 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0980  pyruvate carboxylase  46.62 
 
 		 1147 aa  385  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.125957  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1174  pyruvate carboxylase  45.41 
 
 		 1150 aa  385  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.810456  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3994  pyruvate carboxylase  45.22 
 
 		 1148 aa  382  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.882525  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3773  pyruvate carboxylase  45 
 
 		 1148 aa  382  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.333  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4050  pyruvate carboxylase  45.22 
 
 		 1148 aa  382  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.898796  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4065  pyruvate carboxylase  45.22 
 
 		 1148 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164116  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1190  pyruvate carboxylase  45.22 
 
 		 1148 aa  382  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0051  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase  46.58 
 
 		 448 aa  377  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2259  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46.14 
 
 		 448 aa  378  1e-103  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.571536  normal  0.652272 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01241  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46.3 
 
 		 447 aa  379  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.114391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1426  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  45.32 
 
 		 449 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1423  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  45.97 
 
 		 447 aa  376  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0516  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46.26 
 
 		 447 aa  375  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0701369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1043  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  42.95 
 
 		 476 aa  373  1e-102  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0421  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.86 
 
 		 448 aa  373  1e-102  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0622  biotin carboxylase-like  43.36 
 
 		 485 aa  374  1e-102  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1598  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  46.04 
 
 		 446 aa  374  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000269909  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1852  pyruvate carboxylase  45.67 
 
 		 1147 aa  375  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2022  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  45.83 
 
 		 446 aa  374  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0711095  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2019  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  45.63 
 
 		 446 aa  371  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274625  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03221  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  45.55 
 
 		 448 aa  373  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2591  pyruvate carboxylase subunit A  45.45 
 
 		 471 aa  372  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2451  carbamoyl-phosphate synthase subunit L  42.37 
 
 		 576 aa  371  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0140517  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00711  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.23 
 
 		 449 aa  371  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00721  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.74 
 
 		 449 aa  373  1e-101  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.249054  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2127  acetyl-CoA carboxylase/biotin carboxylase  45.75 
 
 		 445 aa  372  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0062  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.44 
 
 		 448 aa  372  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1480  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46.15 
 
 		 448 aa  373  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.841777 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1749  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  43.45 
 
 		 448 aa  370  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1455  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  45.1 
 
 		 449 aa  372  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2718  pyruvate carboxylase subunit A  45.02 
 
 		 471 aa  369  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1379  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  45.41 
 
 		 453 aa  369  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.34087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3891  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  45.53 
 
 		 525 aa  367  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0521  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  45.43 
 
 		 448 aa  369  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0922671  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0559  biotin carboxylase  45.22 
 
 		 449 aa  367  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000152062  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0696  pyruvate carboxylase  43.56 
 
 		 1137 aa  369  1e-100  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0984  biotin carboxylase / acetyl-coenzyme A carboxylase carboxyl transferase subunit alpha  45.2 
 
 		 446 aa  366  1e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000016105  normal  0.0128167 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0321  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  45.03 
 
 		 447 aa  366  1e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0373504  normal  0.0139821 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5845  biotin carboxylase  42.49 
 
 		 578 aa  365  3e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.249832  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00691  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  44.62 
 
 		 449 aa  365  3e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.36167  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3292  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP-binding  41.99 
 
 		 577 aa  365  4e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1183  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  44.05 
 
 		 455 aa  364  6e-99  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0716  hypothetical protein  44.85 
 
 		 454 aa  364  6e-99  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.404777 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5245  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  44.3 
 
 		 447 aa  363  7.0000000000000005e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05670  acetyl/propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  41.28 
 
 		 618 aa  363  8e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.512556  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4784  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  39.6 
 
 		 599 aa  363  9e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.324654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0029  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  45.37 
 
 		 450 aa  363  9e-99  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00270537  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0675  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  48.68 
 
 		 452 aa  363  1e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1826  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  45.37 
 
 		 446 aa  363  1e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000136846  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33770  acetyl/propionyl-CoA carboxylase, alpha subunit  48.47 
 
 		 467 aa  363  1e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1265  acetyl-CoA carboxylase biotin carboxylase subunit  46.09 
 
 		 448 aa  362  2e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0289407  hitchhiker  0.00381456 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1555  pyruvate carboxylase subunit A  49.34 
 
 		 471 aa  361  4e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.315854  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0868  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  42.58 
 
 		 577 aa  361  5e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2028  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  47.29 
 
 		 446 aa  360  7e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.256761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0235  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  44.37 
 
 		 448 aa  360  7e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4367  Carbamoyl-phosphate synthase L chain ATP- binding protein  40.23 
 
 		 584 aa  360  8e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.830439  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0290  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  44.42 
 
 		 448 aa  360  9e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2602  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  44.57 
 
 		 447 aa  360  9.999999999999999e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000536628  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>