More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4602 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4515  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 247 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4602  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 247 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4898  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 247 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5390  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.82 
 
 		 243 aa  123  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2918  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.63 
 
 		 232 aa  106  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3815  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.89 
 
 		 225 aa  106  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0278114  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3069  two component transcriptional regulator  30.7 
 
 		 230 aa  105  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467461  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.11 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0287  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.44 
 
 		 229 aa  102  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00220806  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2168  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.2 
 
 		 247 aa  102  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.222815 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0844  two component transcriptional regulator  28.7 
 
 		 235 aa  102  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1487  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.42 
 
 		 232 aa  102  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.487145  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.7 
 
 		 237 aa  102  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4619  two component transcriptional regulator  32.6 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0421  two component transcriptional regulator  34.31 
 
 		 245 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0518956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.82 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.68 
 
 		 233 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  29.91 
 
 		 234 aa  99.8  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  29.91 
 
 		 234 aa  99.8  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1071  two component transcriptional regulator, winged helix family  30 
 
 		 238 aa  99.4  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2729  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.8 
 
 		 228 aa  99  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981161  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  29.96 
 
 		 239 aa  99  6e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8335  response regulator receiver protein  34.1 
 
 		 239 aa  99  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1268  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.7 
 
 		 229 aa  99  6e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  29.96 
 
 		 239 aa  99  6e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.15 
 
 		 234 aa  99  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2534  DNA-binding response regulator YycF  29.96 
 
 		 233 aa  98.6  9e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4351  two component transcriptional regulator  29.86 
 
 		 245 aa  98.6  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.22 
 
 		 242 aa  97.8  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  30.09 
 
 		 235 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1924  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.39 
 
 		 225 aa  97.8  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  28.96 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  30.09 
 
 		 235 aa  97.8  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4168  DNA-binding response regulator  30.27 
 
 		 234 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  30.09 
 
 		 235 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  30.09 
 
 		 235 aa  97.1  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  30.09 
 
 		 235 aa  97.1  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  30.09 
 
 		 235 aa  97.1  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  30.09 
 
 		 235 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  30.09 
 
 		 235 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0018  two component transcriptional regulator  30.4 
 
 		 233 aa  97.1  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.70243  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1498  two component transcriptional regulator  28.88 
 
 		 247 aa  97.4  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  27.63 
 
 		 239 aa  97.4  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09340  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  29.95 
 
 		 223 aa  97.8  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.217912  normal  0.763127 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  30.09 
 
 		 235 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  30.09 
 
 		 235 aa  97.1  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0448  DNA-binding response regulator  28.19 
 
 		 234 aa  97.1  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.223302  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  29.65 
 
 		 235 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0018  response regulator receiver  30.4 
 
 		 233 aa  97.1  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.84 
 
 		 236 aa  97.1  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.96 
 
 		 224 aa  96.7  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.602411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1173  DNA-binding response regulator  30.27 
 
 		 234 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.423617  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.68 
 
 		 235 aa  96.7  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1453  two component transcriptional regulator  32.59 
 
 		 244 aa  96.7  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.952418  normal  0.0249242 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1017  response regulator  28.51 
 
 		 234 aa  96.3  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0627963  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1198  DNA-binding response regulator  28.51 
 
 		 234 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.885409 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4937  two component transcriptional regulator  27.88 
 
 		 257 aa  96.3  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4043  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.49 
 
 		 225 aa  95.9  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.728877  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24530  Response regulator KdpE  30.36 
 
 		 232 aa  96.3  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0689152  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  29.39 
 
 		 236 aa  95.5  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1963  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.63 
 
 		 246 aa  95.5  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.470012 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1936  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.63 
 
 		 246 aa  95.5  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0588  two component transcriptional regulator  29.55 
 
 		 227 aa  95.5  7e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1024  two component transcriptional regulator  26.03 
 
 		 224 aa  95.1  8e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3637  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.19 
 
 		 246 aa  95.1  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1955  DNA-binding response regulator  27.93 
 
 		 228 aa  95.1  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1529  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.11 
 
 		 228 aa  95.1  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1256  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  28.19 
 
 		 236 aa  95.1  9e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1275  DNA-binding response regulator  28.07 
 
 		 234 aa  95.1  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1218  DNA-binding response regulator  29.73 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1816  DNA-binding response regulator  27.93 
 
 		 254 aa  95.1  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2313  two component transcriptional regulator  26.87 
 
 		 228 aa  94.7  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0313786  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.45 
 
 		 236 aa  94.4  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2496  response regulator receiver  31.05 
 
 		 225 aa  94.7  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491467  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4365  two component transcriptional regulator  26.46 
 
 		 230 aa  94.4  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  28.7 
 
 		 235 aa  94.7  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5207  winged helix family two component transcriptional regulator  28.88 
 
 		 247 aa  94.7  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1021  two component transcriptional regulator  27.48 
 
 		 223 aa  94.7  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1102  DNA-binding response regulator  28.57 
 
 		 225 aa  94.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  27.48 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2015  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.13 
 
 		 228 aa  94.4  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  29.95 
 
 		 231 aa  93.6  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1018  response regulator  30.27 
 
 		 234 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.54503  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  30.36 
 
 		 242 aa  94  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  31.19 
 
 		 226 aa  94.4  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2805  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.14 
 
 		 224 aa  94.4  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.244907 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2286  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.28 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188753  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  27.48 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1040  DNA-binding response regulator  28.07 
 
 		 234 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7594  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.04 
 
 		 228 aa  93.6  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0426147 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0867  two component transcriptional regulator  30.9 
 
 		 236 aa  93.6  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.145735  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3169  regulatory protein VanR  25.56 
 
 		 229 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.16404  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1119  DNA-binding response regulator  28.07 
 
 		 234 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0042  response regulator  28.09 
 
 		 240 aa  93.2  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.382747  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0459  DNA-binding response regulator  27.31 
 
 		 234 aa  93.6  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.025631  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  28.07 
 
 		 235 aa  93.6  3e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1441  two component transcriptional regulator  31.98 
 
 		 247 aa  93.6  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167327  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  26.2 
 
 		 233 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1412  response regulator receiver protein  30.94 
 
 		 225 aa  92.8  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  0.0125199 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>