55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1571 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1571  hypothetical protein  100 
 
 		 561 aa  1167    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0411121  normal  0.0104962 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5186  hypothetical protein  43.9 
 
 		 558 aa  431  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3425  hypothetical protein  34.19 
 
 		 569 aa  292  1e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3095  hypothetical protein  31.29 
 
 		 548 aa  231  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.312761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6541  hypothetical protein  25.41 
 
 		 715 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.322515 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3012  hypothetical protein  27.63 
 
 		 591 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6987  phospholipase D/Transphosphatidylase  27.12 
 
 		 590 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0890  hypothetical protein  25.87 
 
 		 600 aa  113  9e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2088  phospholipase D/transphosphatidylase  26.17 
 
 		 601 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0376  phospholipase D/transphosphatidylase  26.99 
 
 		 597 aa  109  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4994  phospholipase D/transphosphatidylase  26.94 
 
 		 598 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.328627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3093  phospholipase D/transphosphatidylase  26.67 
 
 		 598 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5274  phospholipase D/transphosphatidylase  26.67 
 
 		 598 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0503  phospholipase D  26.84 
 
 		 601 aa  107  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1993  phospholipase D/transphosphatidylase  26.84 
 
 		 601 aa  107  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1640  phospholipase D domain-containing protein  26.49 
 
 		 601 aa  107  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0687  hypothetical protein  26.49 
 
 		 601 aa  107  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.128998  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0575  hypothetical protein  26.49 
 
 		 601 aa  107  8e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.577633  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0772  hypothetical protein  26.49 
 
 		 601 aa  107  8e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4634  phospholipase D/transphosphatidylase  25.25 
 
 		 593 aa  103  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3378  hypothetical protein  23.27 
 
 		 575 aa  102  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3447  phospholipase D/transphosphatidylase  26.68 
 
 		 613 aa  102  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5163  phospholipase D/transphosphatidylase  25.08 
 
 		 593 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.111415 
 
 
-
 
NC_002950  PG1291  hypothetical protein  23.42 
 
 		 575 aa  99.4  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3340  phospholipase D/transphosphatidylase  24.73 
 
 		 575 aa  99  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.014748  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4092  hypothetical protein  24.43 
 
 		 589 aa  97.8  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0681122  normal  0.10064 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3979  hypothetical protein  24.43 
 
 		 589 aa  97.8  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46540  hypothetical protein  23 
 
 		 566 aa  94.4  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000624793  hitchhiker  0.00000317179 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2486  hypothetical protein  22.01 
 
 		 585 aa  84.7  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0565  hypothetical protein  24.93 
 
 		 659 aa  67.8  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4280  phospholipase D/transphosphatidylase  22.49 
 
 		 376 aa  64.7  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000117632  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3028  phospholipase D/transphosphatidylase  24.94 
 
 		 481 aa  61.2  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1075  phospholipase D/transphosphatidylase  25.71 
 
 		 487 aa  58.5  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2958  phospholipase D/transphosphatidylase  23.77 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3228  helix-hairpin-helix motif protein  24.49 
 
 		 545 aa  57.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.269914 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2868  helix-hairpin-helix motif protein  24.26 
 
 		 545 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0396  phospholipase D/transphosphatidylase  21.94 
 
 		 472 aa  51.6  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.0001004  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4857  phospholipase D/transphosphatidylase  26.22 
 
 		 528 aa  50.4  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404738  hitchhiker  0.00000312959 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5002  endonuclease  36.51 
 
 		 190 aa  49.7  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.209573 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2621  putative endonuclease protein  30.77 
 
 		 197 aa  49.3  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.958419  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5407  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  36.51 
 
 		 188 aa  48.9  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2452  putative endonuclease protein  24.2 
 
 		 189 aa  48.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2720  putative endonuclease protein  31.65 
 
 		 194 aa  47.8  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2331  putative endonuclease protein  24.42 
 
 		 189 aa  47.8  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870825  normal  0.178627 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1870  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  24.01 
 
 		 545 aa  47.8  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.791569  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02971  hypothetical protein  22.13 
 
 		 467 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.977109 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1736  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  39.29 
 
 		 213 aa  44.7  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000000866452  hitchhiker  0.000020321 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2079  endonuclease  39.29 
 
 		 213 aa  44.7  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3593  phospholipase D/transphosphatidylase  33.85 
 
 		 393 aa  44.7  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0515773 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_7664  predicted protein  31.67 
 
 		 151 aa  44.3  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.305132  normal  0.408477 
 
 
-
 
NC_003296  RS04805  hypothetical protein  25.6 
 
 		 165 aa  44.7  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207481  normal  0.316155 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6783  putative endonuclease  41.27 
 
 		 186 aa  44.3  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.023889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5710  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  23.19 
 
 		 391 aa  44.3  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0126  phospholipase D (PLD) family protein  31.58 
 
 		 175 aa  44.3  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.204585  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0290  endonuclease  27.05 
 
 		 176 aa  43.9  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>