158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04811 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_04811  DNA invertase  100 
 
 		 209 aa  434  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001082  putative resolvase  74.3 
 
 		 214 aa  333  9e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2767  resolvase domain-containing protein  66.18 
 
 		 214 aa  268  4e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011889  Mnod_7752  Resolvase domain protein  27.04 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5372  Resolvase domain  27.04 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.925185 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  26.71 
 
 		 192 aa  64.7  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  26.06 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  26.35 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  26.35 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003898  resolvase putative  27.08 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0438  putative resolvase  28.57 
 
 		 318 aa  58.9  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  25.52 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  23.83 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6448  Resolvase domain protein  24.84 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0279  recombinase  31.73 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000482548  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4228  resolvase family site-specific recombinase  23.28 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.623835  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  24.62 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  24.62 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  27.23 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  24.32 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D08  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  24.75 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.942713  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  27.85 
 
 		 188 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  23.4 
 
 		 185 aa  53.1  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D15  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  26.09 
 
 		 184 aa  52.4  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04260  hypothetical protein  26.29 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  26.63 
 
 		 190 aa  52.4  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  25.81 
 
 		 188 aa  51.6  0.000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  23.2 
 
 		 193 aa  51.6  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  31.2 
 
 		 201 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A23  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  26.18 
 
 		 187 aa  50.8  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  30.43 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  25 
 
 		 189 aa  51.2  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  25.32 
 
 		 185 aa  51.2  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1579  transposon Tn3 resolvase  23.81 
 
 		 185 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.159821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0216  transposon resolvase  24.44 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.159168 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  25.81 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  26.09 
 
 		 183 aa  50.4  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  25.64 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0246  resolvase domain-containing protein  23.5 
 
 		 179 aa  49.7  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  21.61 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  26.67 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4663  resolvase domain-containing protein  26.29 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.94015  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  28.26 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  24.08 
 
 		 189 aa  49.3  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4244  resolvase  26.52 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  26.67 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  25.79 
 
 		 185 aa  48.9  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002227  resolvase  29.51 
 
 		 128 aa  49.3  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0219  DNA-invertase hin  24.44 
 
 		 184 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0242276 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  25.79 
 
 		 185 aa  48.9  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1093  Resolvase domain  28.26 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.531001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0204  transposon resolvase  24.86 
 
 		 191 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000159954 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  25.17 
 
 		 194 aa  48.9  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  29.35 
 
 		 185 aa  48.5  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5298  DNA-invertase hin  25.68 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0073  resolvase  23.33 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2427  resolvase domain-containing protein  22.61 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0929457  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4319  resolvase-like protein  24.6 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4128  Resolvase domain protein  23.08 
 
 		 231 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1125  resolvase domain-containing protein  26.32 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.577602  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4382  resolvase domain-containing protein  25.64 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3992  resolvase domain-containing protein  27.74 
 
 		 195 aa  48.1  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378658  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2179  resolvase domain-containing protein  24.84 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0190993  hitchhiker  0.0022624 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2946  resolvase domain-containing protein  24.84 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0986415  normal  0.227448 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  25 
 
 		 184 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  23.94 
 
 		 190 aa  47.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4343  Resolvase domain protein  23.56 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000112202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  24.19 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  22.29 
 
 		 190 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  23.38 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4408  resolvase domain-containing protein  23.56 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000545957  normal  0.0701498 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4666  resolvase domain-containing protein  23.56 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000148612  normal  0.936039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  31.82 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  25.32 
 
 		 176 aa  46.2  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  25.51 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0206  transposon resolvase  25.16 
 
 		 169 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000314886 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  23.66 
 
 		 187 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28731  hypothetical protein  23.46 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1811  Resolvase domain protein  24.84 
 
 		 183 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0297206  hitchhiker  0.00833685 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  23.87 
 
 		 203 aa  46.2  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0222  transposon resolvase  23.33 
 
 		 199 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000952158 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  22.83 
 
 		 203 aa  46.2  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3315  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  20.96 
 
 		 200 aa  45.4  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  26.88 
 
 		 189 aa  45.8  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  28.57 
 
 		 193 aa  45.8  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  22.16 
 
 		 194 aa  45.4  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  25.81 
 
 		 184 aa  45.4  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  30.11 
 
 		 195 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4488  DNA-invertase  31.94 
 
 		 187 aa  45.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.258493  normal  0.0155508 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17071  site-specific recombinase  24.82 
 
 		 207 aa  45.1  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  30.28 
 
 		 197 aa  44.7  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  24.53 
 
 		 185 aa  45.1  0.0009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0557  resolvase-like protein  27.17 
 
 		 128 aa  45.1  0.0009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.158765  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1104  Resolvase domain  25.67 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0011  resolvase, putative  23.78 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  22.03 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6388  resolvase domain-containing protein  24.83 
 
 		 191 aa  44.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  28.26 
 
 		 198 aa  44.7  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  23.98 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  22.95 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>