More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1583 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1583  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  100 
 
 		 323 aa  649    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3588  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 301 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0801  LysR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 309 aa  191  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0257  LysR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 331 aa  188  9e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1092  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  37.04 
 
 		 300 aa  186  7e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0737  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 302 aa  185  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210121 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0979  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 301 aa  183  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025121 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4718  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.7 
 
 		 300 aa  182  9.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0163  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 432 aa  182  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224126 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5350  transcriptional regulator, LysR family  37.63 
 
 		 304 aa  180  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6400  LysR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 306 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.245407 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2490  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 318 aa  178  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6228  LysR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 345 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6630  LysR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 320 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6397  LysR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 320 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5507  transcriptional regulator, LysR family  37.01 
 
 		 301 aa  176  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.242052  normal  0.462948 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4032  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 314 aa  177  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522955  normal  0.224362 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3900  LysR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 305 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5891  LysR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 306 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.384931  normal  0.980568 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5527  LysR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 306 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3620  LysR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 305 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00938056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2495  LysR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 306 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0352  transcriptional regulator, LysR family  33 
 
 		 299 aa  175  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4455  LysR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 307 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0791  transcriptional regulator, LysR family  37.59 
 
 		 318 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3088  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 301 aa  170  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2696  LysR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 310 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.600213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6019  LysR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 303 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176233  normal  0.34418 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3713  LysR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 320 aa  170  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2997  LysR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 299 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00848262 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4622  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 314 aa  169  5e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1550  LysR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 333 aa  169  7e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.135746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5356  LysR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 306 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2667  LysR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 301 aa  168  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6126  LysR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.936354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4499  LysR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 314 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4041  LysR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 314 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1230  LysR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0044  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 307 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6242  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 301 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2155  transcriptional regulator, LysR family  36.72 
 
 		 316 aa  166  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3526  LysR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 306 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0893193 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6527  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 306 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4311  transcriptional regulator, LysR family  34.67 
 
 		 309 aa  165  8e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal  0.967846 
 
 
-
 
NC_003296  RS01757  transcription regulator transcription regulator protein  34.44 
 
 		 321 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.354836 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1198  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.601339  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0044  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1550  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1481  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2106  LysR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0052  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0054  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0642  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 309 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915851  normal  0.108834 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2535  transcriptional regulator, LysR family  35.84 
 
 		 307 aa  163  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.799798 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0065  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 307 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.363781  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01658  transcriptional regulator transcription regulator protein  34.46 
 
 		 308 aa  162  6e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01325  transcriptional regulator, LysR family protein  33.02 
 
 		 314 aa  162  6e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0328  LysR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 306 aa  161  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2243  transcription regulator protein  34.62 
 
 		 326 aa  160  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.145641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6276  LysR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 317 aa  159  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0594796  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5073  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 306 aa  159  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.255466 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2206  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 300 aa  159  6e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2111  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 297 aa  159  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3131  LysR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3445  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 322 aa  156  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000626744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3209  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 312 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.487782 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2055  transcriptional regulator, LysR family  34.04 
 
 		 325 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4479  LysR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 308 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5744  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 308 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.205378 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5115  LysR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 308 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337357  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3138  transcriptional regulator, LysR family protein  30.26 
 
 		 316 aa  155  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27318  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1942  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000680141 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4664  transcriptional regulator, LysR family  32.45 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0610677 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4532  transcriptional regulator, LysR family  32.45 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4643  LysR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 315 aa  154  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4889  LysR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 309 aa  153  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3385  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 316 aa  153  5e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.521059  normal  0.192926 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2448  transcriptional regulator, LysR family  33.92 
 
 		 325 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1231  LysR family transcriptional regulator  32.01 
 
 		 315 aa  152  7e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.864061  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2352  transcriptional regulator, LysR family protein  30.13 
 
 		 314 aa  152  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000117377  decreased coverage  0.00000015924 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1767  LysR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 336 aa  150  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.406374  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05202  transcription regulator protein  32.79 
 
 		 304 aa  149  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000103081  normal  0.0105317 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2311  LysR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 316 aa  149  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00615396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3796  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.71 
 
 		 299 aa  149  7e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027848 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2635  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 297 aa  149  7e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0969  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 313 aa  149  7e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.233069  normal  0.0392284 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4508  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 306 aa  149  8e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.872153  normal  0.61755 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4016  transcriptional regulator, LysR family  33.94 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.393902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3902  transcriptional regulator, LysR family  33.94 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.981327 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2459  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.57263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6114  transcriptional regulator, LysR family  32.11 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.689302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1003  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1859  LysR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0738691 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1626  LysR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 329 aa  147  3e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.11884 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4339  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.33 
 
 		 330 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2073  transcriptional regulator, LysR family protein  33.67 
 
 		 303 aa  147  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2042  LysR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 314 aa  146  5e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.557762  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1214  LysR family transcriptional regulator  32.01 
 
 		 314 aa  146  6e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.134847  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1192  LysR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 297 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0904  LysR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 297 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>