169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2412 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2412  anion transporter  100 
 
 		 481 aa  936    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.570521  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3912  anion transporter  47.55 
 
 		 483 aa  424  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00580  citrate:succinate antiporter  44.83 
 
 		 487 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3013  anion transporter  44.83 
 
 		 487 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0421609  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3032  anion transporter  44.83 
 
 		 487 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00569  hypothetical protein  44.83 
 
 		 487 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0663  sodium:sulfate symporter family protein  44.83 
 
 		 487 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0634  citrate transporter  44.83 
 
 		 487 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0731  sodium:sulfate symporter family protein  45.04 
 
 		 487 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0672  sodium:sulfate symporter family protein  45.04 
 
 		 487 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0777  sodium:sulfate symporter family protein  45.45 
 
 		 487 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.406229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0658  sodium:sulfate symporter family protein  45.04 
 
 		 487 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0700  sodium:sulfate symporter family protein  44.49 
 
 		 476 aa  411  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0631  sodium:sulfate symporter family protein  44.49 
 
 		 476 aa  409  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2559  anion transporter  46.27 
 
 		 502 aa  408  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.133462  normal  0.0525533 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1274  anion transporter  46.67 
 
 		 469 aa  397  1e-109  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3165  anion transporter  43.53 
 
 		 487 aa  393  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4375  anion transporter  42.8 
 
 		 487 aa  375  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00267264  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02933  predicted tartrate:succinate antiporter  42.59 
 
 		 487 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00145949  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0637  anion transporter  42.8 
 
 		 487 aa  375  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000275084  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0636  anion transporter  42.8 
 
 		 487 aa  375  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000570216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02883  hypothetical protein  42.59 
 
 		 487 aa  372  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00124392  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3243  anion transporter  42.59 
 
 		 487 aa  374  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3527  anion transporter  42.59 
 
 		 487 aa  374  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412852  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3356  anion transporter  42.59 
 
 		 487 aa  374  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000525621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1726  anion transporter  45.67 
 
 		 506 aa  364  2e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.980484 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1490  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  37.04 
 
 		 466 aa  296  4e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26970  anion transporter  36.02 
 
 		 517 aa  291  1e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0104  anion transporter  36.54 
 
 		 476 aa  283  6.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2328  anion transporter family protein  36.56 
 
 		 472 aa  281  1e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0370  anion transporter  37.69 
 
 		 484 aa  281  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2718  anion transporter  36.77 
 
 		 472 aa  281  2e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2775  anion transporter  36.77 
 
 		 472 aa  281  2e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2302  anion transporter  34.77 
 
 		 488 aa  280  4e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0347  anion transporter  36.06 
 
 		 467 aa  277  3e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3771  anion transporter  37.85 
 
 		 484 aa  273  3e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3949  anion transporter  37.77 
 
 		 484 aa  274  3e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0733465  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1529  anion transporter  35.34 
 
 		 473 aa  266  7e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00336443  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0938  anion transporter  34.31 
 
 		 492 aa  265  1e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.842448 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3900  Sodium/sulphate symporter  33.7 
 
 		 501 aa  261  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0686  anion transporter  36.01 
 
 		 478 aa  258  2e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0015  anion transporter  33.33 
 
 		 475 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00186698  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0741  anion transporter  34.82 
 
 		 490 aa  254  3e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1092  anion transporter  33.55 
 
 		 501 aa  251  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00162595 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4303  anion transporter  33.55 
 
 		 501 aa  251  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.971581  decreased coverage  0.00704571 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1050  anion transporter  33.77 
 
 		 501 aa  249  6e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2766  anion transporter  34.27 
 
 		 490 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.133589 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3266  anion transporter  33.85 
 
 		 494 aa  248  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101969  normal  0.0632125 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0506  di- and tricarboxylate transporter  33.69 
 
 		 479 aa  247  3e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4103  anion transporter  32.74 
 
 		 470 aa  245  9.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0923  anion transporter  32.44 
 
 		 489 aa  243  7.999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0092  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  35.39 
 
 		 475 aa  242  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0091  divalent anion:Na+ symporter family protein  35.39 
 
 		 475 aa  242  1e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4122  anion transporter  35.03 
 
 		 475 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1482  anion transporter  34.14 
 
 		 473 aa  237  4e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.168166  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28272  DASS family transporter: 2-oxoglutarate/malate  34.45 
 
 		 527 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.133761  normal  0.927166 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1465  anion transporter  32.75 
 
 		 490 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0043  anion transporter  32.21 
 
 		 470 aa  233  5e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0037  anion transporter  32.21 
 
 		 470 aa  232  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2872  anion transporter  31.78 
 
 		 477 aa  223  7e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.675436  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2892  anion transporter  31.78 
 
 		 477 aa  223  7e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.151263 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0824  anion transporter  31.78 
 
 		 477 aa  223  7e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.595752  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0793  anion transporter  32.35 
 
 		 477 aa  222  9e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0874  anion transporter  31.78 
 
 		 477 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0797  anion transporter  31.78 
 
 		 477 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0516558  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49439  DASS family transporter: 2-oxoglutarate/malate  36.2 
 
 		 414 aa  218  2e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.315345  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2725  anion transporter  33.33 
 
 		 469 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0162733 
 
 
-
 
NC_002620  TC0476  sodium:sulfate symporter family protein  31.44 
 
 		 471 aa  212  1e-53  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37045  DASS family transporter: 2-oxoglutarate/malate  29.71 
 
 		 495 aa  181  2e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.011137  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1564  anion transporter  25.74 
 
 		 493 aa  105  1e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.43197  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2238  anion transporter  25.64 
 
 		 510 aa  98.6  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.864259  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2748  anion transporter  25.17 
 
 		 478 aa  92.4  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07320  anion transporter  27.4 
 
 		 526 aa  87.8  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.039375  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1953  anion transporter  26.9 
 
 		 489 aa  87  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312845  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0560  anion transporter  25.21 
 
 		 507 aa  86.7  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0348  anion transporter family protein  25 
 
 		 518 aa  85.5  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1663  permease  21.61 
 
 		 489 aa  84  0.000000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0326  transmembrane transport proteins-like  24.05 
 
 		 491 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.677741  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0150  anion transporter  24.74 
 
 		 531 aa  82  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0085  anion transporter  49.38 
 
 		 111 aa  81.3  0.00000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8313  anion transporter  24.62 
 
 		 491 aa  80.9  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572418  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0346  sodium-dependent transporter  25.97 
 
 		 552 aa  80.1  0.00000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000913851  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0714  anion transporter  23.96 
 
 		 517 aa  79  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0730  anion transporter  23.96 
 
 		 517 aa  79  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.597447  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0787  sodium/sulphate symporter  23.57 
 
 		 491 aa  78.2  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0341  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  23.85 
 
 		 514 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0364285  hitchhiker  0.00160481 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0893  anion transporter  24.42 
 
 		 536 aa  76.3  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35420  Sodium/sulphate symporter-like protein  26.59 
 
 		 451 aa  75.9  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2627  anion transporter  26.6 
 
 		 607 aa  74.3  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4511  anion transporter  25 
 
 		 516 aa  73.9  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0794  sodium/sulphate symporter  25.85 
 
 		 490 aa  72  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000496756  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0281  anion transporter  26.23 
 
 		 505 aa  71.6  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1988  anion transporter  25.63 
 
 		 482 aa  71.6  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.241159  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2049  sodium/sulphate symporter  25.82 
 
 		 485 aa  71.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000525782  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  22.47 
 
 		 459 aa  70.5  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16290  anion transporter  24.89 
 
 		 566 aa  68.9  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0383  anion transporter  23.83 
 
 		 470 aa  67.4  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1991  anion transporter  21.6 
 
 		 483 aa  65.9  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000356301  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0235  anion transporter  23.83 
 
 		 446 aa  65.9  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000069628  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3246  anion transporter  24.68 
 
 		 506 aa  65.9  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961342 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>