72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2767 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2767  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 214 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04811  DNA invertase  66.18 
 
 		 209 aa  285  2.9999999999999996e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001082  putative resolvase  62.74 
 
 		 214 aa  282  3.0000000000000004e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0438  putative resolvase  27.84 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  26.56 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  26.56 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  27.17 
 
 		 195 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  25.68 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  25.26 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003898  resolvase putative  26.63 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  23.6 
 
 		 192 aa  52.4  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0557  resolvase-like protein  32.22 
 
 		 128 aa  52  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.158765  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5372  Resolvase domain  23.88 
 
 		 210 aa  52  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.925185 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0279  recombinase  25.62 
 
 		 248 aa  52  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000482548  n/a   
 
 
-
 
NC_011889  Mnod_7752  Resolvase domain protein  23.98 
 
 		 214 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3315  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  21.69 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  24.08 
 
 		 189 aa  51.2  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4663  resolvase domain-containing protein  26.4 
 
 		 197 aa  48.9  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.94015  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D08  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  23.86 
 
 		 193 aa  48.9  0.00006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.942713  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  26.63 
 
 		 194 aa  48.9  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  23.76 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  24.86 
 
 		 189 aa  47.8  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  28.44 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4794  resolvase domain-containing protein  26.84 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6448  Resolvase domain protein  23.23 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  24.38 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  25.81 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  23.76 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  25.14 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3662  Resolvase domain protein  26.87 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  22.75 
 
 		 197 aa  45.4  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  22.75 
 
 		 197 aa  45.4  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  23.2 
 
 		 197 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  25.27 
 
 		 191 aa  45.1  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5298  DNA-invertase hin  24.61 
 
 		 186 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002227  resolvase  30.19 
 
 		 128 aa  44.3  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  23.4 
 
 		 188 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  26.67 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  26.67 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  26.85 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  22.87 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01515  hypothetical protein  24.64 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.088804  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  24.14 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  24.14 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  25.93 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  25.97 
 
 		 212 aa  44.3  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  25.32 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2441  putative recombinase, transposition resolvase, TnpR  22.06 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.273719 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  22.87 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2272  Resolvase domain protein  24.64 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2100  Resolvase domain protein  24.64 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000956779  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  24.64 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01504  predicted site-specific recombinase  24.64 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133152  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2113  resolvase domain-containing protein  24.64 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  22.95 
 
 		 186 aa  43.1  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20410  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  22.46 
 
 		 194 aa  43.1  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0661103 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1852  Resolvase domain  25 
 
 		 197 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.064893  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1477  Resolvase domain  25 
 
 		 197 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79192  unclonable  0.0000000000000150315 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4479  Resolvase domain protein  25 
 
 		 197 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000147912 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01345  predicted site-specific recombinase  26.16 
 
 		 196 aa  42.7  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01357  hypothetical protein  26.16 
 
 		 196 aa  42.7  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  23.13 
 
 		 197 aa  42.7  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  23.16 
 
 		 203 aa  42.4  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  22.22 
 
 		 201 aa  42  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29040  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  25.74 
 
 		 197 aa  42  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.436309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5339  DNA-invertase  25.99 
 
 		 192 aa  42  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0011  resolvase, putative  24.6 
 
 		 181 aa  42  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6376  resolvase domain-containing protein  24.74 
 
 		 206 aa  42  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  29.91 
 
 		 201 aa  42  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D15  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  22.36 
 
 		 184 aa  41.6  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  22.65 
 
 		 205 aa  41.6  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1635  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  24.15 
 
 		 196 aa  41.2  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00540929  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>