127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3315 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3315  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  100 
 
 		 200 aa  411  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2441  putative recombinase, transposition resolvase, TnpR  70.85 
 
 		 199 aa  283  9e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.273719 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5372  Resolvase domain  40.1 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.925185 
 
 
-
 
NC_011889  Mnod_7752  Resolvase domain protein  39.5 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6448  Resolvase domain protein  38 
 
 		 211 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0279  recombinase  36.27 
 
 		 248 aa  104  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000482548  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  33.68 
 
 		 189 aa  80.5  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003898  resolvase putative  31.28 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4794  resolvase domain-containing protein  35.54 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  33.16 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  34.2 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  31.25 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4663  resolvase domain-containing protein  32.81 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.94015  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  32.12 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  30.15 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  31.12 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  31.12 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  31.12 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  32.31 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4223  resolvase domain-containing protein  32.29 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3170  resolvase domain-containing protein  30.1 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430122 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  31.61 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  31.61 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2427  resolvase domain-containing protein  30.73 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0929457  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3928  resolvase domain-containing protein  29.8 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.272515  hitchhiker  0.0000753359 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  31.61 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  29.84 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2003  transposon Tn2501 resolvase  31.25 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00181715  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  32.47 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  32.47 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  31.94 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  29.74 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.335597 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01345  predicted site-specific recombinase  31.94 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01504  predicted site-specific recombinase  31.94 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2272  Resolvase domain protein  31.94 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  28.57 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01357  hypothetical protein  31.94 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  30.73 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  30 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  30 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  30 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  28.21 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  30.26 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  30 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2113  resolvase domain-containing protein  31.94 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01515  hypothetical protein  31.94 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.088804  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  30.57 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2322  resolvase domain-containing protein  32.59 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  30.41 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  30.41 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  30.41 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  32.59 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  32.59 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1635  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  31.94 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00540929  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  31.85 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1125  resolvase domain-containing protein  30.77 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.577602  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2132  resolvase domain-containing protein  30.73 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0356691 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3590  resolvase domain protein  27.92 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000308956 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3464  resolvase domain-containing protein  29.33 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2100  Resolvase domain protein  31.41 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000956779  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4266  resolvase domain-containing protein  33.01 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120246  unclonable  5.20349e-19 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0123  putative resolvase  26.67 
 
 		 206 aa  53.9  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.922970000000001e-26 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  30 
 
 		 192 aa  53.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3355  resolvase domain-containing protein  33.76 
 
 		 301 aa  53.5  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0978291  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5336  transposon Tn21 resolvase  32.58 
 
 		 129 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  26.56 
 
 		 188 aa  52.8  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  29.23 
 
 		 186 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1325  resolvase domain-containing protein  28.64 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  29.23 
 
 		 186 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4598  Resolvase domain protein  30.46 
 
 		 188 aa  52.4  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2949  Resolvase domain  24.38 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.587528  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01413  resolvase, putative  29.41 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  28.28 
 
 		 192 aa  51.6  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_03  resolvase  26.67 
 
 		 209 aa  51.6  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0166  Resolvase domain protein  29.23 
 
 		 188 aa  51.6  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  30.57 
 
 		 183 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2319  resolvase, putative  31.88 
 
 		 137 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000512602  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4140  Resolvase domain protein  31.43 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00204948  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  29.21 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2559  resolvase-like protein  28.9 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0037  resolvase  33.52 
 
 		 245 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.489197  normal  0.472165 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0438  putative resolvase  27.37 
 
 		 318 aa  49.7  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6519  resolvase  30.97 
 
 		 283 aa  48.9  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D08  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  28.35 
 
 		 193 aa  48.9  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.942713  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  31.63 
 
 		 194 aa  48.9  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_44  putative resolvase  27.22 
 
 		 211 aa  48.9  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0377389  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0298  resolvase, putative  30.05 
 
 		 205 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0054  resolvase domain-containing protein  29.48 
 
 		 213 aa  48.1  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0687  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  26.73 
 
 		 200 aa  48.1  0.00009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.731539  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25710  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  31.72 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  27.04 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2767  resolvase domain-containing protein  21.69 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0094  resolvase  32.42 
 
 		 245 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.86084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2264  resolvase-like protein  30.86 
 
 		 183 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0723164  hitchhiker  0.00531394 
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0065  DNA recombinase  28.48 
 
 		 203 aa  45.4  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  29.21 
 
 		 203 aa  45.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04811  DNA invertase  20.96 
 
 		 209 aa  45.4  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 183 aa  45.4  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1397  Resolvase domain protein  29.63 
 
 		 209 aa  45.1  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.954133  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  29.74 
 
 		 194 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>