More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2455 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2455  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 351 aa  719    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0116  transcriptional regulator, AraC family  85.47 
 
 		 351 aa  616  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.615337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4230  transcriptional regulator, AraC family  46.2 
 
 		 363 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1392  transcriptional regulator  42.3 
 
 		 339 aa  300  3e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.683187  normal  0.572085 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3318  AraC family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 345 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0872  AraC family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 382 aa  207  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1004  AraC family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 351 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.429935  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2118  HTH-type transcriptional regulator  32.91 
 
 		 328 aa  187  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0590  transcriptional regulator  34.08 
 
 		 347 aa  187  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02019  transcription regulator protein  34.71 
 
 		 387 aa  186  6e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4832  transcriptional regulator  34.71 
 
 		 393 aa  184  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.304205  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3335  AraC family transcriptional regulator  33.23 
 
 		 361 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.519645 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5126  AraC family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 357 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5153  AraC family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 360 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0484  transcriptional regulator  34.08 
 
 		 356 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0397  AraC/XylS family transcription factor  33.44 
 
 		 396 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1602  transcriptional regulator  33.23 
 
 		 360 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1956  transcriptional regulator  33.44 
 
 		 396 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976768  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1864  AraC family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 410 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5071  AraC family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 357 aa  180  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3214  AraC family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 360 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5046  transcriptional regulator, AraC family  33.23 
 
 		 360 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.311453 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4548  AraC family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 357 aa  179  8e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0994  AraC family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 462 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3502  AraC family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 355 aa  178  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5286  transcriptional regulator, AraC family  30.16 
 
 		 337 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.371656  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4842  transcriptional regulator, AraC family  30.35 
 
 		 337 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.195064 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8583  transcriptional regulator, AraC family  32.38 
 
 		 331 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1098  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  32.8 
 
 		 360 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4575  transcriptional regulator  32.18 
 
 		 326 aa  167  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6279  AraC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 338 aa  167  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147886  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3159  AraC family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 334 aa  166  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0609208 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3514  transcriptional regulator  32.92 
 
 		 334 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.505982  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2953  helix-turn-helix domain-containing protein  31.95 
 
 		 349 aa  163  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2210  AraC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 325 aa  162  9e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3564  AraC family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 325 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6861  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 350 aa  160  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.133867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0814  AraC family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 343 aa  159  5e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2357  AraC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 332 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2481  AraC family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 331 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.25538 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7250  transcriptional regulator AraC family  28.98 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.76914  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3933  AraC family transcriptional regulator  33.23 
 
 		 337 aa  150  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1950  transcriptional regulator  33.44 
 
 		 341 aa  145  9e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1687  AraC family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 345 aa  142  8e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0447832  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3394  transcriptional regulator, AraC family  31.23 
 
 		 334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4021  AraC family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 353 aa  140  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6166  putative transcriptional regulator  31.21 
 
 		 367 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165565  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71070  AraC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 367 aa  139  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0400  AraC family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 336 aa  138  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1567  AraC family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 337 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226821  normal  0.377129 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2922  transcriptional regulator  29.61 
 
 		 337 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3735  helix-turn-helix domain-containing protein  31.13 
 
 		 343 aa  136  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1100  AraC family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 334 aa  136  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0397278 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0323  AraC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 368 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1140  AraC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 322 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_004310  BR0307  AraC family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 338 aa  135  9e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.96292  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4030  transcriptional regulator, AraC family  30.82 
 
 		 343 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.364388 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0465  transcriptional regulator, AraC family  30.03 
 
 		 367 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0490  transcriptional regulator  30.16 
 
 		 364 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4910  AraC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 368 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942326 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0298  AraC family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 368 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000218642 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5236  transcriptional regulator  30.34 
 
 		 367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.59007  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0318  AraC family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 368 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.120478 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4708  helix-turn-helix, AraC type:ThiJ/PfpI  30.03 
 
 		 367 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3990  transcriptional regulator, AraC family  30.82 
 
 		 344 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2253  AraC family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 321 aa  133  5e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0321  AraC family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 336 aa  132  6e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.5557  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2488  AraC family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 344 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0469  AraC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4903  AraC family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0541  transcriptional regulator  30.88 
 
 		 341 aa  130  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.514345  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1007  AraC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 365 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.809611  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0739  AraC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 365 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2105  AraC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 421 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0570  transcriptional regulator  30.79 
 
 		 371 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3545  AraC family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 341 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5086  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 371 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.754601 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5199  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 341 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3304  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 338 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3282  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 371 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4498  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0711  AraC family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 341 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1980  AraC family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 341 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.433985  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1869  AraC family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 341 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0987  transcriptional regulator  28.74 
 
 		 375 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0827  AraC family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 365 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4061  AraC family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 401 aa  127  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.135508  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_003296  RS02029  transcriptional regulator transcription regulator protein  28.62 
 
 		 343 aa  126  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.130887 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2664  AraC family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 368 aa  126  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0165303  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0968  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 332 aa  126  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5023  AraC family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 341 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1525  HTH-type transcriptional regulator  28.34 
 
 		 339 aa  126  5e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.199497 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0305  AraC family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 319 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276318 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1931  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 332 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.746291  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0448  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 332 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3921  transcriptional regulator, AraC family  26.73 
 
 		 327 aa  126  7e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.441659  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0566  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 332 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.207783  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2025  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 332 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0901  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 332 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1868  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 332 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>