More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4634 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4634  ABC transporter related  100 
 
 
263 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6448  ABC transporter related  87.07 
 
 
263 aa  481  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0465386 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5964  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  78.63 
 
 
263 aa  432  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4841  ABC transporter related  58.98 
 
 
289 aa  308  4e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.981864  normal  0.138787 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1822  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  58.98 
 
 
289 aa  308  5e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.619469  normal  0.513122 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5107  ABC transporter related  58.98 
 
 
288 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.565402  hitchhiker  0.00303563 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0719  ABC transporter related  54.44 
 
 
256 aa  291  1e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.945616 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1298  ABC transporter component  57.03 
 
 
263 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.943578  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  53.57 
 
 
259 aa  277  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  55.12 
 
 
263 aa  277  1e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  54.76 
 
 
259 aa  276  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  52.4 
 
 
263 aa  276  3e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  54.51 
 
 
244 aa  276  3e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  52.78 
 
 
256 aa  271  7e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  54.88 
 
 
273 aa  271  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  54.51 
 
 
244 aa  270  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  54.62 
 
 
244 aa  270  2e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  54.62 
 
 
249 aa  269  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6087  ABC transporter related  51.94 
 
 
280 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.369639 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0934  polar amino acid ABC transporter ATPase  53.52 
 
 
276 aa  268  5e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  54.8 
 
 
239 aa  268  5.9999999999999995e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  53.97 
 
 
267 aa  268  5.9999999999999995e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  54.88 
 
 
246 aa  268  7e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1137  ABC transporter related  54.98 
 
 
240 aa  267  1e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0546952  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  54.88 
 
 
258 aa  267  2e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1959  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.69 
 
 
242 aa  266  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131421  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  52.8 
 
 
263 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1477  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.88 
 
 
240 aa  266  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  54.8 
 
 
244 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0892  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.69 
 
 
240 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0239276  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0923  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.69 
 
 
240 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0351202  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0864  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.69 
 
 
240 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0976  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.69 
 
 
240 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.345768  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0955  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.69 
 
 
240 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.170507  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3439  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.69 
 
 
242 aa  264  8e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4282  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.69 
 
 
242 aa  264  8e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4084  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.69 
 
 
242 aa  264  8e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426839  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27170  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  53.15 
 
 
268 aa  264  1e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1473  ABC transporter related  53.2 
 
 
243 aa  264  1e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0234902  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2932  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.15 
 
 
254 aa  263  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.520228 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  52.8 
 
 
262 aa  263  2e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  49.81 
 
 
268 aa  262  3e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0726  ABC transporter related  52.8 
 
 
243 aa  262  4e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.019566  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2653  polar amino acid ABC transporter ATPase  50.8 
 
 
267 aa  262  4e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2096  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.28 
 
 
240 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.080151  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1124  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.28 
 
 
242 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1485  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.28 
 
 
240 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3156  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.28 
 
 
242 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.805014  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3270  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.28 
 
 
242 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1404  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.28 
 
 
242 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.595222  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2389  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  55.28 
 
 
242 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0390  ABC transporter related  51.59 
 
 
256 aa  261  8.999999999999999e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1826  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  51.78 
 
 
263 aa  260  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0436172  normal  0.140354 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1160  polar amino acid ABC transporter ATPase  53.82 
 
 
254 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236932  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  55.12 
 
 
257 aa  260  1e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0822  ABC transporter-related protein  55.2 
 
 
240 aa  260  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.483351 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1826  ABC transporter related  51.59 
 
 
247 aa  261  1e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0836397  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  53.44 
 
 
240 aa  259  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2934  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  51.38 
 
 
250 aa  259  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4837  ABC transporter related  51.78 
 
 
263 aa  259  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108273 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  50.19 
 
 
262 aa  259  2e-68  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0891394 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  51.79 
 
 
246 aa  260  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1229  ABC transporter related  52.8 
 
 
243 aa  259  3e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  52.8 
 
 
256 aa  259  3e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1325  polar amino acid ABC transporter ATPase  52 
 
 
265 aa  259  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3107  ABC transporter related  53.91 
 
 
245 aa  259  3e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  49.8 
 
 
254 aa  259  4e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7509  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nopaline)  51.18 
 
 
258 aa  258  5.0000000000000005e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.732816  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1582  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.88 
 
 
240 aa  258  6e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.42936  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  52.42 
 
 
244 aa  258  6e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2308  ATPase  50 
 
 
246 aa  258  6e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00400127  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00776  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.88 
 
 
240 aa  258  8e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2833  ABC transporter related protein  54.88 
 
 
240 aa  258  8e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0462198  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0865  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.88 
 
 
240 aa  258  8e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243659  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5576  ABC transporter ATP-binding protein  52.73 
 
 
254 aa  258  8e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00793  hypothetical protein  54.88 
 
 
240 aa  258  8e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2539  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.88 
 
 
240 aa  258  8e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000650247  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2834  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.88 
 
 
240 aa  258  8e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.651413  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  51.38 
 
 
257 aa  257  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2880  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.88 
 
 
240 aa  257  1e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.37937  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2490  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.88 
 
 
240 aa  257  1e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0958  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.88 
 
 
240 aa  257  1e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00478408  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6680  ABC transporter related  54.51 
 
 
250 aa  257  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  50.2 
 
 
254 aa  257  1e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0878  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.88 
 
 
240 aa  257  1e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303797  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0833  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.88 
 
 
240 aa  257  1e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000142512  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3275  ABC transporter related  49.6 
 
 
259 aa  256  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24330  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  52.61 
 
 
273 aa  256  2e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0478381  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1598  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.07 
 
 
240 aa  256  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.842708  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0910  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51.63 
 
 
244 aa  256  3e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00137442  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1128  ABC transporter related  52.19 
 
 
242 aa  256  3e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.989355 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1493  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  53.25 
 
 
240 aa  255  4e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.228694  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1296  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.47 
 
 
240 aa  256  4e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.484197  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3766  ABC transporter related  50.79 
 
 
264 aa  255  5e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343031  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3697  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  54.25 
 
 
242 aa  255  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270266  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2098  ABC transporter ATP-binding protein  52.82 
 
 
254 aa  255  5e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0985  ABC transporter related protein  49.2 
 
 
259 aa  255  5e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.419565  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0749  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, ATP-binding protein  49.02 
 
 
282 aa  255  5e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000330465  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0761  ABC transporter related  51.22 
 
 
244 aa  255  6e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1775  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  53.66 
 
 
240 aa  255  6e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  normal  0.116362 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>