47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2820 on replicon NC_013502
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013502  Rmar_2820  FG-GAP repeat protein  100 
 
 		 902 aa  1805    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.517376  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0721  hypothetical protein  40.21 
 
 		 741 aa  76.6  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1158  hypothetical protein  39.39 
 
 		 525 aa  73.9  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2471  hypothetical protein  41.77 
 
 		 578 aa  72.8  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2727  extracellular repeat protein, HAF family  37.07 
 
 		 468 aa  72  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0354  hypothetical protein  33.33 
 
 		 287 aa  72  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0589799  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0524  Alkaline phosphatase  39.53 
 
 		 676 aa  71.6  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1071  hypothetical protein  31.78 
 
 		 668 aa  71.2  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0506  Kelch repeat-containing protein  36.36 
 
 		 430 aa  68.2  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1484  hypothetical protein  36.11 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000295365  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0285  alpha amylase catalytic region  36.96 
 
 		 990 aa  64.3  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2393  hypothetical protein  33.33 
 
 		 851 aa  63.9  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.922519  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0744  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.65 
 
 		 1092 aa  64.3  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0783948  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1150  hypothetical protein  36.84 
 
 		 1162 aa  62  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0200  hypothetical protein  38.95 
 
 		 763 aa  59.7  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2561  hypothetical protein  32.99 
 
 		 554 aa  58.9  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.339311  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2442  hypothetical protein  31.34 
 
 		 516 aa  58.5  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.498861  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0284  hypothetical protein  38.54 
 
 		 679 aa  58.2  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0976  hypothetical protein  34.38 
 
 		 844 aa  57.8  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.495512  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1003  hypothetical protein  31.58 
 
 		 152 aa  57.4  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126891  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1460  hypothetical protein  32.98 
 
 		 1270 aa  55.8  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.453436  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0973  hypothetical protein  33.33 
 
 		 258 aa  55.8  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1069  glycoside hydrolase family 10  29.91 
 
 		 997 aa  55.8  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000326536  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2211  hypothetical protein  36.59 
 
 		 595 aa  54.7  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.173352  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2394  hypothetical protein  29.47 
 
 		 520 aa  54.7  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.201637  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2390  hypothetical protein  30.84 
 
 		 489 aa  52.8  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.520688  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1429  two component regulator propeller domain protein  31.51 
 
 		 695 aa  52.8  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.191766  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1280  CHRD domain containing protein  32.98 
 
 		 479 aa  52  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0260  hypothetical protein  37.08 
 
 		 527 aa  52  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1182  hypothetical protein  29.81 
 
 		 1125 aa  51.2  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  25.32 
 
 		 1838 aa  50.8  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0295  Laminin G sub domain 2  36.78 
 
 		 545 aa  49.7  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.252604  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  28.49 
 
 		 2324 aa  49.7  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2797  hypothetical protein  30.67 
 
 		 1343 aa  47.8  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2604  Fibronectin type III domain protein  28.57 
 
 		 1302 aa  47  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.178054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1189  protein of unknown function DUF1501  28.26 
 
 		 513 aa  47.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.605021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1386  hypothetical protein  31.82 
 
 		 966 aa  46.2  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000313408  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1204  hypothetical protein  33.33 
 
 		 398 aa  46.6  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3915  flagellar hook capping protein  32.89 
 
 		 221 aa  46.6  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0387265 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2726  extracellular repeat protein, HAF family  30.21 
 
 		 475 aa  46.2  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0162  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1634 aa  46.2  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4923  hypothetical protein  27.71 
 
 		 178 aa  46.2  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.366855 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2687  Propeptide peptidase M4 and M36  35.9 
 
 		 931 aa  45.4  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2212  hypothetical protein  32.04 
 
 		 562 aa  45.1  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0977559  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0460  FG-GAP repeat-containing protein  23.62 
 
 		 2474 aa  45.1  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1568  hypothetical protein  30.67 
 
 		 1685 aa  45.1  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.518804  normal  0.238693 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06820  hypothetical protein  27.16 
 
 		 421 aa  44.7  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.407586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>