More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7509 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7509  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nopaline)  100 
 
 		 258 aa  529  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.732816  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3521  ABC transporter related  58.7 
 
 		 264 aa  298  8e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0361995  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3874  ABC transporter related  56.18 
 
 		 254 aa  289  3e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.863325  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4051  ABC transporter related protein  56.18 
 
 		 254 aa  288  8e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2077  ABC transporter related  52.82 
 
 		 275 aa  283  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68060  ABC transporter ATP-binding protein  54.98 
 
 		 257 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876897 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0312  ABC transporter-like  54.98 
 
 		 257 aa  281  6.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00525349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1112  ABC transporter related  55.78 
 
 		 255 aa  280  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0959547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5890  ABC transporter ATP-binding protein  54.58 
 
 		 257 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3307  ABC transporter related  55.06 
 
 		 256 aa  279  3e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2834  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  55.82 
 
 		 268 aa  279  4e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4269  ABC transporter related  54.58 
 
 		 257 aa  278  8e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.640229  hitchhiker  7.10033e-16 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5357  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.18 
 
 		 257 aa  276  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2250  ABC transporter component  53.78 
 
 		 258 aa  276  3e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5163  ABC transporter related  53.2 
 
 		 260 aa  275  4e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.605422  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0324  ABC transporter related  52.42 
 
 		 265 aa  275  4e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2649  ABC transporter related  53.63 
 
 		 260 aa  274  9e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.13027  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0294  ABC basic amino acid transporter, ATPase subunit  52.02 
 
 		 265 aa  274  9e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.311717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4911  ABC transporter  53.78 
 
 		 257 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0306  ABC transporter related  54.58 
 
 		 257 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0328197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0301  ABC transporter related  54.58 
 
 		 257 aa  271  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.492075  normal  0.0971272 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4927  ABC transporter related  54.58 
 
 		 257 aa  271  7e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000746315 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2781  ABC transporter related  54.66 
 
 		 256 aa  271  8.000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0283  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  54.58 
 
 		 257 aa  271  9e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.454003  hitchhiker  0.000143941 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6799  ABC transporter related  53.15 
 
 		 265 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.557054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2166  ABC transporter related  53.82 
 
 		 261 aa  268  4e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0000000402922  hitchhiker  0.000000271628 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4287  ABC transporter related  53.15 
 
 		 265 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0485739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1455  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.86 
 
 		 256 aa  267  1e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0011921  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1206  ABC transporter-like  54.44 
 
 		 254 aa  266  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4842  ABC transporter related  52.76 
 
 		 265 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.463147  normal  0.18459 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2127  ABC transporter related  54.1 
 
 		 264 aa  266  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003973  arginine/ornithine ABC transporter ATP-binding protein AotP  57.25 
 
 		 256 aa  265  7e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1957  arginine/ornithine periplasmic binding protein-dependent transporter, ATP-binding component  58.04 
 
 		 256 aa  265  7e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1789  ABC transporter related  52.59 
 
 		 263 aa  265  7e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1120  ABC transporter related  53.63 
 
 		 259 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4837  ABC transporter related  53.23 
 
 		 263 aa  264  8.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108273 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6912  ABC transporter related  53.25 
 
 		 258 aa  264  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4488  ABC transporter related  52.23 
 
 		 260 aa  264  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.05102  normal  0.0230352 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1773  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.19 
 
 		 264 aa  264  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1826  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  53.23 
 
 		 263 aa  264  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0436172  normal  0.140354 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0535  ABC transporter related  52.99 
 
 		 255 aa  264  1e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0338  ABC transporter related  50.99 
 
 		 285 aa  263  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.615822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4289  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  53.69 
 
 		 266 aa  263  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.960923 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1259  ABC transporter related  51.82 
 
 		 260 aa  263  2e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.913207  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0698  ABC transporter related  53.69 
 
 		 274 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.26151  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1177  ABC transporter related  53.69 
 
 		 274 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5919  ABC transporter related  53.25 
 
 		 258 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.163936 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0883  ABC transporter related  52.99 
 
 		 259 aa  262  4e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.741184 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1155  ABC transporter related  53.28 
 
 		 266 aa  262  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116846 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5734  ABC amino acid transporter, ATPase subunit  53.39 
 
 		 259 aa  262  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.791565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3393  ABC basic amino acid transporter, ATPase subunit  53.23 
 
 		 259 aa  262  4e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1556  ABC transporter related  51.79 
 
 		 263 aa  262  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2452  ABC transporter related  52.99 
 
 		 259 aa  262  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0182129  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2317  ABC transporter related  52.99 
 
 		 259 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431352  normal  0.687012 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01549  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  56.86 
 
 		 256 aa  261  6e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2862  putative arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein  52.42 
 
 		 264 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0589  arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52.42 
 
 		 264 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2851  histidine transport ATP-binding protein  52.42 
 
 		 264 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2429  putative arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein  52.42 
 
 		 264 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.795257  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1739  putative arginine/ornithine ABC transporter, ATP-binding protein  52.42 
 
 		 264 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209767  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1087  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  54.03 
 
 		 255 aa  261  8e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.251068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1245  histidine transport ATP-binding protein  54.03 
 
 		 255 aa  261  8e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.271507  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1092  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  54.03 
 
 		 255 aa  261  8e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195395  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2789  histidine ABC transporter, ATP-binding protein  52.19 
 
 		 264 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.782335  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1059  ABC transporter related  52.87 
 
 		 266 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1582  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.03 
 
 		 255 aa  260  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0189341  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0744  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.03 
 
 		 255 aa  260  1e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130821  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2730  ABC-type histidine transport system, ATPase component  52.19 
 
 		 264 aa  260  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3015  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.03 
 
 		 255 aa  260  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0526452  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7501  ABC transporter related  52.19 
 
 		 273 aa  260  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  50.2 
 
 		 242 aa  260  1e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1056  ABC transporter related  52.87 
 
 		 266 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185829  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0985  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.03 
 
 		 255 aa  260  1e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78834  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  51 
 
 		 241 aa  260  2e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  51 
 
 		 241 aa  259  2e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1795  ABC transporter related  53.39 
 
 		 259 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5748  ABC transporter related  54.03 
 
 		 263 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  51 
 
 		 241 aa  259  2e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2407  ABC transporter related  53.39 
 
 		 259 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0859619  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5012  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  57.03 
 
 		 259 aa  259  3e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0887  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  52.19 
 
 		 255 aa  259  4e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2437  ABC transporter related  50.4 
 
 		 243 aa  259  4e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2485  ABC transporter related  50.4 
 
 		 243 aa  259  4e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2349  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.2 
 
 		 245 aa  259  4e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.271296  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4634  ABC transporter related  51.18 
 
 		 263 aa  258  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2411  ABC transporter related  52.99 
 
 		 259 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00777429 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2003  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.83 
 
 		 243 aa  258  5.0000000000000005e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6594  ABC transporter related  53.63 
 
 		 263 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.147367 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6112  ABC transporter related  53.63 
 
 		 263 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2061  glutamine transport protein glnQ  50.2 
 
 		 245 aa  258  5.0000000000000005e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  50.6 
 
 		 241 aa  258  6e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4530  ABC transporter related  57.96 
 
 		 259 aa  258  8e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0252344  normal  0.11839 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5837  ABC transporter related  53.15 
 
 		 263 aa  258  9e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5620  ABC transporter related  53.15 
 
 		 263 aa  258  9e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33769  normal  0.48153 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4901  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.6 
 
 		 240 aa  257  1e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5103  ABC transporter related  53.63 
 
 		 263 aa  257  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0351754  hitchhiker  0.00435493 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.2 
 
 		 240 aa  256  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2558  ABC transporter related  54.66 
 
 		 260 aa  257  2e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411241  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  51 
 
 		 241 aa  256  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  51 
 
 		 241 aa  256  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>