More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1874 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1874  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 		 291 aa  596  1e-169  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0589357  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3855  MCP methyltransferase, CheR-type  85.57 
 
 		 291 aa  531  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1494  protein-glutamate O-methyltransferase  85.62 
 
 		 292 aa  524  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3801  MCP methyltransferase, CheR-type  84.69 
 
 		 294 aa  518  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0527  MCP methyltransferase, CheR-type  73.19 
 
 		 289 aa  427  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3916  MCP methyltransferase, CheR-type  71.84 
 
 		 289 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.186094  normal  0.509616 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4243  MCP methyltransferase, CheR-type  68.57 
 
 		 290 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.115502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3372  MCP methyltransferase, CheR-type  70.61 
 
 		 288 aa  419  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.491763  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6555  MCP methyltransferase, CheR-type  70.38 
 
 		 289 aa  415  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal  0.205146 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3674  protein-glutamate O-methyltransferase  67.35 
 
 		 292 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1533  putative chemotaxis protein methyltransferase cheR  67.47 
 
 		 292 aa  411  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280544  normal  0.734911 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0524  MCP methyltransferase, CheR-type  67.71 
 
 		 288 aa  411  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.39989 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1821  MCP methyltransferase, CheR-type  68.15 
 
 		 292 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101872  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4031  MCP methyltransferase, CheR-type  60.15 
 
 		 287 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.236096  normal  0.66198 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0524  MCP methyltransferase, CheR-type  56.98 
 
 		 280 aa  342  4e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4834  MCP methyltransferase, CheR-type  56.57 
 
 		 296 aa  323  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.162738  hitchhiker  0.00821783 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1813  MCP methyltransferase, CheR-type  54.71 
 
 		 285 aa  322  4e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  0.138477 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1533  protein-glutamate O-methyltransferase  54.71 
 
 		 285 aa  322  4e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0781767 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1710  MCP methyltransferase, CheR-type  56.39 
 
 		 285 aa  321  7e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1695  MCP methyltransferase, CheR-type  55.23 
 
 		 289 aa  317  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0662  MCP methyltransferase, CheR-type  54.79 
 
 		 278 aa  294  1e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.893478 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1912  Protein-glutamate O-methyltransferase  51.88 
 
 		 278 aa  285  7e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0842494  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0322  Protein-glutamate O-methyltransferase  49.45 
 
 		 276 aa  267  2e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.191319  normal  0.294679 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3598  MCP methyltransferase, CheR-type  46.18 
 
 		 278 aa  246  4e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0123942  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30900  MCP methyltransferase, CheR-type  47.57 
 
 		 272 aa  241  1e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5002  MCP methyltransferase, CheR-type  44.24 
 
 		 274 aa  239  5e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1788  MCP methyltransferase, CheR-type  46.61 
 
 		 316 aa  238  5.999999999999999e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.275448  normal  0.703081 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0871  MCP methyltransferase, CheR-type  40.47 
 
 		 414 aa  224  9e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  44.03 
 
 		 276 aa  223  2e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.349462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2851  MCP methyltransferase, CheR-type  44.36 
 
 		 282 aa  221  9e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.188729 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2320  MCP methyltransferase, CheR-type  41.55 
 
 		 291 aa  219  5e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1529  MCP methyltransferase, CheR-type  42.46 
 
 		 273 aa  218  8.999999999999998e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3733  MCP methyltransferase, CheR-type  43.98 
 
 		 275 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0499524  normal  0.833336 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0095  MCP methyltransferase, CheR-type  43.91 
 
 		 275 aa  217  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1782  putative chemotaxis protein methyltransferase  43.56 
 
 		 274 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20760  putative chemotaxis protein methyltransferase  43.94 
 
 		 274 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1736  MCP methyltransferase, CheR-type  39.03 
 
 		 290 aa  214  9.999999999999999e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0460074 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4392  chemotaxis protein methyltransferase CheR  43.23 
 
 		 275 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1462  protein-glutamate O-methyltransferase  43.23 
 
 		 275 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3953  MCP methyltransferase, CheR-type  43.23 
 
 		 275 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4252  MCP methyltransferase, CheR-type  43.61 
 
 		 275 aa  212  7e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4228  MCP methyltransferase, CheR-type  37.36 
 
 		 274 aa  211  2e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1216  MCP methyltransferase, CheR-type  40.82 
 
 		 275 aa  209  5e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.189092  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1928  chemotaxis protein methyltransferase CheR  43.45 
 
 		 280 aa  206  5e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.495072  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3485  protein-glutamate O-methyltransferase  43.07 
 
 		 280 aa  205  6e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.405571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1344  MCP methyltransferase, CheR-type  42.7 
 
 		 277 aa  205  6e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.841955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2963  protein-glutamate O-methyltransferase  42.54 
 
 		 279 aa  202  6e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.643676  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1415  MCP methyltransferase, CheR-type  42.54 
 
 		 279 aa  202  6e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3101  protein-glutamate O-methyltransferase  42.54 
 
 		 279 aa  202  6e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2948  protein-glutamate O-methyltransferase  42.54 
 
 		 279 aa  202  6e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2598  protein-glutamate O-methyltransferase  42.91 
 
 		 279 aa  202  6e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1069  protein-glutamate O-methyltransferase  40.89 
 
 		 278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0178115  normal  0.0152511 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3251  chemotaxis protein methyltransferase CheR  41.79 
 
 		 279 aa  199  6e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1258  MCP methyltransferase, CheR-type  41.79 
 
 		 279 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1328  MCP methyltransferase, CheR-type  41.79 
 
 		 279 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1339  MCP methyltransferase, CheR-type  40.45 
 
 		 277 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1320  MCP methyltransferase, CheR-type  41.79 
 
 		 279 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1302  protein-glutamate O-methyltransferase  41.95 
 
 		 279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3088  protein-glutamate O-methyltransferase  41.57 
 
 		 277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2339  chemotaxis protein methyltransferase CheR  39.39 
 
 		 275 aa  197  3e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02929  chemotaxis protein methyltransferase CheR  40 
 
 		 276 aa  196  3e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.723494  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2319  protein-glutamate O-methyltransferase  41.57 
 
 		 277 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.945432  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0069  MCP methyltransferase, CheR-type  38.43 
 
 		 280 aa  196  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0892  MCP methyltransferase, CheR-type  38.96 
 
 		 275 aa  196  5.000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.763334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1430  MCP methyltransferase, CheR-type  39.15 
 
 		 267 aa  195  7e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1596  MCP methyltransferase, CheR-type  40.45 
 
 		 277 aa  194  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.935025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1160  MCP methyltransferase, CheR-type  40.67 
 
 		 277 aa  193  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0521  protein-glutamate O-methyltransferase  38.04 
 
 		 275 aa  193  3e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.644079  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3582  MCP methyltransferase, CheR-type  33.67 
 
 		 302 aa  193  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1177  protein-glutamate O-methyltransferase  39.93 
 
 		 275 aa  192  7e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0805405  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004174  chemotaxis protein methyltransferase CheR  38.26 
 
 		 275 aa  189  4e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01283  chemotaxis methyltransferase CheR  37.88 
 
 		 275 aa  188  7e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1793  chemotaxis protein methyltransferase CheR  38.26 
 
 		 275 aa  188  9e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3101  MCP methyltransferase, CheR-type  37.45 
 
 		 278 aa  187  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0448745  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0215  MCP methyltransferase, CheR-type  39.84 
 
 		 294 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.177352  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0163  MCP methyltransferase, CheR-type  38.52 
 
 		 280 aa  183  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2214  MCP methyltransferase, CheR-type  38.46 
 
 		 285 aa  182  7e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0183  protein-glutamate O-methyltransferase  38.13 
 
 		 280 aa  180  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3139  protein-glutamate O-methyltransferase  36.78 
 
 		 291 aa  178  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1476  chemotaxis protein methyltransferase CheR  36.23 
 
 		 276 aa  177  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2215  chemotaxis protein methyltransferase CheR  34.98 
 
 		 289 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.171483  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0987  MCP methyltransferase, CheR-type  33.69 
 
 		 283 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3267  MCP methyltransferase, CheR-type  36.78 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.335431  hitchhiker  0.0000324119 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0428  MCP methyltransferase, CheR-type  36.78 
 
 		 275 aa  167  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.235925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0925  MCP methyltransferase, CheR-type  34.65 
 
 		 271 aa  166  4e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2305  MCP methyltransferase, CheR-type  34.03 
 
 		 291 aa  166  4e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0295  chemotaxis protein methyltransferase CheR  35.38 
 
 		 277 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.468009  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3498  protein-glutamate O-methyltransferase  36.1 
 
 		 273 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0110  MCP methyltransferase, CheR-type  35.04 
 
 		 288 aa  165  8e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03244  chemotaxis protein methyltransferase CheR  33.2 
 
 		 284 aa  165  9e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0635  MCP methyltransferase, CheR-type  38.7 
 
 		 301 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3104  MCP methyltransferase, CheR-type  33.46 
 
 		 285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.575775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0878  MCP methyltransferase, CheR-type  35.91 
 
 		 275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2815  MCP methyltransferase, CheR-type  36.29 
 
 		 275 aa  163  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.904459  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0626  MCP methyltransferase, CheR-type  38.31 
 
 		 301 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.325159  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0579  MCP methyltransferase, CheR-type  34.48 
 
 		 280 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3943  MCP methyltransferase, CheR-type  35.38 
 
 		 290 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.331314  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0777  MCP methyltransferase, CheR-type  30.39 
 
 		 297 aa  160  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.152669  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3299  protein-glutamate O-methyltransferase  35.41 
 
 		 275 aa  160  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4027  MCP methyltransferase, CheR-type  35.38 
 
 		 290 aa  160  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000815784 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>