More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1882 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1882  ABC transporter related  100 
 
 		 247 aa  508  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.376735 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1696  ABC transporter related  97.17 
 
 		 247 aa  470  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3533  ABC transporter related  55.97 
 
 		 255 aa  274  9e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2702  ABC transporter related  54.32 
 
 		 257 aa  273  3e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3252  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  54.73 
 
 		 254 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0407967  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5169  ABC transporter related  56.38 
 
 		 247 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.309766 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2461  ABC transporter related  56.38 
 
 		 251 aa  265  5e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.124723 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1921  ABC transporter component  56.38 
 
 		 262 aa  264  8e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.172569  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1883  ABC transporter related  54.51 
 
 		 258 aa  264  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.179514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0803  ABC dipeptide transporter, ATPase subunit DppF  55.97 
 
 		 251 aa  263  2e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.592318  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1252  ABC transporter related  55.33 
 
 		 251 aa  263  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3367  ABC transporter related  52.26 
 
 		 268 aa  259  3e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0376  ABC transporter related  56.38 
 
 		 251 aa  259  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5438  ABC transporter related  54.73 
 
 		 247 aa  259  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.62538  hitchhiker  0.00360775 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3737  ABC transporter related  55.23 
 
 		 246 aa  256  3e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0034  ABC transporter related  52.07 
 
 		 256 aa  256  3e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0458238  normal  0.202897 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3989  ABC transporter related  53.28 
 
 		 246 aa  254  8e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0139  ABC transporter related  52.87 
 
 		 246 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2322  ABC transporter related  52.26 
 
 		 255 aa  251  6e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1026  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  49.59 
 
 		 260 aa  248  6e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.259586  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4176  ABC transporter related  51 
 
 		 249 aa  247  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4040  ABC transporter related protein  50.21 
 
 		 269 aa  246  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3092  ABC transporter related  50.62 
 
 		 265 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3884  ABC transporter  54.5 
 
 		 250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.940827  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1902  ABC transporter related  49.59 
 
 		 254 aa  241  7.999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0503129  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3848  ABC transporter related  50.2 
 
 		 249 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2042  ABC transporter related  49.59 
 
 		 249 aa  238  8e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.574397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2718  ABC transporter related  49.59 
 
 		 249 aa  238  8e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3202  ABC transporter related  54.91 
 
 		 248 aa  237  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.709226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3833  ABC transporter related  54.55 
 
 		 257 aa  234  7e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1249  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  50.62 
 
 		 258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.826574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3773  ABC transporter related  50.21 
 
 		 258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4595  ABC transporter related  50.21 
 
 		 258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.551817  normal  0.570129 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5710  ABC transporter related  50.21 
 
 		 258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0410185 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4021  ABC transporter related  50.62 
 
 		 258 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4483  ABC transporter related  50.21 
 
 		 253 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.590238  normal  0.708909 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4036  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATP binding protein  54.39 
 
 		 238 aa  231  9e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3690  ABC transporter related  54.39 
 
 		 238 aa  231  9e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4008  ABC transporter related  52.26 
 
 		 255 aa  231  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2557  ABC transporter system, ATP-binding protein  49.38 
 
 		 262 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1306  ABC transporter, ATP-binding protein  49.38 
 
 		 262 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205753  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1387  ABC transporter, ATP-binding protein  49.38 
 
 		 262 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0777741  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3555  ABC dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, ATP binding protein  53.95 
 
 		 238 aa  228  5e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1446  ABC transporter system, ATP-binding protein  48.56 
 
 		 255 aa  228  6e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4052  ABC transporter related  49.79 
 
 		 253 aa  228  7e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194044  normal  0.679369 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7648  ABC transporter related  49.79 
 
 		 252 aa  228  7e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0251  ABC transporter, ATP-binding protein  49.38 
 
 		 255 aa  228  9e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.615129  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0522  ABC transporter, ATP-binding protein  49.38 
 
 		 255 aa  228  9e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451291  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1278  ABC transporter, ATP-binding protein  49.38 
 
 		 262 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.202485  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1046  ABC transporter, ATP-binding protein  49.38 
 
 		 262 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3863  ABC transporter related  50.21 
 
 		 269 aa  226  3e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0193  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  50.62 
 
 		 260 aa  226  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0231256 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1667  ABC transporter related  48.8 
 
 		 283 aa  222  4e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6305  ABC transporter related  48.97 
 
 		 260 aa  221  9e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1582  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.48 
 
 		 282 aa  221  9.999999999999999e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.322929  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3381  ABC transporter related  58.17 
 
 		 246 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.52884  normal  0.234483 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1586  ABC transporter related  48.48 
 
 		 282 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.159648  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0803  ABC transporter component  50.4 
 
 		 252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.179531  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3783  ABC transporter related  48.12 
 
 		 328 aa  211  7e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.259832  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1101  ABC transporter related  53.6 
 
 		 234 aa  210  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0500  ABC transporter ATP-binding protein  47.28 
 
 		 328 aa  209  5e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5163  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 		 321 aa  208  8e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2060  ABC transporter related  50.69 
 
 		 228 aa  207  9e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.558102 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16500  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  47.39 
 
 		 531 aa  207  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.892768  normal  0.399532 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0434  ABC transporter related  44.84 
 
 		 522 aa  207  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3434  ABC transporter related  47.14 
 
 		 536 aa  206  3e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.560851 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0570  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.1 
 
 		 308 aa  206  4e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0271  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  45.96 
 
 		 337 aa  205  4e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0727  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.1 
 
 		 308 aa  205  6e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0333  ABC transporter related  45.92 
 
 		 275 aa  205  6e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.069835 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0626  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  45.1 
 
 		 308 aa  204  7e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0569  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.1 
 
 		 308 aa  204  7e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187494  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0659  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  45.1 
 
 		 308 aa  204  7e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.575275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0716  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.1 
 
 		 308 aa  204  7e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000233806 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0788  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.1 
 
 		 308 aa  204  8e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0634106  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2570  ABC transporter ATP-binding protein  46.28 
 
 		 602 aa  204  8e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.088253  normal  0.116617 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0573  ABC transporter related  45.1 
 
 		 308 aa  204  9e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2128  ATP-binding protein of oligopeptide ABC transporter  46.77 
 
 		 345 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0554  ABC transporter-related protein  45.1 
 
 		 308 aa  203  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2968  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  43.2 
 
 		 328 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129298  normal  0.413022 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  44.4 
 
 		 571 aa  203  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04940  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.97 
 
 		 326 aa  203  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00804417  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2803  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.26 
 
 		 337 aa  202  3e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5293  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.08 
 
 		 294 aa  202  5e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1008  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.61 
 
 		 282 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.462134  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  47.33 
 
 		 543 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2173  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.68 
 
 		 376 aa  200  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.98974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3394  ABC transporter related  45.56 
 
 		 543 aa  199  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3404  ABC transporter related  45.56 
 
 		 543 aa  199  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.455946 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0950  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.61 
 
 		 276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3456  ABC transporter related  45.56 
 
 		 543 aa  199  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0542416  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2236  ATPase  44.18 
 
 		 554 aa  199  3.9999999999999996e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.274783 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2174  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  48.44 
 
 		 326 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.837034  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1270  ABC transporter related  45.18 
 
 		 308 aa  199  5e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0429  ABC transporter related  45.27 
 
 		 269 aa  199  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  47.33 
 
 		 543 aa  199  5e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4730  ABC transporter related  45.81 
 
 		 273 aa  199  5e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1847  ABC transporter related protein  43.82 
 
 		 292 aa  199  5e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.240522  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6473  putative oligopeptide ABC transporter (ATP binding protein)  47.58 
 
 		 350 aa  198  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1953  glutathione import ATP-binding protein GsiA  45.76 
 
 		 686 aa  198  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>