119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0384 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0384  band 7 protein  100 
 
 		 411 aa  820    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.580095  normal  0.0305659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2981  Membrane protease subunits stomatin/prohibitin  70.62 
 
 		 415 aa  572  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3323  band 7 protein  62.53 
 
 		 488 aa  503  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2147  band 7 protein  63.48 
 
 		 450 aa  486  1e-136  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.235634  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2982  hypothetical protein  30.62 
 
 		 536 aa  136  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.688388  normal  0.388989 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2148  band 7 protein  31.75 
 
 		 538 aa  129  6e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.26359  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0385  hypothetical protein  30.23 
 
 		 504 aa  116  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.747749  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3324  band 7 protein  29.14 
 
 		 607 aa  109  9.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.876971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02636  integral membrane protease subunit  26.03 
 
 		 375 aa  68.2  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1722  HflK protein  27.96 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0297  band 7 protein  23.81 
 
 		 284 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1787  HflK protein  27.96 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3259  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849925  normal  0.405383 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3437  band 7 protein  24.27 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.462208  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0666  HflC protein  21.46 
 
 		 289 aa  55.1  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1478  band 7 protein  26 
 
 		 290 aa  54.3  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2241  ftsH protease activity modulator HflK  27.62 
 
 		 445 aa  53.1  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.753349  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0814  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.87 
 
 		 257 aa  52.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000120225  hitchhiker  0.0000000481478 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2430  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.87 
 
 		 261 aa  52.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.108458  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1338  ftsH protease activity modulator HflK  27.49 
 
 		 437 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.123813  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2347  ftsH protease activity modulator HflK  27.49 
 
 		 442 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1827  HflK protein  27.49 
 
 		 437 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0069  ftsH protease activity modulator HflK  27.49 
 
 		 449 aa  51.6  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255254  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2220  HflK protein  27.49 
 
 		 454 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1099  HflK protein  27.49 
 
 		 437 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0978  band 7 protein  25.72 
 
 		 312 aa  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0464  band 7 protein  23.79 
 
 		 261 aa  51.2  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000381687  normal  0.0261811 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0036  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  22.84 
 
 		 270 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0311937  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1884  band 7 protein  22.75 
 
 		 305 aa  50.8  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0366362 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2182  HflK protein  27.01 
 
 		 454 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1699  band 7 protein  28.22 
 
 		 258 aa  50.4  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000129402 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1624  band 7 protein  26.26 
 
 		 281 aa  50.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.602734 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1470  HflK protein  27.2 
 
 		 446 aa  50.4  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.407344  normal  0.172273 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  26.7 
 
 		 395 aa  50.1  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2315  band 7 protein  21.74 
 
 		 345 aa  50.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2975  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.23 
 
 		 278 aa  50.1  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.71368  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1107  HflK protein  19.24 
 
 		 308 aa  50.1  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3500  band 7 protein  24.68 
 
 		 306 aa  49.7  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674011  normal  0.0455255 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3473  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.32 
 
 		 264 aa  49.7  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00917354 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1743  HflK protein  25.12 
 
 		 453 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1161  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.48 
 
 		 248 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0328749  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2912  band 7 protein  26.32 
 
 		 255 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0999  HflK protein  19.24 
 
 		 308 aa  49.3  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1716  HflK protein  25.12 
 
 		 441 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.40222  normal  0.183963 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1170  band 7 protein  23.5 
 
 		 248 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.985704  decreased coverage  0.00325794 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0402  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.5 
 
 		 257 aa  48.9  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.674809  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4125  HflK protein  28.27 
 
 		 515 aa  48.5  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1749  HflK protein  23.41 
 
 		 376 aa  48.9  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254466  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1413  HflK protein  24.41 
 
 		 465 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.843638  hitchhiker  0.0000076277 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0490  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.09 
 
 		 252 aa  48.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6274  HflK protein  25.27 
 
 		 462 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.321519  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1805  HflK protein  25.27 
 
 		 462 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.644359  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1829  HflK protein  25.45 
 
 		 436 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.51115  normal  0.182699 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0786  band 7 protein  21.2 
 
 		 295 aa  48.1  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3243  SPFH domain/Band 7 family protein  23.03 
 
 		 322 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000635475  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  23.53 
 
 		 393 aa  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0865  band 7 protein  24.26 
 
 		 254 aa  47.8  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.301749  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0359  band 7 protein  25.45 
 
 		 268 aa  47.4  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.741854  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1924  band 7 protein  24.67 
 
 		 322 aa  47.4  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159861  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2064  SPFH domain/Band 7 family protein  22.14 
 
 		 322 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101789  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2146  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  22.14 
 
 		 322 aa  47  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3236  band 7 protein  23.91 
 
 		 295 aa  47  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2174  SPFH domain/Band 7 family protein  22.14 
 
 		 322 aa  47  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.268114  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1014  band 7 protein  24 
 
 		 265 aa  47  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.855115  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1928  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  22.14 
 
 		 321 aa  47  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1890  stomatin-like protein  22.14 
 
 		 322 aa  47  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1880  stomatin-like protein  22.14 
 
 		 322 aa  47  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2075  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  22.14 
 
 		 321 aa  47  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2106  SPFH domain/Band 7 family protein  22.14 
 
 		 321 aa  47  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2124  band 7 protein  23.37 
 
 		 303 aa  46.6  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.10084  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1429  band 7 protein  21.74 
 
 		 394 aa  46.6  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0138  band 7 protein  20 
 
 		 318 aa  46.6  0.0008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0844  hypothetical protein  22.64 
 
 		 290 aa  45.8  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1958  membrane protease subunits, stomatin/prohibitin-like  28.89 
 
 		 249 aa  45.8  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5106  membrane protein, HflK  25.39 
 
 		 434 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1305  Band 7 protein  23.9 
 
 		 248 aa  45.8  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.316844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0923  putative HflC protein  28.4 
 
 		 290 aa  46.2  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1337  band 7 protein  25.25 
 
 		 281 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.773345  normal  0.981005 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2987  band 7 protein  23.5 
 
 		 315 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0157  inner membrane protein  20 
 
 		 318 aa  46.2  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.131876  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  25.56 
 
 		 406 aa  46.2  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1164  band 7 protein  23.47 
 
 		 263 aa  46.2  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00105644  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3604  band 7 protein  24.35 
 
 		 312 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10521 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  24.11 
 
 		 405 aa  45.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1091  HflC protein  27.94 
 
 		 284 aa  45.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2736  band 7 protein  23.74 
 
 		 309 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2818  HFLK protein  24.02 
 
 		 383 aa  45.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44638  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0942  band 7 protein  25.58 
 
 		 259 aa  44.7  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.69232  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2800  HflK protein  23.96 
 
 		 360 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182223  normal  0.400207 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1663  HflC protein  25.18 
 
 		 300 aa  44.7  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.107349 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  27 
 
 		 413 aa  44.3  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0695  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.66 
 
 		 270 aa  44.3  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.323887  hitchhiker  0.000167798 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2018  HflK protein  23.46 
 
 		 362 aa  44.3  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2313  band 7 protein  21.8 
 
 		 398 aa  44.3  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1066  HflK protein  22.38 
 
 		 477 aa  44.3  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1496  band 7 protein  23.81 
 
 		 259 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1591  band 7 protein  23.81 
 
 		 259 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0347  band 7 protein  24.48 
 
 		 254 aa  43.9  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315344  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2924  band 7 protein  22.94 
 
 		 318 aa  43.9  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.839077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4127  HflK protein  22.62 
 
 		 375 aa  43.5  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.848756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>