202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1683 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  100 
 
 		 779 aa  1572    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  43.33 
 
 		 821 aa  621  1e-176  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.154266 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  44.44 
 
 		 801 aa  620  1e-176  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  41.8 
 
 		 797 aa  598  1e-170  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  42.3 
 
 		 828 aa  597  1e-169  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0171  Alpha-glucosidase  40.79 
 
 		 777 aa  596  1e-169  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0803  a-glucosidase  44.08 
 
 		 794 aa  598  1e-169  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00272657 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  43.83 
 
 		 803 aa  594  1e-168  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  40.79 
 
 		 785 aa  578  1.0000000000000001e-163  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  40.37 
 
 		 779 aa  570  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0650  Alpha-glucosidase  39.24 
 
 		 776 aa  570  1e-161  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  40.19 
 
 		 799 aa  566  1e-160  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3324  Alpha-glucosidase  42.53 
 
 		 825 aa  558  1e-157  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000336077 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  38.27 
 
 		 752 aa  558  1e-157  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  42.95 
 
 		 792 aa  536  1e-151  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  41.97 
 
 		 779 aa  535  1e-151  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  40.06 
 
 		 768 aa  529  1e-149  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1902  Alpha-glucosidase  41.23 
 
 		 806 aa  514  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000358831 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1870  Alpha-glucosidase  41.32 
 
 		 798 aa  511  1e-143  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.785633  normal  0.641991 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3837  Alpha-glucosidase  43.76 
 
 		 828 aa  496  1e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  38.87 
 
 		 746 aa  488  1e-136  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4015  Alpha-glucosidase  36.08 
 
 		 845 aa  461  9.999999999999999e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0015  Alpha-glucosidase  45.41 
 
 		 816 aa  453  1.0000000000000001e-126  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  36.24 
 
 		 836 aa  449  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  36.73 
 
 		 743 aa  423  1e-117  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1611  Alpha-glucosidase  36.5 
 
 		 702 aa  410  1e-113  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0369575  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  35.75 
 
 		 770 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_429  predicted protein  38.9 
 
 		 815 aa  404  1e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0318632  normal  0.136701 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2087  Alpha-glucosidase  43.52 
 
 		 762 aa  400  9.999999999999999e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.290545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1570  Alpha-glucosidase  35.38 
 
 		 715 aa  388  1e-106  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1108  Alpha-glucosidase  30.13 
 
 		 728 aa  377  1e-103  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.910405  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0793  Alpha-glucosidase  34.64 
 
 		 700 aa  374  1e-102  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  31.69 
 
 		 839 aa  358  2.9999999999999997e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3785  Alpha-glucosidase  33.01 
 
 		 692 aa  352  1e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.681439  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2781  glycoside hydrolase family protein  33.1 
 
 		 799 aa  351  3e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3127  glycoside hydrolase family protein  34.53 
 
 		 813 aa  347  3e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2648  glycosy hydrolase family protein  29.99 
 
 		 715 aa  344  4e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03521  conserved hypothetical protein  31.52 
 
 		 795 aa  343  5e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03472  hypothetical protein  31.52 
 
 		 795 aa  343  5e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3598  Alpha-glucosidase  32.44 
 
 		 790 aa  341  2.9999999999999998e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000274  normal  0.390231 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1312  glucan 1,3-alpha-glucosidase  32.48 
 
 		 787 aa  338  1.9999999999999998e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2334  alpha-glucosidase  29.54 
 
 		 715 aa  338  2.9999999999999997e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_50836  alpha subunit of glucosidase  37.5 
 
 		 712 aa  337  3.9999999999999995e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.312978  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1643  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  33.55 
 
 		 791 aa  337  7e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0911  Alpha-glucosidase  35.55 
 
 		 661 aa  336  7.999999999999999e-91  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.22141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3217  Alpha-glucosidase  32.77 
 
 		 821 aa  336  1e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1612  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  32.01 
 
 		 788 aa  335  2e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4047  glycoside hydrolase family protein  34.76 
 
 		 806 aa  334  4e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.175314 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2044  Alpha-glucosidase  36.09 
 
 		 685 aa  334  4e-90  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1872  Alpha-glucosidase  34.34 
 
 		 806 aa  331  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00900175  normal  0.24419 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2626  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  33.15 
 
 		 788 aa  331  3e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3358  Alpha-glucosidase  36.59 
 
 		 806 aa  331  3e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4208  glycoside hydrolase family protein  36.28 
 
 		 806 aa  330  7e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0739255  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3565  Alpha-glucosidase  36.59 
 
 		 806 aa  330  7e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00443283  normal  0.722523 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4158  glycoside hydrolase family protein  36.28 
 
 		 806 aa  330  7e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00315991 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0977  Alpha-glucosidase  33.14 
 
 		 791 aa  328  2.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0924  glycosy hydrolase family protein  33.14 
 
 		 791 aa  328  2.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3360  glycosy hydrolase family protein  33.14 
 
 		 789 aa  326  8.000000000000001e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1081  glucosidase protein  33.46 
 
 		 803 aa  326  1e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00242883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1013  glycoside hydrolase family 31  34.63 
 
 		 803 aa  325  2e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.36394  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  34.77 
 
 		 760 aa  325  2e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2352  Glucan 1,3-alpha-glucosidase  32.02 
 
 		 788 aa  325  2e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1628  Alpha-glucosidase  35.51 
 
 		 656 aa  325  2e-87  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.301391 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05150  alpha glucosidase, putative  35.66 
 
 		 956 aa  325  3e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.133027  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11054  alpha glucosidase II, alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03500)  33.5 
 
 		 952 aa  322  1.9999999999999998e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.464256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85073  glucosidase II  31.25 
 
 		 911 aa  322  1.9999999999999998e-86  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1794  Alpha-glucosidase  34.26 
 
 		 687 aa  319  1e-85  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.761488  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0983  glycosy hydrolase family protein  27.41 
 
 		 836 aa  318  2e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0948  glycoside hydrolase family 31  34.32 
 
 		 803 aa  317  4e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0874171 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3867  Alpha-glucosidase  32.3 
 
 		 784 aa  314  4.999999999999999e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.191857 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0917  Alpha-glucosidase  35.15 
 
 		 683 aa  310  8e-83  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03950  glycosyl hydrolase, family 31  28.63 
 
 		 821 aa  307  4.0000000000000004e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  34.2 
 
 		 765 aa  307  4.0000000000000004e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  32.15 
 
 		 779 aa  304  4.0000000000000003e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  37.15 
 
 		 765 aa  296  9e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5548  Alpha-glucosidase  33.39 
 
 		 951 aa  289  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.426673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0898  Alpha-glucosidase  29.52 
 
 		 783 aa  280  7e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532752  normal  0.374184 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0413  alpha-xylosidase YicI  35.26 
 
 		 763 aa  275  2.0000000000000002e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2986  alpha-xylosidase YicI  31.21 
 
 		 749 aa  275  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03670  glycoside hydrolase family 31  29.14 
 
 		 1024 aa  274  5.000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.510709  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1323  alpha-xylosidase YicI  33.88 
 
 		 760 aa  271  2.9999999999999997e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01510  alpha-xylosidase YicI  32.28 
 
 		 681 aa  271  4e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1194  glycoside hydrolase family 31  32.94 
 
 		 804 aa  270  7e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  27.25 
 
 		 775 aa  270  1e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  29.35 
 
 		 764 aa  269  1e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  29.65 
 
 		 764 aa  270  1e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1763  alpha-xylosidase YicI  30.52 
 
 		 760 aa  266  8e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.983763  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2605  Alpha-glucosidase  32.06 
 
 		 795 aa  265  2e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4927  glycoside hydrolase family 31  31.53 
 
 		 777 aa  265  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0187  alpha-xylosidase YicI  29.9 
 
 		 775 aa  265  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3966  alpha-xylosidase YicI  29.82 
 
 		 772 aa  266  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0387  Alpha-glucosidase  33.03 
 
 		 806 aa  265  3e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.44264 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3956  alpha-xylosidase YicI  29.82 
 
 		 772 aa  265  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4029  alpha-xylosidase YicI  29.82 
 
 		 772 aa  265  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0205936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4075  alpha-xylosidase YicI  29.67 
 
 		 772 aa  263  8e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.397579  normal  0.758007 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1244  alpha-xylosidase YicI  30.63 
 
 		 712 aa  261  3e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.669712  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4135  alpha-xylosidase YicI  29.67 
 
 		 772 aa  260  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4683  alpha-xylosidase YicI  30.54 
 
 		 771 aa  260  8e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00144447  normal  0.975878 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0071  alpha-xylosidase YicI  30.08 
 
 		 772 aa  258  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.290357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5029  alpha-xylosidase YicI  29.41 
 
 		 772 aa  256  9e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>