45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6642 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_6642  putative beta-lactamase precursor protein  100 
 
 		 287 aa  592  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2437  putative beta-lactamase precursor protein  83.86 
 
 		 290 aa  489  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1712  beta-lactamase  32.73 
 
 		 576 aa  87  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0316  beta-lactamase  33.62 
 
 		 315 aa  82.4  0.000000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00360568 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0602  beta-lactamase  27.69 
 
 		 274 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2055  peptidoglycan-binding LysM  24.44 
 
 		 333 aa  69.3  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000227262  normal  0.0328069 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2815  beta-lactamase  25.91 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2043  beta-lactamase  28.04 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0136357  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5194  beta-lactamase  25 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1147  putative beta-lactamase  29.95 
 
 		 423 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2343  beta-lactamase  24.57 
 
 		 803 aa  60.1  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.23617 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  28.39 
 
 		 442 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1408  penicillin-binding protein, transpeptidase  28.19 
 
 		 504 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1634  beta-lactamase  28.5 
 
 		 425 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3876  beta-lactamase  24.71 
 
 		 468 aa  56.6  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1603  beta-lactamase  25.73 
 
 		 375 aa  55.8  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.955317  normal  0.378927 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1608  beta-lactamase  28 
 
 		 425 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11351  Beta-lactamase class A  26.47 
 
 		 356 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.470021  normal  0.82694 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3972  beta-lactamase  24.5 
 
 		 305 aa  53.9  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0506092  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2092  penicillin-binding protein, transpeptidase  25.12 
 
 		 424 aa  52.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00783255  hitchhiker  0.00000266476 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4223  beta-lactamase  32.52 
 
 		 508 aa  52  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2155  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.78 
 
 		 404 aa  50.4  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3023  Beta-lactamase class A-like protein  26.15 
 
 		 277 aa  50.4  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0538064  normal  0.499976 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3361  beta-lactamase  24.39 
 
 		 282 aa  49.7  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282427 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2386  beta-lactamase  30.23 
 
 		 302 aa  49.3  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.721784 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0176  penicillin-binding protein 6  30.28 
 
 		 381 aa  49.3  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1443  beta-lactamase  29.63 
 
 		 283 aa  48.9  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69594  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4436  beta-lactamase class A-like protein  27.72 
 
 		 293 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101027  normal  0.450402 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3301  beta-lactamase  31.58 
 
 		 304 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5138  putative lipoprotein LpqF  32.56 
 
 		 443 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4752  putative lipoprotein LpqF  32.56 
 
 		 443 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.164946  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4838  putative lipoprotein LpqF  32.56 
 
 		 443 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3133  beta-lactamase  24.62 
 
 		 283 aa  47  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3960  hypothetical protein  25.3 
 
 		 295 aa  47  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0491  putative beta-lactamase protein  25.77 
 
 		 440 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1434  beta-lactamase  32.56 
 
 		 452 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.685838 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1419  beta-lactamase  27.82 
 
 		 305 aa  45.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.533278  hitchhiker  0.0000178355 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5353  beta-lactamase  32.56 
 
 		 454 aa  45.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1458  beta-lactamase  26.49 
 
 		 306 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.755992  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  22.22 
 
 		 422 aa  44.3  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1561  D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase  22.62 
 
 		 272 aa  43.5  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4061  peptidase S11, D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase 1  27.83 
 
 		 462 aa  42.7  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0948172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1748  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  27.12 
 
 		 414 aa  42.7  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0507  putative secreted protein  25.57 
 
 		 326 aa  42.7  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3604  peptidase S11, D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase 1  29.88 
 
 		 308 aa  42.7  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>