More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3665 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3665  beta-lactamase  100 
 
 		 357 aa  739    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0612912 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5567  beta-lactamase  37.39 
 
 		 351 aa  199  6e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.310819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0863  hypothetical protein  36.49 
 
 		 380 aa  179  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2043  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.86 
 
 		 421 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956781  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2860  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30.92 
 
 		 385 aa  109  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28769  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  29.87 
 
 		 375 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2093  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30.16 
 
 		 407 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30.16 
 
 		 407 aa  107  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2381  alkaline D-peptidase  30.26 
 
 		 385 aa  106  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0825231  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  29.8 
 
 		 385 aa  106  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  29.93 
 
 		 385 aa  105  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  29.97 
 
 		 443 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.16 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.1 
 
 		 399 aa  105  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00562308  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  29.61 
 
 		 385 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  32.79 
 
 		 389 aa  104  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  30.82 
 
 		 388 aa  103  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2478  alkaline D-peptidase  29.84 
 
 		 388 aa  102  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431844  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2440  alkaline D-peptidase (D-stereospecific peptide hydrolase)  29.84 
 
 		 388 aa  102  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00540718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2661  alkaline d-peptidase  29.84 
 
 		 388 aa  102  8e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2677  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.84 
 
 		 388 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000522854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  28.67 
 
 		 450 aa  102  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0034  alkaline D-peptidase  31.29 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  30.48 
 
 		 388 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2409  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.84 
 
 		 388 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37701  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0727  alkaline D-peptidase  30.89 
 
 		 429 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4691  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.46 
 
 		 383 aa  100  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.58 
 
 		 389 aa  100  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  30.48 
 
 		 388 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1013  beta-lactamase  32.41 
 
 		 449 aa  99.8  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1134  beta-lactamase  30.18 
 
 		 459 aa  99.8  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  30.51 
 
 		 388 aa  99.4  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  30.15 
 
 		 388 aa  99  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  30.48 
 
 		 388 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  30.66 
 
 		 389 aa  99  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  29.94 
 
 		 476 aa  98.2  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6205  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.94 
 
 		 378 aa  98.2  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8159  alkaline D-peptidase  32.82 
 
 		 375 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.533807 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2312  beta-lactamase  30.74 
 
 		 406 aa  97.4  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  30.14 
 
 		 388 aa  96.3  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  30.14 
 
 		 388 aa  96.3  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  30.14 
 
 		 389 aa  96.3  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2778  beta-lactamase  30.95 
 
 		 380 aa  96.3  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.701087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1094  beta-lactamase  30.86 
 
 		 349 aa  95.1  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4325  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.85 
 
 		 405 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0248121  normal  0.0483573 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  30.25 
 
 		 720 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4644  alkaline D-peptidase  29.48 
 
 		 397 aa  93.6  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00635481  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4094  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.51 
 
 		 405 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4170  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.51 
 
 		 405 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2896  alkaline D-peptidase  29.25 
 
 		 383 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.243898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2416  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.15 
 
 		 411 aa  92.4  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758876  normal  0.129808 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5013  alkaline D-peptidase  27.93 
 
 		 374 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1969  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.09 
 
 		 414 aa  90.9  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.980127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4689  beta-lactamase  29.25 
 
 		 374 aa  90.1  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0791767  normal  0.116144 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11951  lipoprotein  28.57 
 
 		 371 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  29.27 
 
 		 497 aa  89.4  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4155  beta-lactamase  29.96 
 
 		 378 aa  89  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222212  normal  0.15208 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3117  beta-lactamase  27.67 
 
 		 361 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.577011  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3339  beta-lactamase  30.9 
 
 		 381 aa  87.8  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2362  beta-lactamase  29.01 
 
 		 357 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.28 
 
 		 416 aa  86.7  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8721  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  27.34 
 
 		 480 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3984  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.71 
 
 		 390 aa  85.5  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0275  beta-lactamase  30.09 
 
 		 400 aa  84.3  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.35061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2538  beta-lactamase  30.38 
 
 		 416 aa  84  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4765  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  27.68 
 
 		 514 aa  84  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.263187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4727  beta-lactamase  28.83 
 
 		 366 aa  84.3  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2415  beta-lactamase  26.53 
 
 		 442 aa  84.3  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0834226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3986  hypothetical protein  29.15 
 
 		 369 aa  84.3  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3061  beta-lactamase  28.74 
 
 		 351 aa  84.3  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.502148  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23940  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  31.69 
 
 		 378 aa  84  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0755223  normal  0.0888544 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1123  hypothetical protein  30.92 
 
 		 371 aa  83.2  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1119  hypothetical protein  30.92 
 
 		 371 aa  82.8  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3391  beta-lactamase  26.98 
 
 		 420 aa  82.8  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3534  amino acid adenylation  28.86 
 
 		 2457 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0349  beta-lactamase  27.25 
 
 		 407 aa  82.4  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0570  alkaline D-peptidase  28.76 
 
 		 370 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35970  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  27.44 
 
 		 582 aa  82.4  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.796833  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  26.94 
 
 		 446 aa  82  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0375  beta-lactamase  27.99 
 
 		 381 aa  82  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0278  beta-lactamase  29.91 
 
 		 406 aa  82.4  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1923  beta-lactamase  27.33 
 
 		 389 aa  81.6  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4690  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.73 
 
 		 379 aa  81.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00394326  normal  0.37742 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  28.32 
 
 		 431 aa  81.6  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2647  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  30.99 
 
 		 429 aa  82  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.180779  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3177  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  32.18 
 
 		 484 aa  81.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.075148  normal  0.866618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0606  serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.57 
 
 		 438 aa  81.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6210  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  31.41 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5593  beta-lactamase  28.63 
 
 		 480 aa  80.5  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0504  beta-lactamase  27.65 
 
 		 409 aa  80.1  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.35102  hitchhiker  0.00000257291 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  27.74 
 
 		 566 aa  79.3  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1378  beta-lactamase  31.86 
 
 		 337 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.389159  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1013  beta-lactamase  29.14 
 
 		 367 aa  78.2  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3468  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.78 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560934  normal  0.0158413 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3215  beta-lactamase  27.24 
 
 		 405 aa  77.8  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000372743  hitchhiker  0.00147977 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0801  beta-lactamase  30.3 
 
 		 478 aa  77.4  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.87828  normal  0.048033 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1906  beta-lactamase  26.95 
 
 		 369 aa  77  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2615  hypothetical protein  28.53 
 
 		 793 aa  77  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.377093  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3485  beta-lactamase  28.35 
 
 		 440 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.807296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4636  beta-lactamase  27.62 
 
 		 496 aa  76.3  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>