57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0199 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA3008  hypothetical protein  61.17 
 
 		 1012 aa  1178    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1594  hypothetical protein  44.16 
 
 		 920 aa  724    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2145  protein of unknown function DUF1156  48.56 
 
 		 937 aa  857    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000164543  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1235  protein of unknown function DUF1156  56.95 
 
 		 951 aa  1046    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0199  protein of unknown function DUF1156  100 
 
 		 969 aa  1993    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676396  normal  0.41687 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2103  protein of unknown function DUF1156  42.96 
 
 		 961 aa  733    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.423161 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0638  protein of unknown function DUF1156  46.07 
 
 		 906 aa  764    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00295664  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1018  protein of unknown function DUF1156  45.4 
 
 		 968 aa  771    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2496  protein of unknown function DUF1156  56.37 
 
 		 962 aa  1020    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2991  hypothetical protein  48.97 
 
 		 933 aa  868    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0317555  normal  0.296182 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0682  hypothetical protein  48.81 
 
 		 848 aa  770    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0198  hypothetical protein  47.48 
 
 		 933 aa  841    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.213354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1848  hypothetical protein  45.77 
 
 		 968 aa  830    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2630  hypothetical protein  65.38 
 
 		 561 aa  717    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.100326  normal  0.0779546 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0635  hypothetical protein  63.22 
 
 		 972 aa  1239    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2719  hypothetical protein  59.25 
 
 		 965 aa  1095    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000742651 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0655  hypothetical protein  58.87 
 
 		 969 aa  1087    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2190  hypothetical protein  47.32 
 
 		 792 aa  729    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1753  hypothetical protein  47.63 
 
 		 960 aa  844    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3562  adenine-specific DNA methylase  52.83 
 
 		 455 aa  452  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4275  hypothetical protein  30.67 
 
 		 1001 aa  314  4.999999999999999e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3988  hypothetical protein  29.06 
 
 		 982 aa  291  3e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.172712 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3987  hypothetical protein  29.61 
 
 		 967 aa  289  2e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.375617 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2009  hypothetical protein  29.49 
 
 		 996 aa  286  1.0000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.785597  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0506  hypothetical protein  29.62 
 
 		 1003 aa  276  2.0000000000000002e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.967914  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4236  hypothetical protein  25.43 
 
 		 934 aa  241  5.999999999999999e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3117  hypothetical protein  25.14 
 
 		 936 aa  238  5.0000000000000005e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0239  hypothetical protein  29.37 
 
 		 1106 aa  210  9e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00821808 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1608  hypothetical protein  31.63 
 
 		 1279 aa  201  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1395  hypothetical protein  50.9 
 
 		 194 aa  145  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5892  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  23.57 
 
 		 911 aa  139  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5492  adenine-specific DNA methylase  23.57 
 
 		 911 aa  139  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.219644  normal  0.117593 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1808  hypothetical protein  22.6 
 
 		 1008 aa  120  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0837285  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0719  hypothetical protein  25.03 
 
 		 947 aa  118  5e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000148143 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2761  adenine-specific DNA methylase  20.73 
 
 		 892 aa  117  6.9999999999999995e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3347  adenine-specific DNA methylase  21.34 
 
 		 878 aa  108  4e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2191  hypothetical protein  46 
 
 		 121 aa  100  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1772  adenine-specific DNA methylase  21.09 
 
 		 916 aa  97.4  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2684  hypothetical protein  29.46 
 
 		 1045 aa  92.4  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3100  hypothetical protein  28.73 
 
 		 1070 aa  91.3  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2132  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1118 aa  90.5  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0099  hypothetical protein  28.63 
 
 		 1071 aa  89.4  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.658498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0382  protein of unknown function DUF1156  22.96 
 
 		 894 aa  87  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.41417  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4967  protein of unknown function DUF1156  25.08 
 
 		 745 aa  84.3  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.241084 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0982  hypothetical protein  25.13 
 
 		 1001 aa  77.8  0.0000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2281  adenine-specific DNA methylase  20.5 
 
 		 751 aa  77  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186187  hitchhiker  0.00483181 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1367  hypothetical protein  21.81 
 
 		 746 aa  75.9  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0685  hypothetical protein  38.94 
 
 		 146 aa  75.1  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199679  normal  0.333375 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1948  hypothetical protein  21.52 
 
 		 731 aa  74.3  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2196  adenine-specific DNA methylase  21.39 
 
 		 747 aa  71.6  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1353  putative DNA methylase containing a Zn-ribbon  22.64 
 
 		 995 aa  66.2  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3097  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  29.61 
 
 		 737 aa  62  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.622238  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2279  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  25.47 
 
 		 651 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.132856  hitchhiker  0.000043664 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0013  DNA methylase containing a Zn-ribbon  24.36 
 
 		 979 aa  59.7  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607191  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1600  protein of unknown function DUF1156  20.82 
 
 		 964 aa  53.9  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000970911  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0546  DNA methylase containing a Zn-ribbon  48.84 
 
 		 1003 aa  49.3  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2173  putative DNA methylase containing a Zn-ribbon  44.44 
 
 		 979 aa  46.6  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.145611  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>