More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1547 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1547  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  100 
 
 		 526 aa  1063    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1417  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  66.48 
 
 		 528 aa  644    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2126  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.25 
 
 		 546 aa  546  1e-154  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0597043  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8762  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.78 
 
 		 510 aa  498  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3306  AMP-dependent synthetase and ligase  52.52 
 
 		 511 aa  499  1e-140  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000435597 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  50.38 
 
 		 512 aa  484  1e-135  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  51.53 
 
 		 524 aa  477  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5079  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.81 
 
 		 506 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4694  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.81 
 
 		 506 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.107104  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4780  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.81 
 
 		 506 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5286  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.73 
 
 		 523 aa  462  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.680641  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1480  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50 
 
 		 512 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0384  AMP-dependent synthetase and ligase  47.1 
 
 		 522 aa  457  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.766945 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4311  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50 
 
 		 477 aa  444  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.569405 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2360  AMP-dependent synthetase and ligase  47.95 
 
 		 552 aa  441  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0362234 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3655  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.94 
 
 		 483 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.334351  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3728  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.94 
 
 		 483 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.38736 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2660  AMP-dependent synthetase and ligase  48.55 
 
 		 510 aa  437  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.161262 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2861  AMP-dependent synthetase and ligase  48.65 
 
 		 508 aa  437  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.213595 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3996  AMP-dependent synthetase and ligase  46.17 
 
 		 523 aa  437  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.414143  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3668  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.65 
 
 		 483 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188298  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0310  AMP-dependent synthetase and ligase  46.3 
 
 		 533 aa  430  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.280778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4133  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.6 
 
 		 490 aa  431  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.731956  normal  0.7945 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3836  AMP-dependent synthetase and ligase  45.96 
 
 		 510 aa  419  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2525  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47 
 
 		 478 aa  421  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.539052 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13594  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.85 
 
 		 507 aa  422  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0112349  normal  0.250187 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2768  AMP-dependent synthetase and ligase  47.06 
 
 		 489 aa  414  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.997978  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2105  AMP-dependent synthetase and ligase  43.28 
 
 		 545 aa  395  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2101  AMP-dependent synthetase and ligase  42.62 
 
 		 543 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  36.87 
 
 		 544 aa  353  5e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  39.5 
 
 		 562 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2311  acyl-CoA synthetase  38.84 
 
 		 557 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462118  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  36.52 
 
 		 552 aa  344  2e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2941  acyl-CoA synthetase  38.65 
 
 		 557 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581775  normal  0.0544542 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2679  AMP-binding domain protein  39.18 
 
 		 561 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  36.31 
 
 		 549 aa  343  5e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  35.74 
 
 		 553 aa  342  7e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  36.31 
 
 		 549 aa  341  2e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  37.52 
 
 		 557 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  38.37 
 
 		 544 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31470  AMP-binding domain protein  37.52 
 
 		 564 aa  334  3e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0028776  hitchhiker  0.0000000416298 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  36.21 
 
 		 552 aa  333  4e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1778  AMP-binding domain protein  38.31 
 
 		 560 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198659 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3661  AMP-binding domain protein  38.24 
 
 		 560 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000288335 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  35.08 
 
 		 843 aa  331  2e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4063  AMP-binding domain protein  38.51 
 
 		 560 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  normal  0.0336017 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  35.96 
 
 		 560 aa  330  4e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4872  AMP-binding domain protein  38.4 
 
 		 549 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  39.12 
 
 		 630 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  34.85 
 
 		 549 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3655  AMP-binding domain protein  35.71 
 
 		 565 aa  327  5e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1813  AMP-binding domain protein  37.55 
 
 		 560 aa  326  6e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.258259 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  34.01 
 
 		 554 aa  324  2e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  35.07 
 
 		 552 aa  324  2e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0807  AMP-dependent synthetase and ligase  38.93 
 
 		 551 aa  323  4e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472076  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  34.44 
 
 		 566 aa  323  6e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1121  AMP-binding domain protein  35.75 
 
 		 548 aa  320  3.9999999999999996e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.131488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  34.5 
 
 		 576 aa  318  1e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  38.46 
 
 		 550 aa  318  1e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0870  AMP-binding domain protein  35.33 
 
 		 548 aa  318  1e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1667  AMP-binding domain protein  36.21 
 
 		 549 aa  316  5e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.327549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5134  AMP-binding domain protein  36.58 
 
 		 518 aa  316  6e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0657606  normal  0.735688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4878  AMP-dependent synthetase and ligase  36.97 
 
 		 530 aa  316  8e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0148671 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1627  AMP-dependent synthetase and ligase  35.19 
 
 		 571 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  34.77 
 
 		 550 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3937  AMP-binding domain protein  37.19 
 
 		 539 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104158  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  34.2 
 
 		 566 aa  313  3.9999999999999997e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404945  normal  0.888891 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  37.27 
 
 		 538 aa  312  9e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.74 
 
 		 513 aa  309  6.999999999999999e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1818  AMP-dependent synthetase and ligase  35.32 
 
 		 563 aa  309  8e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  normal  0.361334 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3009  AMP-binding domain protein  36.08 
 
 		 546 aa  309  9e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0344  AMP-binding domain protein  36.28 
 
 		 562 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2361  AMP-dependent synthetase and ligase  37.64 
 
 		 550 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.727031  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  37.09 
 
 		 1043 aa  307  3e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2593  AMP-binding domain protein  33.58 
 
 		 574 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2693  AMP-dependent synthetase and ligase  33.21 
 
 		 562 aa  306  7e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17150  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  32.9 
 
 		 828 aa  306  8.000000000000001e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.488876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  36.38 
 
 		 538 aa  306  8.000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3108  AMP-binding domain protein  35.51 
 
 		 546 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2285  AMP-binding domain protein  33.83 
 
 		 570 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0389499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2357  AMP-binding domain protein  33.89 
 
 		 570 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0641132  normal  0.0814981 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0404  hypothetical protein  35.94 
 
 		 605 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.737872  normal  0.0168695 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2475  AMP-binding domain protein  34.07 
 
 		 574 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0776889  normal  0.707205 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01449  AMP-binding domain protein  33.71 
 
 		 579 aa  304  3.0000000000000004e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.300352  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2319  AMP-binding domain protein  37.98 
 
 		 565 aa  303  6.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.770298  normal  0.0254377 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1693  AMP-binding domain protein  35.81 
 
 		 543 aa  302  9e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.301435  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1971  AMP-binding domain protein  34.2 
 
 		 578 aa  302  1e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4723  AMP-binding domain protein  35.1 
 
 		 560 aa  302  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.712671  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3209  AMP-binding domain protein  35.32 
 
 		 546 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609491  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1241  acyl-CoA synthetase  35.75 
 
 		 572 aa  301  2e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  33.15 
 
 		 547 aa  301  2e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  36.38 
 
 		 540 aa  300  3e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1904  AMP-binding domain protein  34.75 
 
 		 573 aa  300  3e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  31.44 
 
 		 518 aa  300  4e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4437  AMP-binding domain protein  36.62 
 
 		 540 aa  300  5e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4524  AMP-binding domain protein  36.62 
 
 		 540 aa  300  5e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2821  AMP-binding domain protein  34.82 
 
 		 552 aa  299  6e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.187557 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3403  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  36.18 
 
 		 579 aa  299  8e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2646  AMP-binding domain protein  33.52 
 
 		 570 aa  299  1e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2721  AMP-binding domain protein  33.52 
 
 		 570 aa  299  1e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.443793  normal  0.43387 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>