More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3851 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0569  winged helix family two component response transcriptional regulator  81.86 
 
 		 458 aa  761    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000188516  normal  0.315982 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3851  winged helix family two component response transcriptional regulator  100 
 
 		 459 aa  926    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0552  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.03 
 
 		 226 aa  65.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.496663 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1538  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.89 
 
 		 223 aa  59.7  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.705917  normal  0.0786085 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2969  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.04 
 
 		 246 aa  58.5  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.74 
 
 		 230 aa  58.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1939  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.85 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.117768  normal  0.104796 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0875  two component transcriptional regulator  37.18 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000486966  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4665  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 235 aa  57  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  0.209776 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  42.65 
 
 		 228 aa  57  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0798  two component transcriptional regulator  43.48 
 
 		 220 aa  57  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0821  two component transcriptional regulator  43.48 
 
 		 220 aa  57  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.321247  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4444  hypothetical protein  37.84 
 
 		 356 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.3549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  41.1 
 
 		 239 aa  56.6  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  41.1 
 
 		 239 aa  56.6  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2534  DNA-binding response regulator YycF  35.14 
 
 		 233 aa  55.5  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0018  two component transcriptional regulator  35.14 
 
 		 233 aa  55.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.70243  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.96 
 
 		 226 aa  55.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2570  response regulator receiver  34.62 
 
 		 236 aa  55.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.16396 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0018  response regulator receiver  35.14 
 
 		 233 aa  55.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0142  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.47 
 
 		 224 aa  55.1  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00974604  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  42.42 
 
 		 226 aa  55.1  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  39.19 
 
 		 239 aa  55.1  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0116  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  37.33 
 
 		 219 aa  55.1  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.856024  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2168  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.49 
 
 		 247 aa  54.7  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.222815 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  41.18 
 
 		 234 aa  55.1  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3391  two component transcriptional regulator  35.14 
 
 		 227 aa  55.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.141218  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5207  winged helix family two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 247 aa  54.7  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1498  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 247 aa  54.3  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3658  winged helix family two component response transcriptional regulator  34.25 
 
 		 220 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.04 
 
 		 226 aa  53.9  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1480  winged helix family two component response transcriptional regulator  34.25 
 
 		 221 aa  53.9  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.723328 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4483  two component transcriptional regulator  38.57 
 
 		 226 aa  53.9  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.759432  decreased coverage  0.000734691 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.67 
 
 		 226 aa  53.5  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  42.42 
 
 		 229 aa  53.5  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0287  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.73 
 
 		 229 aa  53.5  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00220806  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8286  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.71 
 
 		 266 aa  53.5  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.691187  normal  0.348936 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0275  two component transcriptional regulator  35.37 
 
 		 239 aa  53.5  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.295694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4937  two component transcriptional regulator  36.11 
 
 		 257 aa  53.1  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1256  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  37.18 
 
 		 236 aa  53.1  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.15 
 
 		 242 aa  52.8  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0834  two component transcriptional regulator  37.14 
 
 		 226 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.6033  unclonable  0.00000000040546 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  37.88 
 
 		 229 aa  52.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2766  two component transcriptional regulator  34.21 
 
 		 224 aa  52.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.327413  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  40.91 
 
 		 226 aa  53.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0213  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.15 
 
 		 238 aa  53.1  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0395409  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.24 
 
 		 229 aa  52.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.88 
 
 		 226 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0194  two component transcriptional regulator  34.15 
 
 		 251 aa  52.8  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3637  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.72 
 
 		 246 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0850  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.91 
 
 		 226 aa  52.4  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3069  two component transcriptional regulator  29.82 
 
 		 230 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467461  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  38.57 
 
 		 234 aa  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  38.57 
 
 		 234 aa  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  36.99 
 
 		 239 aa  52  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0095  two component transcriptional regulator  36.11 
 
 		 249 aa  52.4  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  36.25 
 
 		 228 aa  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0544  winged helix family two component response transcriptional regulator  36.36 
 
 		 167 aa  52  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2635  two component transcriptional regulator  31.3 
 
 		 239 aa  52.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.179803  normal  0.648849 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3869  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.74 
 
 		 239 aa  52.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05760  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  33.33 
 
 		 235 aa  52.4  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.184852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.4 
 
 		 236 aa  51.6  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5456  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.16 
 
 		 251 aa  51.2  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.228477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0819  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.99 
 
 		 246 aa  51.6  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0768  two component signal transduction response regulator  29.76 
 
 		 236 aa  51.6  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000566504  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2014  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 239 aa  51.6  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.193015 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  40.28 
 
 		 234 aa  51.6  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4036  two component transcriptional regulator  36.11 
 
 		 248 aa  51.6  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1193  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.67 
 
 		 240 aa  51.2  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4898  two component transcriptional regulator  36.11 
 
 		 247 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1467  two component transcriptional regulator  40.58 
 
 		 229 aa  51.2  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0237528  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4168  two component transcriptional regulator  35.71 
 
 		 237 aa  51.2  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.426048 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4515  two component transcriptional regulator  36.11 
 
 		 247 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  36.76 
 
 		 227 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31880  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  39.44 
 
 		 231 aa  51.2  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4602  two component transcriptional regulator  36.11 
 
 		 247 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  36.76 
 
 		 228 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1524  DNA binding response regulator  31.78 
 
 		 230 aa  50.8  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.731193  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  37.14 
 
 		 230 aa  50.8  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4619  two component transcriptional regulator  34.72 
 
 		 245 aa  50.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  36.76 
 
 		 228 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0328  two component transcriptional regulator  34.15 
 
 		 252 aa  50.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0867  two component transcriptional regulator  34.25 
 
 		 236 aa  50.8  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.145735  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1569  winged helix family two component response transcriptional regulator  35.21 
 
 		 236 aa  50.8  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000954897  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0896  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.64 
 
 		 226 aa  50.8  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.232326  hitchhiker  0.00518822 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  36.76 
 
 		 228 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2083  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.85 
 
 		 237 aa  50.8  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.873655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  35.62 
 
 		 235 aa  50.8  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  36.76 
 
 		 228 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.25 
 
 		 237 aa  50.8  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.8 
 
 		 235 aa  50.8  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0669  two component transcriptional regulator  35.53 
 
 		 239 aa  50.8  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.851863  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  34.25 
 
 		 235 aa  50.4  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  34.25 
 
 		 235 aa  50.4  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  34.25 
 
 		 235 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  34.25 
 
 		 235 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  34.25 
 
 		 235 aa  50.4  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  34.25 
 
 		 235 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  34.25 
 
 		 235 aa  50.4  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0421  two component transcriptional regulator  34.72 
 
 		 245 aa  50.4  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0518956  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>