More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4907 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4907  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 332 aa  683    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38721  normal  0.998424 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4817  transcriptional regulator, AraC family  89.46 
 
 		 333 aa  593  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0868306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6124  transcriptional regulator, AraC family  52.71 
 
 		 338 aa  361  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.609477  normal  0.144124 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0034  transcriptional regulator, AraC family  52.13 
 
 		 329 aa  349  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.708587  normal  0.341861 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0049  transcriptional regulator, AraC family  51.52 
 
 		 329 aa  348  7e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5364  transcriptional regulator, AraC family  44.11 
 
 		 339 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0980026  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5084  transcriptional regulator, AraC family  44.12 
 
 		 343 aa  279  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0576152  normal  0.130155 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4778  transcriptional regulator, AraC family  39.5 
 
 		 340 aa  153  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0612761 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4832  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 339 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0998154 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1342  AraC family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 330 aa  126  6e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000130742 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0980  AraC family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6358  AraC family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 341 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0928  transcriptional regulator, AraC family  27.37 
 
 		 322 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048555 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6015  AraC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 341 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6310  AraC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 341 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.933821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3427  AraC family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 329 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175517  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3322  AraC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 337 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1832  transcription regulator protein  38.89 
 
 		 342 aa  107  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6770  AraC family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 355 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.758188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5484  AraC family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 355 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2727  putative transcriptional regulator  32.21 
 
 		 333 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.858473  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3221  AraC family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 352 aa  102  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32190  putative transcriptional regulator  31.25 
 
 		 333 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0320544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7176  AraC family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 355 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0312  transcriptional regulator, AraC family  32.16 
 
 		 322 aa  99  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2378  AraC family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 322 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163707 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3887  AraC family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 327 aa  94  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3079  AraC family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 336 aa  94  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0714  AraC family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 326 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.571232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3471  AraC family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 368 aa  90.5  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  33.73 
 
 		 198 aa  90.1  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0577701  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0202  AraC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 321 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2708  AraC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 334 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.792624  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0233  AraC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 334 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.533146  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1574  AraC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 334 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26160  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  29.12 
 
 		 338 aa  89  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0984  AndR  45.45 
 
 		 405 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2564  AraC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 389 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1377  AraC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 341 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00832504  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4352  AraC family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 321 aa  87.8  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1789  AraC family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 392 aa  87.4  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.327521  normal  0.830389 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3194  helix-turn-helix domain-containing protein  39.45 
 
 		 322 aa  87.4  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0487  AraC family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 341 aa  87  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1996  helix-turn-helix domain-containing protein  28.89 
 
 		 327 aa  86.7  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0970  AraC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 343 aa  86.3  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1167  AraC family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 334 aa  85.9  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3774  AraC family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 319 aa  85.9  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.425956 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4589  AraC family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 319 aa  85.9  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0760  transcriptional regulator, AraC family  32.37 
 
 		 327 aa  85.5  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3749  AraC family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 319 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.315672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2039  AraC family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 326 aa  85.1  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.28183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4958  AraC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 319 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4759  transcriptional regulator, AraC family  32.85 
 
 		 332 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2326  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1820  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.55 
 
 		 314 aa  84.7  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0570  transcriptional regulator, AraC family  27.64 
 
 		 325 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5501  AraC family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 321 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1874  AraC family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 341 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.612156 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3666  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.293166  normal  0.370367 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4528  transcriptional regulator, AraC family  36.89 
 
 		 373 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1107  AraC family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 321 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.616018  normal  0.0688148 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7075  AraC family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 327 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0135  helix-turn-helix, AraC type  30.25 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6408  AraC family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 341 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.565487 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4191  AraC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 336 aa  80.9  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.380899  normal  0.0406383 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3812  AraC family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 328 aa  80.9  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.254073  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0733  AraC family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0573176  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1122  positive transcriptional regulator AndR  40.57 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0731  helix-turn-helix domain-containing protein  32.9 
 
 		 326 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.271743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6120  AraC family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 342 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3905  helix-turn-helix domain-containing protein  41.51 
 
 		 118 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.831613 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2756  transcriptional regulator, AraC family  31.69 
 
 		 340 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0730533  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9068  transcriptional regulator AraC family  22.91 
 
 		 323 aa  77.8  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4195  AraC family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 320 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0478  helix-turn-helix domain-containing protein  26.88 
 
 		 324 aa  78.2  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2363  helix-turn-helix domain-containing protein  23.89 
 
 		 326 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140841  normal  0.0639291 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0594  helix-turn-helix domain-containing protein  35.19 
 
 		 326 aa  77.8  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3837  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2406  helix-turn-helix, AraC type  27.78 
 
 		 330 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.143452  normal  0.0891394 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1873  helix-turn-helix domain-containing protein  37.27 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2656  transcriptional regulator, AraC family  28.49 
 
 		 334 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4889  AraC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 335 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3275  AraC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 335 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000715  ethanolamine operon regulatory protein  36.61 
 
 		 354 aa  76.3  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0626  transcriptional regulator, AraC family  43.56 
 
 		 329 aa  75.5  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3045  AraC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 330 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0584  AraC family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 330 aa  75.9  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.154846  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2592  transcriptional regulator EutR  33.33 
 
 		 350 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4803  helix-turn-helix domain-containing protein  31.71 
 
 		 340 aa  75.9  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0118  helix-turn-helix domain-containing protein  28.42 
 
 		 331 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547466 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1224  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6918  AraC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 335 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0840  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 330 aa  74.7  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.916839  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02299  hypothetical protein  33.33 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4893  AraC family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 340 aa  74.7  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0335  AraC family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 355 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1242  transcriptional regulator EutR  33.33 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2574  transcriptional regulator EutR  33.33 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2723  transcriptional regulator EutR  33.33 
 
 		 350 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3667  transcriptional regulator EutR  33.33 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>