More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3935 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3935  ABC transporter related  100 
 
 
270 aa  545  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3646  ABC transporter related  92.59 
 
 
270 aa  488  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1667  ABC transporter related  53.63 
 
 
260 aa  272  4.0000000000000004e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0642211  normal  0.357453 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2118  ABC transporter related protein  45.53 
 
 
250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4255  ABC transporter related protein  47.98 
 
 
267 aa  230  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122186  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0671  ABC transporter related  47.98 
 
 
255 aa  224  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.033181 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0803  ABC transporter, ATP-binding protein  43.67 
 
 
249 aa  221  7e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17589e-46 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0692  ABC transporter ATP-binding protein  43.67 
 
 
249 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0636  ABC transporter, ATP-binding protein  43.67 
 
 
249 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000460876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0636  ABC transporter, ATP-binding protein  43.67 
 
 
249 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0726  ABC transporter ATP-binding protein  43.67 
 
 
249 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00713867  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3118  ABC transporter related  48.39 
 
 
254 aa  219  3e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.758008  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4876  ABC transporter, ATP-binding protein  42.74 
 
 
249 aa  219  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0613  ABC transporter-related protein  43.67 
 
 
249 aa  219  3e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0668  ABC transporter related  47.58 
 
 
255 aa  219  3e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0783  ABC transporter, ATP-binding protein  43.27 
 
 
249 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0642  ABC transporter related  42.86 
 
 
249 aa  218  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0448  ABC transporter, ATP-binding protein  42.32 
 
 
249 aa  218  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0796  ABC transporter, ATP-binding protein  43.27 
 
 
249 aa  216  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0880  ABC transporter, ATP-binding protein  43.27 
 
 
249 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.018154  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4548  ABC transporter, ATP-binding protein  43.27 
 
 
249 aa  215  5e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0719358  normal  0.368942 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3016  ABC transporter related protein  48.4 
 
 
259 aa  215  5e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.840701  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2066  ABC transporter related protein  43.44 
 
 
244 aa  214  9.999999999999999e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.572481  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0493  ABC transporter, ATP-binding protein  41.91 
 
 
249 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0369  ABC transporter ATP-binding protein  41.91 
 
 
249 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0356  ABC transporter, ATP-binding protein  41.91 
 
 
249 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0383  ABC transporter ATP-binding protein  41.91 
 
 
249 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0426  ABC transporter, ATP-binding protein  41.91 
 
 
249 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0359  ABC transporter, ATP-binding protein  41.49 
 
 
249 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0495  ABC transporter, ATP-binding protein  41.91 
 
 
249 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3203  ABC transporter related  47.19 
 
 
275 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565389  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0372  ABC transporter-related protein  42.5 
 
 
250 aa  210  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0437  ABC transporter related  43.03 
 
 
235 aa  209  4e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0452  ABC transporter related  43.03 
 
 
235 aa  209  4e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0364  ABC transporter related  40.66 
 
 
249 aa  207  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1220  ABC transporter related protein  43.67 
 
 
262 aa  206  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1153  ABC transporter related  41.84 
 
 
246 aa  205  7e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0406  ABC transporter related  42.49 
 
 
249 aa  201  8e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0871971  decreased coverage  0.00677494 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  44.87 
 
 
265 aa  201  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1644  ABC transporter related protein  47.81 
 
 
257 aa  199  5e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.609657  normal  0.614452 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2679  ABC transporter, ATP-binding protein  43.04 
 
 
265 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0252  ABC transporter, ATP-binding protein  43.04 
 
 
288 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.616609  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  43.04 
 
 
265 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0036  ABC transporter, ATP-binding protein  43.04 
 
 
265 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  43.04 
 
 
265 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2698  ABC transporter, ATP-binding protein  43.04 
 
 
288 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  43.04 
 
 
288 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1854  ABC transporter, ATP-binding protein  43.04 
 
 
265 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.812783  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2978  ABC transporter related  43.72 
 
 
255 aa  198  9e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13650  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  47.62 
 
 
255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0816  ABC transporter related  45.65 
 
 
263 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.117233  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  40.97 
 
 
258 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3217  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  41.88 
 
 
265 aa  195  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0034  ABC transporter related  39.69 
 
 
265 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1530  ABC transporter related  41.74 
 
 
285 aa  195  8.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0035  ABC transporter related  39.69 
 
 
265 aa  194  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3960  ABC transporter related  42.61 
 
 
265 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0037  ABC transporter related  40.08 
 
 
265 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0025  ABC transporter related  39.69 
 
 
265 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3676  ABC transporter related  44.94 
 
 
266 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.618015 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0033  ABC transporter related  40.08 
 
 
265 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0052  ABC transporter related  40.08 
 
 
265 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4149  ABC transporter related  46.09 
 
 
266 aa  193  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0621662 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  43.36 
 
 
244 aa  194  2e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1759  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  45.65 
 
 
275 aa  193  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.352483  hitchhiker  0.00557552 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3513  ABC transporter related  41.38 
 
 
279 aa  193  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5342  ABC transporter related  41.74 
 
 
272 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.682879 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1308  ABC transporter related  41.44 
 
 
252 aa  192  4e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5062  ABC transporter related  41.3 
 
 
272 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.948706 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2083  ABC transporter related  52.48 
 
 
223 aa  192  6e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.790861  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3328  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.43 
 
 
272 aa  191  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  43.31 
 
 
278 aa  191  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4114  ABC transporter related  45.65 
 
 
273 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4338  ABC transporter related  43.72 
 
 
271 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4252  ABC transporter related  45.65 
 
 
273 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0391855  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3455  ABC transporter-related protein  40.72 
 
 
254 aa  190  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.302044  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3092  ABC transporter related  42.17 
 
 
275 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935227  normal  0.896647 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3265  ABC transporter related  45.65 
 
 
273 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.952951 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  42.92 
 
 
244 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.94 
 
 
284 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4036  ABC transporter related  41.59 
 
 
273 aa  189  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.494746  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4148  ABC transporter related  41.59 
 
 
273 aa  189  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.958173  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  41.6 
 
 
261 aa  189  5e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0336  ABC transporter, ATP-binding protein  40.72 
 
 
254 aa  189  5e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  40.6 
 
 
284 aa  189  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  41.13 
 
 
291 aa  188  7e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4902  ABC transporter, ATP-binding protein  40.72 
 
 
254 aa  188  8e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0518  ABC transporter related  41.07 
 
 
251 aa  188  8e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0668651 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  43.81 
 
 
258 aa  188  9e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3115  ABC transporter related  42.17 
 
 
272 aa  188  9e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200151  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  42.11 
 
 
286 aa  187  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  42.73 
 
 
254 aa  187  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2563  ABC transporter related  45.24 
 
 
252 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  40.64 
 
 
271 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  40.24 
 
 
271 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  43.36 
 
 
286 aa  187  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.15 
 
 
283 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4516  ABC transporter, ATP-binding protein  40.27 
 
 
254 aa  187  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  39.68 
 
 
251 aa  187  2e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  43.72 
 
 
265 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>