More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6549 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012854  Rleg_6549  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
281 aa  565  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.385661  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5584  alpha/beta hydrolase fold  89.32 
 
 
281 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.554679  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6254  alpha/beta hydrolase fold  67.64 
 
 
277 aa  362  5.0000000000000005e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140494  normal  0.235201 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6084  hydrolase  61.54 
 
 
278 aa  318  7e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6120  alpha/beta hydrolase fold  53.12 
 
 
272 aa  264  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.894817  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  45 
 
 
294 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2479  alpha/beta hydrolase fold  38.15 
 
 
277 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  37.74 
 
 
292 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  37.74 
 
 
277 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  38.13 
 
 
277 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  38.52 
 
 
277 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4154  alpha/beta hydrolase  41.06 
 
 
249 aa  158  8e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  35.74 
 
 
277 aa  157  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3232  3-oxoadipate enol-lactonase  38.19 
 
 
277 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  36.51 
 
 
282 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2408  Alpha/beta hydrolase fold  35.69 
 
 
282 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.734786  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  34.12 
 
 
269 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  34.16 
 
 
275 aa  118  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
275 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  29.44 
 
 
259 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  33.47 
 
 
280 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0084  alpha/beta hydrolase fold protein  30.4 
 
 
246 aa  105  9e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  30.47 
 
 
264 aa  93.2  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  30.35 
 
 
265 aa  92.4  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2938  alpha/beta hydrolase  29.6 
 
 
264 aa  87.8  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0489547  hitchhiker  0.0000722758 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3347  3-oxoadipate enol-lactonase  32.28 
 
 
391 aa  85.5  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000820278  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5996  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)  28.12 
 
 
260 aa  83.6  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  26.69 
 
 
263 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1230  alpha/beta hydrolase fold  25.88 
 
 
261 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6602  alpha/beta hydrolase fold  25.88 
 
 
261 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472817  normal  0.1504 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 
266 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.07 
 
 
370 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 
270 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  26.24 
 
 
380 aa  79.7  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.11 
 
 
370 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  27.56 
 
 
277 aa  79.3  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  30.21 
 
 
251 aa  79  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.53 
 
 
370 aa  79  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2333  alpha/beta fold family hydrolase  27.82 
 
 
280 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 
258 aa  78.6  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.01 
 
 
371 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.01 
 
 
371 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  25.86 
 
 
265 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  25.9 
 
 
270 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.35 
 
 
370 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  28.03 
 
 
256 aa  78.2  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.01 
 
 
371 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  26.38 
 
 
270 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  28.21 
 
 
309 aa  77.4  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3496  alpha/beta hydrolase fold protein  44.33 
 
 
267 aa  75.9  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.094698 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  42 
 
 
367 aa  75.9  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4565  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
303 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0422308  hitchhiker  0.000747551 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  27.92 
 
 
260 aa  74.7  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  28.93 
 
 
256 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1942  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 
266 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000178977  hitchhiker  0.00172948 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  29.49 
 
 
393 aa  74.3  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2144  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 
258 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412012  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  23.83 
 
 
283 aa  74.3  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4100  alpha/beta hydrolase fold  29.05 
 
 
303 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.100635 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2194  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 
258 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000635452  unclonable  0.000004336 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  28.93 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0178  alpha/beta fold family hydrolase  29.04 
 
 
296 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  28.93 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 
265 aa  73.6  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0162  3-oxoadipate enol-lactonase  26.77 
 
 
261 aa  73.6  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1989  alpha/beta hydrolase fold  26.6 
 
 
284 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2227  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 
258 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000690683  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  25.95 
 
 
266 aa  73.2  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2033  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 
266 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000295645  hitchhiker  0.000143979 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4513  hypothetical protein  27.78 
 
 
258 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2136  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 
266 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000406984  decreased coverage  0.00000741326 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1579  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 
265 aa  73.2  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  41 
 
 
252 aa  72.8  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  29.43 
 
 
263 aa  72.8  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.59 
 
 
369 aa  72.4  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0538  alpha/beta hydrolase fold  26.28 
 
 
299 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.282885  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  30.16 
 
 
265 aa  72.4  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  39.2 
 
 
368 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.03 
 
 
368 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1498  alpha/beta fold family hydrolase  28.63 
 
 
301 aa  72  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  30.94 
 
 
263 aa  72  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  38.4 
 
 
368 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0847  alpha/beta hydrolase fold protein  37.78 
 
 
404 aa  72  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.135304  normal  0.159023 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.01 
 
 
371 aa  72  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  25.63 
 
 
261 aa  71.6  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4460  3-oxoadipate enol-lactonase  31.84 
 
 
263 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1652  alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 
299 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0627  alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 
299 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  28.08 
 
 
299 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0545  alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 
299 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0891  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 
271 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.020907 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1708  alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 
299 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0456043  normal  0.790109 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5837  alpha/beta hydrolase fold  26.28 
 
 
316 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381935  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1679  alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 
299 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5609  alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 
299 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333622  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2240  alpha/beta hydrolase fold protein  27.38 
 
 
258 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000309374  hitchhiker  0.000000000781643 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.64 
 
 
370 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1237  alpha/beta fold family hydrolase  29.63 
 
 
301 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 
286 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>