More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3585 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3585  carbohydrate kinase, FGGY  100 
 
 		 494 aa  964    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.857357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4273  carbohydrate kinase FGGY  81.38 
 
 		 534 aa  782    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.209888 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1675  carbohydrate kinase, FGGY  45.25 
 
 		 492 aa  355  1e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0432172  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0416  carbohydrate kinase FGGY  37.18 
 
 		 464 aa  297  3e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2817  carbohydrate kinase, FGGY  42.47 
 
 		 499 aa  296  7e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31020  pentulose/hexulose kinase  34.71 
 
 		 496 aa  259  6e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.950347  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6143  gluconate kinase  32.1 
 
 		 519 aa  213  7.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.175001  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0492  carbohydrate kinase FGGY  27.7 
 
 		 476 aa  213  9e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0477  carbohydrate kinase, FGGY  27.7 
 
 		 476 aa  213  9e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0552  gluconate kinase  28.95 
 
 		 512 aa  208  1e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2058  gluconokinase  28.35 
 
 		 513 aa  208  2e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0793  carbohydrate kinase, FGGY  28.89 
 
 		 509 aa  207  4e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0018017  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  31.47 
 
 		 514 aa  207  5e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2302  gluconate kinase  28.43 
 
 		 512 aa  206  7e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028574  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  32.5 
 
 		 530 aa  206  8e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1421  gluconate kinase  29.33 
 
 		 518 aa  205  1e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00169953  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3407  gluconate kinase  28.6 
 
 		 513 aa  204  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170414  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3078  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  28.6 
 
 		 513 aa  203  5e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2093  gluconate kinase  29.4 
 
 		 512 aa  203  5e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3072  gluconate kinase  28.03 
 
 		 511 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.139405  normal  0.0524776 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50182  predicted protein  31.61 
 
 		 554 aa  201  1.9999999999999998e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  28.4 
 
 		 513 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2253  gluconate kinase  28.03 
 
 		 512 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0772987  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2496  gluconate kinase  27.86 
 
 		 499 aa  201  1.9999999999999998e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  28.4 
 
 		 513 aa  201  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  28.4 
 
 		 513 aa  201  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3397  gluconate kinase  28.4 
 
 		 513 aa  201  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3409  gluconate kinase  28.19 
 
 		 513 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  29.6 
 
 		 512 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2959  carbohydrate kinase, FGGY  36.58 
 
 		 477 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  28.37 
 
 		 512 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2581  gluconate kinase  27.53 
 
 		 517 aa  197  3e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2529  gluconate kinase  27.53 
 
 		 517 aa  197  3e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.374282  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3384  gluconate kinase  27.98 
 
 		 513 aa  197  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  28.08 
 
 		 512 aa  197  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3181  carbohydrate kinase FGGY  35.31 
 
 		 455 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00866172  decreased coverage  0.0000406172 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0206  gluconate kinase  26.13 
 
 		 511 aa  194  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  25.65 
 
 		 506 aa  194  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0157  gluconate kinase  25.93 
 
 		 511 aa  193  6e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0155  gluconokinase  26.13 
 
 		 511 aa  192  8e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0184  gluconate kinase  25.93 
 
 		 511 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  28.18 
 
 		 486 aa  190  7e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0820  carbohydrate kinase FGGY  28.6 
 
 		 489 aa  182  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000693756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3895  carbohydrate kinase FGGY  32.44 
 
 		 524 aa  181  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0417781  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0347  gluconate kinase  25.87 
 
 		 502 aa  179  1e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00095541 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3301  carbohydrate kinase FGGY  32.19 
 
 		 501 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0861  carbohydrate kinase, FGGY  25.93 
 
 		 509 aa  176  8e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000108808  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07740  pentulose/hexulose kinase  31.01 
 
 		 526 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0607803 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0411  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  27.94 
 
 		 495 aa  169  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.867476  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11390  pentulose/hexulose kinase  32.54 
 
 		 513 aa  155  1e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0344488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  30.2 
 
 		 499 aa  155  2e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0196  carbohydrate kinase FGGY  27.51 
 
 		 496 aa  152  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  29.62 
 
 		 524 aa  151  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  23.8 
 
 		 497 aa  151  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0441  carbohydrate kinase FGGY  25.59 
 
 		 505 aa  150  5e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2151  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  30.8 
 
 		 530 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0746532  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  28.18 
 
 		 538 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  28.91 
 
 		 497 aa  144  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3035  carbohydrate kinase FGGY  28.88 
 
 		 502 aa  145  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.976587 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  29.48 
 
 		 548 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0219  carbohydrate kinase FGGY  30.04 
 
 		 476 aa  140  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1616  carbohydrate kinase, FGGY  28.54 
 
 		 510 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0809365  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2143  carbohydrate kinase FGGY  26.41 
 
 		 503 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0628081  normal  0.75398 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  23.15 
 
 		 500 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  31.03 
 
 		 472 aa  134  3.9999999999999996e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  29.96 
 
 		 510 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3905  glycerol kinase  27.87 
 
 		 501 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  31.75 
 
 		 481 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1104  glycerol kinase  29.45 
 
 		 501 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  30.99 
 
 		 499 aa  130  5.0000000000000004e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2529  carbohydrate kinase, FGGY  28.42 
 
 		 493 aa  130  6e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2574  carbohydrate kinase, FGGY  28.42 
 
 		 493 aa  130  6e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.281212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2566  carbohydrate kinase, FGGY  28.42 
 
 		 493 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1075  glycerol kinase  28.85 
 
 		 499 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4168  glycerol kinase  27.87 
 
 		 501 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  29.18 
 
 		 512 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4337  glycerol kinase  28.66 
 
 		 499 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2688  glycerol kinase  30.87 
 
 		 496 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1116  glycerol kinase  28.66 
 
 		 499 aa  128  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  24.95 
 
 		 506 aa  128  3e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  27.03 
 
 		 508 aa  127  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2762  glycerol kinase  30.69 
 
 		 496 aa  126  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161395  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  22.73 
 
 		 505 aa  126  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3323  carbohydrate kinase FGGY  24.13 
 
 		 519 aa  125  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000061423  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  29.18 
 
 		 496 aa  125  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2718  carbohydrate kinase FGGY  27.42 
 
 		 515 aa  124  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1344  carbohydrate kinase, FGGY  28.28 
 
 		 519 aa  124  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.789365  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  24.33 
 
 		 512 aa  123  6e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  25 
 
 		 501 aa  123  6e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2812  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  29.77 
 
 		 483 aa  123  6e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.182066  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  24.37 
 
 		 511 aa  124  6e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0809  glycerol kinase  28.88 
 
 		 497 aa  123  8e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.344576 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  26.49 
 
 		 497 aa  123  8e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2704  glycerol kinase  27.68 
 
 		 497 aa  123  9e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0644  xylulokinase  27.62 
 
 		 498 aa  122  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2086  carbohydrate kinase FGGY  28.98 
 
 		 506 aa  122  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  26.57 
 
 		 496 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1235  xylulokinase  30.44 
 
 		 480 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.757817  normal  0.113808 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2987  glycerol kinase  27.59 
 
 		 498 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3223  glycerol kinase  31.99 
 
 		 497 aa  122  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>