245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2517 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2517  chromate transporter  100 
 
 		 176 aa  341  2.9999999999999997e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2354  chromate transporter  71.88 
 
 		 176 aa  243  6.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0904  Chromate transporter  56.55 
 
 		 176 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0931867  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0980  hypothetical protein  56.32 
 
 		 181 aa  180  7e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0833  Chromate transporter  56.55 
 
 		 176 aa  180  8.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.94136 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2309  chromate transporter  42.59 
 
 		 194 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.944138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3385  chromate transporter  40 
 
 		 172 aa  117  9e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4011  Chromate transporter  39.2 
 
 		 176 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4415  chromate transporter  39.74 
 
 		 176 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6103  chromate transporter  37.5 
 
 		 177 aa  114  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2328  chromate transporter  39.88 
 
 		 173 aa  113  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.487859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3785  chromate transporter  41.52 
 
 		 212 aa  108  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.533854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3005  chromate transporter  37.35 
 
 		 175 aa  108  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3055  chromate transporter  36.75 
 
 		 175 aa  108  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2920  chromate transporter  36.75 
 
 		 175 aa  108  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.363113 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0382  chromate transport protein  40.49 
 
 		 173 aa  107  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2396  chromate transporter  36.14 
 
 		 175 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.282395  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3029  chromate transporter  36.14 
 
 		 175 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3010  chromate transporter  36.14 
 
 		 175 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3015  chromate transporter  35.68 
 
 		 194 aa  105  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.319772 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6356  chromate transporter  34.94 
 
 		 175 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.326955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2837  chromate transporter  36.26 
 
 		 176 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4023  chromate transporter  37.58 
 
 		 202 aa  102  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151101 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0283  chromate transporter  34.62 
 
 		 176 aa  101  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0480  putative chromate transporter  34.62 
 
 		 176 aa  101  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3339  chromate transporter  34.62 
 
 		 176 aa  101  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0295  chromate transporter  34.62 
 
 		 176 aa  101  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3009  chromate transporter  34.62 
 
 		 176 aa  101  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2084  putative chromate transporter  34.62 
 
 		 176 aa  101  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0479  chromate transporter  33.33 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.598587  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0255  chromate transporter  33.97 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.558756  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2454  chromate transporter  34.29 
 
 		 179 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1523  chromate transporter  34.81 
 
 		 174 aa  100  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.169451  normal  0.13668 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0434  Chromate transporter  37.95 
 
 		 182 aa  99.4  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6792  Chromate transporter  36.14 
 
 		 176 aa  97.8  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00795319  hitchhiker  0.00000150766 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3027  chromate transporter  35.95 
 
 		 198 aa  96.3  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2260  chromate transporter  35.9 
 
 		 200 aa  96.3  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1614  Chromate transporter  35.9 
 
 		 200 aa  95.9  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.521618  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2214  Chromate transporter  36.05 
 
 		 202 aa  95.5  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.457485  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4041  chromate transporter  32.08 
 
 		 179 aa  94.7  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0901  chromate transporter  32.7 
 
 		 180 aa  94.4  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2757  chromate transporter  34.81 
 
 		 202 aa  94  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4176  chromate transporter  34.52 
 
 		 177 aa  94  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.985481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0533  Chromate transporter  35.67 
 
 		 179 aa  93.6  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6228  Chromate transporter  32.32 
 
 		 200 aa  92.8  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0939  chromate transporter  32.7 
 
 		 180 aa  90.9  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3610  chromate transporter  40.37 
 
 		 175 aa  90.5  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0460  chromate transporter  32.52 
 
 		 180 aa  87.4  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0071  chromate transporter  39.29 
 
 		 199 aa  86.3  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3738  Chromate transporter  33.33 
 
 		 175 aa  86.3  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1913  chromate transporter  43.8 
 
 		 170 aa  83.6  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.450152  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2205  CHR transporter  41.61 
 
 		 168 aa  82.8  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.573997 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2219  Chromate transporter  31.65 
 
 		 178 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2052  chromate efflux pump  32.12 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.186158  normal  0.149937 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  27.54 
 
 		 420 aa  77.4  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0231  Chromate transporter  29.65 
 
 		 172 aa  72  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00100976  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  30.23 
 
 		 199 aa  67  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2731  chromate transporter  31.25 
 
 		 174 aa  64.3  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1526  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  37.38 
 
 		 415 aa  62.8  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04090  Chromate transporter  26.01 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2360  chromate transporter  29.41 
 
 		 172 aa  62  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1337  chromate transporter  28.3 
 
 		 184 aa  61.2  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00776864  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2518  chromate transporter  33.33 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.266281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0832  Chromate transporter  29.66 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.974224 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0903  Chromate transporter  29.73 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0253551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0480  chromate transporter  34.29 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.461938  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1744  chromate transport protein  26.97 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  24.71 
 
 		 416 aa  57  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3482  Chromate transporter  29.45 
 
 		 167 aa  57  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000162395  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2308  chromate transporter  33.59 
 
 		 191 aa  57  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2142  Chromate transporter  27.01 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00004405  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0956  chromate transporter  36.08 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.6 
 
 		 387 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  23.78 
 
 		 393 aa  55.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1382  chromate transporter  34.72 
 
 		 376 aa  55.8  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3786  chromate transporter  31.79 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.486555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2355  chromate transporter  30.26 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  29.32 
 
 		 382 aa  55.5  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6104  putative chromate transport protein  37.08 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0979  hypothetical protein  33.73 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25 
 
 		 387 aa  54.7  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0435  Chromate transporter  35.11 
 
 		 209 aa  54.3  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.67 
 
 		 404 aa  54.3  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3386  chromate transporter  29.66 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1095  chromate transporter  25.54 
 
 		 187 aa  53.1  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0167  chromate transporter  25.58 
 
 		 171 aa  52.8  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3026  chromate transporter  38.75 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1914  chromate transporter  39.51 
 
 		 361 aa  53.5  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2361  chromate transporter  20 
 
 		 179 aa  52.4  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.38 
 
 		 382 aa  52  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0193  Chromate transporter  26.04 
 
 		 176 aa  51.2  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4999  chromate transporter  28.4 
 
 		 393 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2756  chromate transporter  29.38 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1742  chromate transporter  24.36 
 
 		 213 aa  50.4  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4012  Chromate transporter  35.8 
 
 		 198 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1904  chromate transporter  23.95 
 
 		 203 aa  50.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0232  Chromate transporter  24.64 
 
 		 154 aa  49.7  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0810087  normal  0.80341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4022  chromate transporter  27.27 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100233 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3014  chromate transporter  32.22 
 
 		 198 aa  49.7  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642179 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4177  chromate transporter  31.43 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>