More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4624 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4624  protein of unknown function DUF323  100 
 
 		 293 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6827  putative nitrate reductase  59.58 
 
 		 293 aa  338  8e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4272  hypothetical protein  45.1 
 
 		 289 aa  233  3e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4380  hypothetical protein  45.65 
 
 		 306 aa  232  6e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0237  putative NirV protein  48.12 
 
 		 290 aa  231  9e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0261  NirV protein, putative  48.12 
 
 		 306 aa  231  1e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.394932  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6277  hypothetical protein  44.75 
 
 		 304 aa  211  7.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11907  normal  0.121957 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1596  hypothetical protein  46.78 
 
 		 284 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  34.04 
 
 		 277 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  30.32 
 
 		 413 aa  94.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  29.09 
 
 		 616 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  28.64 
 
 		 657 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  28.77 
 
 		 291 aa  89.4  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  27.73 
 
 		 654 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3768  hypothetical protein  31.92 
 
 		 289 aa  85.1  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  30.18 
 
 		 292 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.69 
 
 		 554 aa  80.9  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  29.41 
 
 		 293 aa  80.1  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  29.96 
 
 		 535 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  30.22 
 
 		 570 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  32.24 
 
 		 433 aa  78.6  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  27.03 
 
 		 398 aa  77.4  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  30.87 
 
 		 523 aa  77  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  32.12 
 
 		 446 aa  76.3  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0904  hypothetical protein  34.16 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158237 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2806  hypothetical protein  29.74 
 
 		 292 aa  75.5  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.232459  normal  0.401097 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1451  hypothetical protein  28.14 
 
 		 952 aa  75.5  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00912397  normal  0.310535 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4215  hypothetical protein  29.02 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4092  hypothetical protein  34.13 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.189106  normal  0.479505 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0887  hypothetical protein  33.56 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1300  hypothetical protein  28.5 
 
 		 491 aa  73.9  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  24.71 
 
 		 586 aa  73.2  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10726  hypothetical protein  33.5 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.374727 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0760  protein of unknown function DUF323  35.97 
 
 		 329 aa  73.6  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3053  serine/threonine protein kinase  31.61 
 
 		 611 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454143  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  36.44 
 
 		 358 aa  71.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2339  protein of unknown function DUF323  31.43 
 
 		 775 aa  70.9  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1041  hypothetical protein  37.8 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000747209  normal  0.145038 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1024  hypothetical protein  37.8 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.000193215  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1053  hypothetical protein  37.8 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.354672  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2124  serine/threonine protein kinase  30.32 
 
 		 698 aa  70.1  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5038  hypothetical protein  39.34 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00125296  normal  0.382388 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  31.21 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  31.75 
 
 		 338 aa  69.3  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  28.81 
 
 		 517 aa  69.3  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3539  hypothetical protein  28.8 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  35.14 
 
 		 751 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  28.12 
 
 		 398 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  27.46 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.53 
 
 		 367 aa  67.8  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003599  hypothetical protein  35.34 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.218262  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  30.07 
 
 		 351 aa  67  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1169  protein of unknown function DUF323  31.4 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  33.85 
 
 		 882 aa  66.2  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0165  hypothetical protein  28.91 
 
 		 605 aa  66.2  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000147879  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0288  hypothetical protein  30.77 
 
 		 922 aa  66.2  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.922716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  32.22 
 
 		 390 aa  65.9  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1864  protein of unknown function DUF323  30.81 
 
 		 668 aa  66.2  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  30.56 
 
 		 829 aa  65.5  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1452  protein of unknown function DUF323  34.45 
 
 		 1053 aa  65.5  0.0000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  25.71 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2604  hypothetical protein  29.44 
 
 		 497 aa  65.1  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  36.63 
 
 		 603 aa  65.1  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0228  protein of unknown function DUF323  28.67 
 
 		 276 aa  64.7  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  30.77 
 
 		 348 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2681  hypothetical protein  33.33 
 
 		 337 aa  64.7  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1004  protein of unknown function DUF323  25.74 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.302602  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  33.63 
 
 		 1196 aa  64.7  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  30.77 
 
 		 348 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2673  hypothetical protein  36.09 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3787  hypothetical protein  30 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2864  hypothetical protein  30.18 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6898  protein of unknown function DUF323  32.03 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0821  hypothetical protein  37.86 
 
 		 624 aa  63.5  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2154  hypothetical protein  26.09 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0257018  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1679  hypothetical protein  26.35 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.1989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  32.85 
 
 		 892 aa  63.2  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  34.23 
 
 		 826 aa  63.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  29.45 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0602  protein of unknown function DUF323  27.78 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0325143  normal  0.360547 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  34.19 
 
 		 742 aa  62.8  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33710  PvdO  30.18 
 
 		 284 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000619204  normal  0.0102341 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1964  hypothetical protein  26.5 
 
 		 288 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00574868  normal  0.693869 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2349  protein of unknown function DUF323  30.68 
 
 		 1186 aa  62.4  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.719002  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0462  serine/threonine protein kinase  30.11 
 
 		 625 aa  62.4  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04261  hypothetical protein  29.17 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.65 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0811  protein of unknown function DUF323  31.32 
 
 		 299 aa  62  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1144  hypothetical protein  33.33 
 
 		 300 aa  62  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.617976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1851  hypothetical protein  27.85 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0856  hypothetical protein  35.14 
 
 		 923 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1048  hypothetical protein  30.05 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  0.0129984 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  30.92 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4072  serine/threonine protein kinase  28.95 
 
 		 639 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  34.4 
 
 		 636 aa  61.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4035  serine/threonine protein kinase  28.95 
 
 		 639 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1133  hypothetical protein  25.94 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.571519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  33.93 
 
 		 586 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2998  protein of unknown function DUF323  35.83 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.012467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  26.86 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>