More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5567 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5567  beta-lactamase  100 
 
 		 351 aa  714    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.310819 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3665  beta-lactamase  37.39 
 
 		 357 aa  199  6e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0612912 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0863  hypothetical protein  35.07 
 
 		 380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3147  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29 
 
 		 407 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2860  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.51 
 
 		 385 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28769  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2381  alkaline D-peptidase  28.67 
 
 		 385 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0825231  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2819  alkaline D-peptidase  26.63 
 
 		 388 aa  99.4  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3033  alkaline d-peptidase  26.63 
 
 		 388 aa  99.4  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400662  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2093  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  29.17 
 
 		 407 aa  99  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2769  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  26.63 
 
 		 389 aa  99  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.48212  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3069  alkaline D-peptidase  26.4 
 
 		 388 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0417304  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2296  alkaline D-peptidase  29.02 
 
 		 385 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100431 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2755  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  26.4 
 
 		 388 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0494186  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3030  alkaline D-peptidase  27.37 
 
 		 388 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3175  beta-lactamase  28.47 
 
 		 375 aa  96.3  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.702373  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3027  alkaline D-peptidase  26.01 
 
 		 388 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6205  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  34.53 
 
 		 378 aa  95.5  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2217  alkaline D-peptidase  27.01 
 
 		 388 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.66047e-16 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2051  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  28.24 
 
 		 385 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319079  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3064  alkaline D-peptidase  26.09 
 
 		 388 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0312865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2053  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  28.24 
 
 		 385 aa  93.6  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00880281  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2824  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  25.39 
 
 		 388 aa  92  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.130693  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0368  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  35.86 
 
 		 399 aa  90.5  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00562308  normal  0.495103 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3215  beta-lactamase  30.61 
 
 		 405 aa  90.1  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000372743  hitchhiker  0.00147977 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3206  beta-lactamase  27.41 
 
 		 389 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2043  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.7 
 
 		 421 aa  87.4  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3391  beta-lactamase  31.27 
 
 		 420 aa  86.7  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2409  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.44 
 
 		 388 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.37701  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2478  alkaline D-peptidase  27.44 
 
 		 388 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431844  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2440  alkaline D-peptidase (D-stereospecific peptide hydrolase)  27.44 
 
 		 388 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00540718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2661  alkaline d-peptidase  27.44 
 
 		 388 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2677  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.44 
 
 		 388 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000522854 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5013  alkaline D-peptidase  29.97 
 
 		 374 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal  0.0638413 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0099  D-stereospecific peptide hydrolase  25.84 
 
 		 443 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000129924  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2576  putative D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  27.9 
 
 		 389 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.145811 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2416  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  31.17 
 
 		 411 aa  83.6  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758876  normal  0.129808 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10400  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  28.77 
 
 		 421 aa  83.2  0.000000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.15445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3018  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.14 
 
 		 389 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.470862  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3339  beta-lactamase  29.37 
 
 		 381 aa  82.4  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5306  beta-lactamase  28.38 
 
 		 411 aa  82.4  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2537  beta-lactamase  27.35 
 
 		 393 aa  82  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630976  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3061  beta-lactamase  29.69 
 
 		 351 aa  82.4  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.502148  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4919  beta-lactamase  28.62 
 
 		 415 aa  82  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318437  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0570  alkaline D-peptidase  29.54 
 
 		 370 aa  80.5  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1094  beta-lactamase  30.11 
 
 		 349 aa  80.5  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3511  beta-lactamase  29.3 
 
 		 364 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.700919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4155  beta-lactamase  29.89 
 
 		 378 aa  80.1  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222212  normal  0.15208 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3468  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.67 
 
 		 415 aa  80.1  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560934  normal  0.0158413 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1969  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.59 
 
 		 414 aa  79.7  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.980127  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3022  alkaline D-peptidase and alkaline D-peptidase fusion  26.75 
 
 		 720 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0802631  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4765  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  27.34 
 
 		 514 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.263187 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1013  beta-lactamase  30.39 
 
 		 449 aa  78.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3352  beta-lactamase  30.71 
 
 		 416 aa  78.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.237036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0375  beta-lactamase  29.44 
 
 		 381 aa  77.8  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1123  hypothetical protein  26.77 
 
 		 371 aa  77.8  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6210  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  29.56 
 
 		 391 aa  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126759  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3281  beta-lactamase  34.57 
 
 		 414 aa  77.8  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.916487  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1018  beta-lactamase  28.94 
 
 		 461 aa  77.4  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.624623 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23940  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  31.37 
 
 		 378 aa  77  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0755223  normal  0.0888544 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5142  alkaline D-peptidase  29.43 
 
 		 428 aa  77  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00324654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0624  beta-lactamase  29.43 
 
 		 370 aa  76.6  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.540607  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1119  hypothetical protein  26.52 
 
 		 371 aa  76.6  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2778  beta-lactamase  28.52 
 
 		 380 aa  76.6  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.701087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3986  hypothetical protein  29.14 
 
 		 369 aa  76.6  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5360  twin-arginine translocation pathway signal  34.42 
 
 		 447 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5451  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  34.42 
 
 		 447 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0503905 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5738  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  34.42 
 
 		 447 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.38713 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0622  beta-lactamase  28 
 
 		 377 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.357585  normal  0.0394741 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2896  alkaline D-peptidase  28.77 
 
 		 383 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.243898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1134  beta-lactamase  29.68 
 
 		 459 aa  74.7  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1710  beta-lactamase  27.91 
 
 		 463 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.903063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0034  alkaline D-peptidase  30.61 
 
 		 392 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2679  penicillin-binding protein  23.87 
 
 		 341 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2721  penicillin-binding protein  25.45 
 
 		 340 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0897232  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13238  penicillin-binding protein, putative  26.01 
 
 		 431 aa  73.9  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.652866  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0873  beta-lactamase family protein  25 
 
 		 379 aa  73.6  0.000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0502  beta-lactamase  29.3 
 
 		 358 aa  73.6  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2433  penicillin-binding protein  24.55 
 
 		 340 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0197006  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2469  penicillin-binding protein  24.55 
 
 		 340 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.242822  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2650  penicillin-binding protein  24.55 
 
 		 340 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4727  beta-lactamase  28.88 
 
 		 366 aa  73.2  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2668  penicillin-binding protein  24.55 
 
 		 348 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162016 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5169  beta-lactamase  29.67 
 
 		 382 aa  72.8  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  26.27 
 
 		 578 aa  72.8  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2394  penicillin-binding protein  24.22 
 
 		 340 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70958  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2632  penicillin-binding protein  23.42 
 
 		 341 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.149759  decreased coverage  0.000000240236 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3751  beta-lactamase  24.81 
 
 		 395 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498352 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  30.91 
 
 		 497 aa  72  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1144  putative beta-lactamase  24.72 
 
 		 379 aa  71.2  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1263  beta-lactamase  29.3 
 
 		 375 aa  71.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0172767 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  30.52 
 
 		 487 aa  71.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10390  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  29.31 
 
 		 426 aa  72  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0550455  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1664  beta-lactamase  31.79 
 
 		 348 aa  70.9  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.15284 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0618  beta-lactamase  29.65 
 
 		 450 aa  71.2  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1923  beta-lactamase  33.21 
 
 		 389 aa  71.2  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  33.55 
 
 		 442 aa  70.1  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4546  beta-lactamase  29.32 
 
 		 740 aa  70.1  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.207661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2539  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.75 
 
 		 445 aa  70.1  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7182  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  32.69 
 
 		 420 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0226696 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0934  beta-lactamase  30.23 
 
 		 475 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000419238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>