More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3203 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3203  Sel1 domain protein repeat-containing protein  100 
 
 		 273 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.681346  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2765  Sel1-like protein  87.55 
 
 		 273 aa  497  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2805  Sel1  86.08 
 
 		 273 aa  454  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.513793 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2495  Sel1-like  78.15 
 
 		 267 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00300273  normal  0.506926 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1754  Sel1-like  76.09 
 
 		 273 aa  417  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1811  Sel1 repeat-containing protein  77.34 
 
 		 256 aa  377  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.585081  normal  0.966546 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4455  putative exopolysaccharide regulatory protein exoR  75 
 
 		 240 aa  360  2e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4238  Sel1 domain-containing protein  55.96 
 
 		 310 aa  278  7e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.204319  normal  0.875894 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5367  Sel1 domain protein repeat-containing protein  48.5 
 
 		 290 aa  226  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0613059  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5057  Sel1 domain-containing protein  57.14 
 
 		 269 aa  224  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.60618  hitchhiker  0.00255327 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1910  Sel1 domain protein repeat-containing protein  53.5 
 
 		 295 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523884 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1863  Sel1 domain-containing protein  46.88 
 
 		 342 aa  214  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1955  Sel1 domain-containing protein  50.24 
 
 		 295 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.342903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2231  Sel1 domain protein repeat-containing protein  50.24 
 
 		 295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.414205 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2923  Sel1 domain-containing protein  52.97 
 
 		 300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1685  Sel1 domain protein repeat-containing protein  45.52 
 
 		 280 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.132185 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0863  exopolysacchride production negative regulator exoR  43.07 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0872  exopolysacchride production negative regulator exoR  43.07 
 
 		 267 aa  150  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2356  Sel1 domain-containing protein  41.06 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2681  exopolysaccharide production negative regulator  38.21 
 
 		 271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0471275  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1687  Sel1 repeat-containing protein  35.74 
 
 		 268 aa  138  7.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1153  Sel1 domain-containing protein  33.96 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1478  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.14 
 
 		 267 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.902577 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1676  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.14 
 
 		 267 aa  125  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  36.2 
 
 		 1402 aa  82.8  0.000000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  35.98 
 
 		 789 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  31.22 
 
 		 1037 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3011  Sel1 domain-containing protein  31.9 
 
 		 278 aa  79  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.39 
 
 		 890 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  32.74 
 
 		 684 aa  77  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  32.95 
 
 		 271 aa  75.9  0.0000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  30.95 
 
 		 254 aa  75.1  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  37.2 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  30.91 
 
 		 961 aa  73.2  0.000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  33.93 
 
 		 490 aa  72  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  34.16 
 
 		 342 aa  71.6  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  33.93 
 
 		 490 aa  70.1  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.16 
 
 		 1012 aa  69.7  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  30.06 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  31.95 
 
 		 831 aa  69.7  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.52 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  35.15 
 
 		 416 aa  68.9  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  33.16 
 
 		 376 aa  68.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  30.5 
 
 		 373 aa  68.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  30.05 
 
 		 376 aa  68.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  31.58 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.03 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  28.04 
 
 		 838 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  30.5 
 
 		 373 aa  67  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  30.38 
 
 		 2413 aa  67  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1207  Sel1 domain-containing protein  32.75 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.838617  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  32.26 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  32.7 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.98 
 
 		 528 aa  65.9  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  30.95 
 
 		 393 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  32.91 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.76 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  30.34 
 
 		 489 aa  64.3  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  31.65 
 
 		 1877 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2074  Sel1 repeat-containing protein  36.21 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00000314497  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.93 
 
 		 865 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  29.55 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  30.77 
 
 		 425 aa  63.5  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.34 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2652  Sel1 domain-containing protein  31.06 
 
 		 410 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.52998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  31.9 
 
 		 557 aa  63.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4037  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.26 
 
 		 1196 aa  62.8  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0661  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.94 
 
 		 512 aa  62.8  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0882  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.41 
 
 		 1110 aa  62.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574847  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  26.29 
 
 		 329 aa  62.4  0.000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0312  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.82 
 
 		 322 aa  62.4  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.109575 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  27.23 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  29.17 
 
 		 1002 aa  62.4  0.000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  27.91 
 
 		 278 aa  62  0.000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  32.93 
 
 		 464 aa  62  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  31.11 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.12 
 
 		 392 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  30.25 
 
 		 448 aa  61.2  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  29.94 
 
 		 693 aa  60.8  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.38 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  30.81 
 
 		 1059 aa  60.5  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  29.94 
 
 		 1032 aa  60.1  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1651  hypothetical protein  32.73 
 
 		 362 aa  60.1  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.563504  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  29.84 
 
 		 1493 aa  60.1  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3097  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.53 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1708  hypothetical protein  32.73 
 
 		 362 aa  59.7  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  30.38 
 
 		 685 aa  59.7  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2768  Sel1 domain-containing protein  33.13 
 
 		 403 aa  59.7  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0225  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.07 
 
 		 347 aa  59.3  0.00000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.35 
 
 		 346 aa  59.3  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3079  Sel1 domain-containing protein  33.12 
 
 		 384 aa  58.9  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0573421  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  31.68 
 
 		 380 aa  58.9  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  29.75 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  27.37 
 
 		 482 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0812  hypothetical protein  28.06 
 
 		 1160 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940934  normal  0.237847 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0307  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.16 
 
 		 811 aa  58.2  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2447  hypothetical protein  35.48 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  29.56 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  35.42 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>