More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2756 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2756  chromate transporter  100 
 
 		 199 aa  391  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3786  chromate transporter  64.84 
 
 		 196 aa  226  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.486555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4022  chromate transporter  62.78 
 
 		 203 aa  225  4e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100233 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2215  Chromate transporter  62.64 
 
 		 196 aa  220  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2308  chromate transporter  64.09 
 
 		 191 aa  215  2.9999999999999998e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2259  chromate transporter  61.41 
 
 		 202 aa  212  2.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.793655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1615  Chromate transporter  61.33 
 
 		 202 aa  209  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3014  chromate transporter  60.43 
 
 		 198 aa  202  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642179 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3026  chromate transporter  61.38 
 
 		 201 aa  192  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2204  CHR transporter  58.14 
 
 		 196 aa  192  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0435  Chromate transporter  55.36 
 
 		 209 aa  185  5e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0072  chromate transporter  61.88 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6104  putative chromate transport protein  43.33 
 
 		 198 aa  130  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0480  chromate transporter  38.86 
 
 		 178 aa  123  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.461938  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3386  chromate transporter  39.27 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2355  chromate transporter  40.31 
 
 		 185 aa  118  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4012  Chromate transporter  40 
 
 		 198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2518  chromate transporter  40.98 
 
 		 193 aa  115  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.266281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0903  Chromate transporter  40.56 
 
 		 192 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0253551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0832  Chromate transporter  40 
 
 		 192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.974224 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1522  chromate transporter  40.22 
 
 		 188 aa  107  8.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.189226  normal  0.0899131 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0979  hypothetical protein  42.05 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0282  chromate transporter  40.83 
 
 		 199 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0294  chromate transporter  40.83 
 
 		 199 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3340  chromate transporter  40.24 
 
 		 199 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4416  chromate transporter  35.11 
 
 		 202 aa  102  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.925487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2085  chromate transport protein  40.24 
 
 		 199 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.581224  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3008  chromate transport protein ChrA  40.24 
 
 		 199 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0254  chromate transport protein, putative  38.46 
 
 		 199 aa  101  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.744133  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0479  chromate transporter  41.36 
 
 		 185 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2453  chromate transporter  35.9 
 
 		 202 aa  98.2  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3609  chromate transporter  37.42 
 
 		 185 aa  97.1  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3056  chromate transporter  37.93 
 
 		 204 aa  96.3  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2921  chromate transporter  37.93 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.501142 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6357  chromate transporter  37.58 
 
 		 212 aa  95.9  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.37637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1914  chromate transporter  48.62 
 
 		 361 aa  95.1  5e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6791  Chromate transporter  34.57 
 
 		 189 aa  95.1  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0341176  hitchhiker  0.00000131878 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3006  chromate transporter  38.51 
 
 		 208 aa  94.4  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3737  Chromate transporter  33.16 
 
 		 197 aa  94  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6229  Chromate transporter  36.17 
 
 		 214 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4042  chromate transporter  34.83 
 
 		 203 aa  92.4  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.522407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2836  chromate transporter  34.83 
 
 		 189 aa  92.4  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2397  chromate transporter  41.12 
 
 		 226 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3011  chromate transporter  41.12 
 
 		 226 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3030  chromate transporter  41.75 
 
 		 226 aa  89.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0902  chromate transporter  34.3 
 
 		 203 aa  88.6  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.913951 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4177  chromate transporter  32.34 
 
 		 208 aa  88.6  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2051  chromate efflux pump  35.96 
 
 		 190 aa  88.6  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159095  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0461  chromate transporter  34.3 
 
 		 203 aa  88.2  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0940  chromate transporter  34.3 
 
 		 203 aa  88.2  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0532  Chromate transporter  41.4 
 
 		 195 aa  85.9  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4886  chromate transporter  30.65 
 
 		 456 aa  85.5  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2327  chromate transporter  38.1 
 
 		 215 aa  85.1  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.89025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0381  chromate transport protein  33.55 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2220  Chromate transporter  35.51 
 
 		 190 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2503  chromate transporter  32.96 
 
 		 399 aa  80.1  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2509  chromate transport protein  27.11 
 
 		 183 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2215  chromate transport protein  27.11 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.356625  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3481  Chromate transporter  39.04 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00575906  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1744  chromate transport protein  30.06 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  32.1 
 
 		 383 aa  76.3  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0956  chromate transporter  41.88 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.99 
 
 		 382 aa  72.4  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1163  Chromate transporter  27.03 
 
 		 193 aa  72  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1521  chromate transporter  30.34 
 
 		 401 aa  71.6  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.97 
 
 		 392 aa  71.6  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6202  chromate transporter  32 
 
 		 401 aa  71.2  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  28.98 
 
 		 396 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1495  chromate transport protein  28.98 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2622  chromate transporter  32.75 
 
 		 393 aa  70.5  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1212  chromate transport protein  28.98 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  29.74 
 
 		 392 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  28.98 
 
 		 396 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  28.98 
 
 		 396 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1803  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.48 
 
 		 400 aa  69.7  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1226  chromate transporter  33.54 
 
 		 418 aa  69.7  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0166  chromate transporter  27.11 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  30.99 
 
 		 385 aa  68.6  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3191  chromate transporter  29.94 
 
 		 483 aa  68.6  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2144  chromate transporter  26.37 
 
 		 447 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  29.23 
 
 		 392 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4100  chromate transporter  31.01 
 
 		 454 aa  68.2  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.343432 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1337  chromate transporter  34.71 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00776864  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04090  Chromate transporter  29.38 
 
 		 174 aa  67.8  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2361  chromate transporter  25.54 
 
 		 179 aa  67.8  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3574  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.67 
 
 		 390 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.78 
 
 		 395 aa  67  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  28.57 
 
 		 394 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1206  chromate transporter  30.77 
 
 		 398 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3865  chromate transporter  26.63 
 
 		 390 aa  66.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2674  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.57 
 
 		 441 aa  65.9  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  28 
 
 		 396 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2143  Chromate transporter  27.22 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000134101  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3251  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.12 
 
 		 390 aa  65.5  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  29.23 
 
 		 420 aa  65.1  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1891  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.24 
 
 		 469 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.861826 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04080  Chromate transporter  25.27 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2688  chromate transporter  32.28 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  28.93 
 
 		 416 aa  63.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.03 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.694049 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>