More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2100 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2100  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 312 aa  613  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10597  normal  0.402692 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1776  protein of unknown function DUF6 transmembrane  95.83 
 
 		 308 aa  530  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1953  hypothetical protein  86.54 
 
 		 336 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0913359  normal  0.18464 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2271  hypothetical protein  71.19 
 
 		 308 aa  414  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0233167  normal  0.0209827 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2230  hypothetical protein  74.47 
 
 		 302 aa  381  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36446  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2217  hypothetical protein  66.43 
 
 		 302 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1415  protein of unknown function DUF6 transmembrane  65.49 
 
 		 286 aa  359  3e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0303245  normal  0.0347946 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2110  hypothetical protein  65.36 
 
 		 302 aa  358  6e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.244484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5885  hypothetical protein  65.71 
 
 		 302 aa  358  6e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2192  hypothetical protein  65.71 
 
 		 302 aa  358  6e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2231  hypothetical protein  65.71 
 
 		 302 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556701  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5521  hypothetical protein  65 
 
 		 297 aa  352  4e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1939  hypothetical protein  64.71 
 
 		 299 aa  344  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1938  hypothetical protein  65.17 
 
 		 299 aa  338  7e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0626  hypothetical protein  65.17 
 
 		 299 aa  338  7e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750963  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0529  hypothetical protein  65.17 
 
 		 299 aa  338  7e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2018  hypothetical protein  65.17 
 
 		 299 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0623689  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1084  hypothetical protein  64.91 
 
 		 299 aa  326  3e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4618  hypothetical protein  44.95 
 
 		 316 aa  214  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139965 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2869  hypothetical protein  45.03 
 
 		 320 aa  208  8e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1915  putative transmembrane protein  44.91 
 
 		 284 aa  200  3e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.827932  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1446  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42 
 
 		 315 aa  196  3e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2402  hypothetical protein  42 
 
 		 333 aa  194  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.766058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1732  hypothetical protein  46.36 
 
 		 307 aa  190  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132009 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2099  hypothetical protein  41.78 
 
 		 315 aa  188  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.637936  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1867  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.66 
 
 		 308 aa  185  8e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2862  hypothetical protein  42.37 
 
 		 318 aa  185  9e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1956  hypothetical protein  43.1 
 
 		 318 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209057  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1083  hypothetical protein  44.56 
 
 		 317 aa  176  6e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.396287 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0790  multidrug ABC transporter permease  63.31 
 
 		 154 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.544312  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1082  hypothetical protein  63.31 
 
 		 154 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0979018  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0791  multidrug ABC transporter permease  68.31 
 
 		 143 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.92484  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1083  putative integral membrane protein  68.31 
 
 		 143 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0682285  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4364  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.69 
 
 		 299 aa  152  8e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00133348  normal  0.499303 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0805  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.55 
 
 		 286 aa  149  5e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.55 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.55 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1141  hypothetical protein  30.42 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.432755  normal  0.40776 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  31.67 
 
 		 287 aa  116  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2617  hypothetical protein  29.51 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2469  hypothetical protein  28.82 
 
 		 304 aa  112  9e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2106  hypothetical protein  32.3 
 
 		 288 aa  112  9e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.535846  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.82 
 
 		 301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174107  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4184  hypothetical protein  30.72 
 
 		 319 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.91 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4706  hypothetical protein  30.23 
 
 		 319 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.783854  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01764  hypothetical protein  33 
 
 		 300 aa  106  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664216  normal  0.254773 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0900  hypothetical protein  30.9 
 
 		 325 aa  105  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4453  hypothetical protein  30.93 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.309026 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3801  hypothetical protein  30.06 
 
 		 319 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.900798  hitchhiker  0.00177681 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.51 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0640  putative transmembrane protein  33.09 
 
 		 301 aa  103  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.110184 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2372  hypothetical protein  31.79 
 
 		 311 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187274  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3563  hypothetical protein  30.61 
 
 		 331 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390712  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4804  hypothetical protein  30.61 
 
 		 331 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5479  hypothetical protein  30.61 
 
 		 310 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.293066 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  27.3 
 
 		 315 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.35 
 
 		 300 aa  95.1  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.226388  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2142  putative transmembrane protein  29.47 
 
 		 312 aa  90.1  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0704915  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1985  hypothetical protein  29.47 
 
 		 312 aa  90.1  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.09 
 
 		 320 aa  89.4  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.25 
 
 		 317 aa  86.3  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  28.32 
 
 		 308 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  27.89 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.19 
 
 		 301 aa  82.4  0.000000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  27.46 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4993  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  23.77 
 
 		 306 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.570492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0230  hypothetical protein  33.91 
 
 		 268 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1128  hypothetical protein  33.91 
 
 		 268 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.108059  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1569  hypothetical protein  33.91 
 
 		 268 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.051937  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  29.43 
 
 		 300 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3804  hypothetical protein  26.87 
 
 		 331 aa  81.6  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2006  mtultidrug ABC transporter permease  33.91 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0006  hypothetical protein  28.92 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  22.87 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  26.78 
 
 		 303 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  26.69 
 
 		 303 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  26.33 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  26.35 
 
 		 303 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0265  hypothetical protein  23.02 
 
 		 307 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.726467  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0328  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  24.15 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0605966  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  23.05 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0352  permease, drug/metabolite transporter  22.38 
 
 		 306 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.110507  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.46 
 
 		 309 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  27.48 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  27.24 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  25.17 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  25.96 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0739  hypothetical protein  28.52 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1888  transporter, drug/metabolite exporter family  26.92 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  27.24 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  25.76 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  26.88 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  26.88 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  26.41 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0257  DMT family permease  23.08 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  26.88 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  26.41 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  26.88 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  27.48 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>