More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6880 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5910  Methyltransferase type 12  92.35 
 
 		 353 aa  672    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.512688 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6880  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 353 aa  729    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal  0.545312 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0328  hypothetical protein  66.95 
 
 		 351 aa  476  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0990  methyltransferase type 12  60.34 
 
 		 351 aa  449  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3193  Methyltransferase type 12  58.96 
 
 		 351 aa  431  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0507607  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2993  methyltransferase type 12  58.55 
 
 		 351 aa  428  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0698289  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5022  methyltransferase type 11  58 
 
 		 353 aa  429  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.371366  normal  0.128681 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3092  Methyltransferase type 12  58.96 
 
 		 351 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.684965  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2765  methyltransferase type 12  57.47 
 
 		 348 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.306767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0596  Methyltransferase type 12  58.33 
 
 		 357 aa  415  9.999999999999999e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.579149 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1171  hypothetical protein  55.07 
 
 		 351 aa  413  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2079  hypothetical protein  55.46 
 
 		 348 aa  409  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2927  hypothetical protein  57.47 
 
 		 348 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0580788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2845  methyltransferase type 11  57.18 
 
 		 348 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292154 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2124  methyltransferase type 11  56.9 
 
 		 348 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0899557  normal  0.31011 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1034  Methyltransferase type 12  54.99 
 
 		 360 aa  398  9.999999999999999e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4241  Methyltransferase type 12  54.31 
 
 		 360 aa  399  9.999999999999999e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2433  putative methyltransferase  56.03 
 
 		 348 aa  393  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0150817 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6246  Methyltransferase type 12  52.29 
 
 		 349 aa  381  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106567  normal  0.283014 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1706  methyltransferase type 12  52.89 
 
 		 353 aa  382  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.266061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2696  Methyltransferase type 12  52.3 
 
 		 358 aa  378  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.362393 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1551  methyltransferase type 12  52.75 
 
 		 350 aa  372  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.100961 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3870  methyltransferase type 12  51.72 
 
 		 357 aa  371  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0623  methyltransferase type 12  52.01 
 
 		 357 aa  366  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1600  methyltransferase type 12  52.01 
 
 		 359 aa  365  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1828  Methyltransferase type 11  52.01 
 
 		 351 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225649  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2188  Methyltransferase type 12  48.38 
 
 		 343 aa  317  2e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1632  hypothetical protein  39.49 
 
 		 357 aa  250  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18860  hypothetical protein  38.64 
 
 		 357 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478854  normal  0.0386506 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  33.92 
 
 		 363 aa  175  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3711  methyltransferase type 12  32.6 
 
 		 360 aa  166  5e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3378  methyltransferase type 11  30.79 
 
 		 355 aa  166  8e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3440  methyltransferase type 11  30.79 
 
 		 355 aa  166  8e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0151153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3389  methyltransferase type 11  30.79 
 
 		 355 aa  166  8e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5517  methyltransferase type 11  34.42 
 
 		 355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00770643  normal  0.912188 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0550  Methyltransferase type 11  32.24 
 
 		 356 aa  162  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1645  Methyltransferase type 12  31.64 
 
 		 365 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1290  Methyltransferase type 12  33.44 
 
 		 341 aa  160  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.830154  normal  0.108647 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2044  methyltransferase type 12  33.24 
 
 		 369 aa  160  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204275  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12286  transcriptional regulator  31.58 
 
 		 353 aa  156  4e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1793  Methyltransferase type 11  32.28 
 
 		 360 aa  156  6e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000694862 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2462  hypothetical protein  30.15 
 
 		 356 aa  155  9e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2319  hypothetical protein  30.15 
 
 		 356 aa  155  1e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  30.06 
 
 		 344 aa  153  5e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2768  methyltransferase type 11  30.53 
 
 		 360 aa  151  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447224  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3765  methyltransferase type 12  28.65 
 
 		 376 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.578435  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2574  Methyltransferase type 11  29.8 
 
 		 363 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6570  methyltransferase type 12  31.33 
 
 		 416 aa  144  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2608  Methyltransferase type 12  30.65 
 
 		 380 aa  142  6e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476854  hitchhiker  0.00248794 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5751  Methyltransferase type 11  30.75 
 
 		 356 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229157  normal  0.171597 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1502  methyltransferase type 11  28.34 
 
 		 360 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576413  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43981  predicted protein  30.18 
 
 		 418 aa  139  4.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.321285  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1453  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 366 aa  130  3e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.299769 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3928  methyltransferase type 11  30.89 
 
 		 363 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.959556 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2327  Methyltransferase type 11  29.9 
 
 		 367 aa  125  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.28435 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2836  methyltransferase type 11  29.7 
 
 		 362 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251768  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1328  Methyltransferase type 12  24.93 
 
 		 365 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.352621 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  35.94 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  35.94 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  36.61 
 
 		 285 aa  67  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  36.52 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2963  O-methyltransferase family 2  29.46 
 
 		 338 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.193819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1929  Methyltransferase type 11  43.06 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000245244  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  34.95 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  33.12 
 
 		 281 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0510  methyltransferase type 11  34.58 
 
 		 276 aa  59.3  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  33.65 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2307  putative transcriptional regulator  26.55 
 
 		 392 aa  58.2  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.980955  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1911  Methyltransferase type 12  35.92 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.198767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 279 aa  57  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0160  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.06 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0758  methyltransferase type 11  35.58 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00805232  hitchhiker  0.00000000000141502 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4414  methyltransferase type 12  24.9 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  32.17 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  29.01 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4888  methyltransferase type 12  25.22 
 
 		 351 aa  55.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.687449 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1508  Methyltransferase type 11  30.71 
 
 		 226 aa  55.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.670253 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3189  methyltransferase type 11  35.4 
 
 		 187 aa  55.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2188  hypothetical protein  27.41 
 
 		 411 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  30.57 
 
 		 271 aa  53.9  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  30.28 
 
 		 282 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2164  Methyltransferase type 11  22.86 
 
 		 346 aa  53.9  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.337135  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2956  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  24.42 
 
 		 384 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.934016  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1318  O-methyltransferase family protein  33.04 
 
 		 363 aa  53.5  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  32.08 
 
 		 265 aa  53.5  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1069  hypothetical protein  60 
 
 		 140 aa  53.5  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3931  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 271 aa  53.1  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4232  methyltransferase type 11  28.24 
 
 		 234 aa  53.1  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1589  Methyltransferase type 11  31.75 
 
 		 209 aa  53.1  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1825  methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 254 aa  53.1  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.627869  normal  0.366066 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  30.84 
 
 		 242 aa  53.1  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  30.84 
 
 		 242 aa  53.1  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  30.61 
 
 		 414 aa  52.4  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1275  putative methyltransferase  25.95 
 
 		 234 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151489  normal  0.89967 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2941  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  23.94 
 
 		 399 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0106  putative methyl transferase  24.81 
 
 		 205 aa  52.4  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4216  methyltransferase type 11  29.34 
 
 		 277 aa  52.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2985  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  23.94 
 
 		 374 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  29.08 
 
 		 634 aa  52  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2794  methyltransferase type 11  39.74 
 
 		 271 aa  51.6  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148231  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>